[發明專利]用于檢測豬薩姆氏后圓線蟲的特異性引物及其應用在審
| 申請號: | 201710061756.0 | 申請日: | 2017-01-26 |
| 公開(公告)號: | CN106591481A | 公開(公告)日: | 2017-04-26 |
| 發明(設計)人: | 劉偉;劉雪松;譚磊;尹德明 | 申請(專利權)人: | 湖南農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 長沙朕揚知識產權代理事務所(普通合伙)43213 | 代理人: | 鄧宇 |
| 地址: | 410128 *** | 國省代碼: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 檢測 薩姆 氏后圓 線蟲 特異性 引物 及其 應用 | ||
1.一種可用于檢測豬薩姆氏后圓線蟲的特異性引物,其特征在于,所述特異性引物包括上游引物MsJB3 F和下游引物MsJB4.5 R,
所述Ms JB3 F的核苷酸序列為5'-GAAAGAATTCATGAATTCAAAATT-3';
所述Ms JB4.5 R的核苷酸序列為5'-GAAATTYATATTGTATTTAATTTTTG-3'。
2.一種可用于檢測豬薩姆氏后圓線蟲的檢測試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒包括用于對樣品DNA進行裂解的DNA裂解液、對樣品DNA進行擴增的PCR反應液、以及引物混合液,所述引物混合液包括如權利要求1所述的特異性引物。
3.根據權利要求2所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒還包括陽性對照液,所述陽性對照液包括豬薩姆氏后圓線蟲DNA。
4.根據權利要求2所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述DNA裂解液主要由100mM NaCl70μl、pH值為8.0的10mM Tris-Cl30μl、pH值為8.0的25mM EDTA150μl、1%W/V十二烷基硫酸鈉30μl和1.7μg/μL蛋白酶K200μl組成。
5.根據權利要求2所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述PCR反應液包括PCR緩沖液、25mM MgCl2溶液和2.0mM脫氧核糖核苷酸溶液。
6.根據權利要求2所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述引物混合液中,所述MsJB3F和MsJB4.5R的濃度均為100pmol/μL。
7.一種如權利要求1所述的特異性引物在檢測豬薩姆氏后圓線蟲的應用。
8.一種如權利要求7所述的應用,其特征在于,利用所述特異性引物制成檢測試劑盒,所述檢測試劑盒包括用于對樣品DNA進行裂解的DNA裂解液、對樣品DNA進行擴增的PCR反應液、以及引物混合液,所述引物混合液包括所述特異性引物,所述檢測試劑盒的使用方法包括以下步驟:
(1)DNA的提取:取待測蟲體樣品用雙蒸水反復吹打沖洗,移去雙蒸水,加入DNA裂解液置于37~55℃溫箱中16-18h,再提取DNA,制備得到樣品DNA;
(2)PCR擴增:取滅菌ddH2O、PCR反應液、Taq酶和引物混合液按適合的PCR反應體系加入離心管中,混勻后分裝放入多個離心管中制得多份分裝液,取步驟(1)制備的樣品DNA,每一樣品DNA對應加入一份分裝液中并標號,混勻,置于PCR擴增儀上按適合的PCR擴增條件反應,制得PCR擴增產物;
(3)PCR產物觀察:取步驟(2)制備的PCR擴增產物依標號加樣于1.0%瓊脂糖凝膠上,120~130V電壓電泳20~40分鐘后,置于紫外透射儀下觀察是否出現條帶,若存在400bp~410bp大小的條帶,則待測蟲體樣品為豬薩姆氏后圓線蟲;若不存在400bp~410bp大小的條帶,則待檢測蟲體樣品不是豬薩姆氏后圓線蟲。
9.根據權利要求8所述的應用,其特征在于,所述步驟(2)中PCR反應體系為緩沖液2~3μL、25mM的MgCl2溶液3~4μL、2.0mM脫氧核糖核苷酸溶液2μL、5U/μL的Taq酶0.25~0.3μL、樣品DNA 0.8~1μL、引物混合液0.8~1.2μL,余量為ddH2O補至25μL。
10.根據權利要求8所述的應用,其特征在于,所述步驟(2)中PCR擴增條件為:94℃預變性5min;94℃變性30sec、52~58℃退火30sec、72℃延伸30sec,共38個循環;72℃延伸5min。
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