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[發明專利]桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori的核糖體RNA序列及其應用有效

專利信息
申請號: 201710064070.7 申請日: 2017-01-24
公開(公告)號: CN106801053B 公開(公告)日: 2020-04-14
發明(設計)人: 劉吉平;劉希 申請(專利權)人: 華南農業大學
主分類號: C12N15/11 分類號: C12N15/11;C12Q1/6895
代理公司: 廣州粵高專利商標代理有限公司 44102 代理人: 任重
地址: 510642 廣*** 國省代碼: 廣東;44
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摘要:
搜索關鍵詞: 桑樹 白粉病 病原菌 phyllactinia mori 核糖體 rna 序列 及其 應用
【說明書】:

發明首次公開了一種桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori的核糖體RNA的全長cDNA序列及其應用。Phyllactinia mori的核糖體RNA的全長cDNA序列如如SEQ.ID.NO1所示,其序列上包含的2對引物序列如SEQ.ID.NO2~5所示。本發明將Phyllactinia mori的核糖體RNA的cDNA序列應用于檢測Phyllactinia mori菌中,可同時得到定性及定量的結果。結果顯示,在對桑樹白粉病病葉上真菌的研究中,相對豐度最高真菌的為Phyllactinia屬病原菌。此外,Phyllactinia mori的核糖體RNA的cDNA序列可應用于真菌種屬分類方面的研究中。

技術領域

本發明涉及生物技術領域,特別涉及一種桑樹白粉病病原Phyllactinia mori的核糖體RNA序列及其應用。

背景技術

現有的真菌研究方法中,常常通過核糖體DNA(ribosome DNA,rDNA)序列進行測序比對用于真菌的鑒定。核糖體在細胞中具有重要功能,rDNA編碼的基因許多都與蛋白質合成的反應過程密切相關,在蛋白質的生物合成中起決定作用。rDNA序列分為轉錄區和非轉錄區,轉錄區由編碼核糖體5.8S、18S、28S蛋白結構的基因和基因間的2個轉錄間隔區(Internal Tanscribed Spacer,ITS)ITS1、和ITS2組成,共同組成一個轉錄單位。

rDNA中編碼5.8S、18S、28S的rDNA序列較為保守,可以用于分析自然界物種分類的科間或更高級階元間的血系研究的分子標記。由于5.8SrDNA序列短、且高度保守,難以用于真菌的系統發育和分子鑒定;而18SrDNA的片段較長,片段中存在保守區和可變區,因此,現有研究中,通過選擇不同的特異性擴增引物將某一結構域片段擴增后,經過測序以及對測序結果的分析比對,可用于真菌目、科、屬等分類階元的研究。但是,基于5.8S、18S、28S的rDNA序列難以對真菌種屬的分類進行研究,不能確定病原真菌的種屬,因此,需要利用rRNA的全長序列來進行研究。

發明內容

本發明的要解決的技術問題是彌補現有技術的空白,提供一種桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori的核糖體RNA的全長cDNA序列。

本發明的另一個目的在于提供桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori的核糖體RNA序列在定量檢測桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori的應用。

本發明的再一目的在于提供桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori的核糖體RNA序列在定量檢測桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori應用的方法。

本發明的還一個目的在于提供桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori的核糖體RNA序列在真菌種屬分類方面的應用。

本發明的目的通過以下技術方案予以實現:

本發明提供了一種桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori核糖體RNA的全長cDNA序列,如SEQ.ID.NO1所示。

所述核糖體RNA的全長cDNA序列中包含2對引物序列,所述引物序列分別如SEQ.ID.NO2~SEQ.ID.NO5所示。

本發明還提供了所述桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori核糖體RNA的cDNA序列在定量檢測桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori的應用。

本發明還提供了所述桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori核糖體RNA的cDNA序列在定量檢測桑樹白粉病病原菌Phyllactinia mori應用的方法,包括以下步驟:

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