[發明專利]糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記及應用

有效

• 申請號: 201710059366.X
• 申請日: 2017-01-24
• 公開（公告）號: CN106636432B
• 公開（公告）日: 2020-05-12
• 發明（設計）人: 郝德榮;陳國清;薛林;張振良;陸虎華;冒宇翔;石明亮;胡加如;周廣飛;黃小蘭;趙浚宇
• 申請（專利權）人: 江蘇沿江地區農業科學研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 上海唯源專利代理有限公司 31229
• 代理人: 曾耀先

1.一種糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記，其特征在于，所述的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記特異性檢測玉米SNP位點PZE-104141018和玉米SNP位點PZE-104141424，所述的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記包括第一分子標記和第二分子標記，所述第一分子標記特異性檢測所述玉米SNP位點PZE-104141018，所述第二分子標記特異性檢測所述玉米SNP位點PZE-104141424，所述第一分子標記是第一CAPS分子標記，所述第一CAPS分子標記包括SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的第一引物對，所述第二分子標記是第二CAPS分子標記，所述第二CAPS分子標記包括SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的第二引物對。

2.一種利用分子標記檢測糯玉米淀粉峰值黏度高低的方法，其特征在于，包括以下步驟：

(1)提取待測糯玉米的基因組DNA；

(2)采用根據權利要求1所述的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記對所述基因組DNA進行檢測；

(3)當檢測到所述玉米SNP位點PZE-104141018為G且檢測到所述玉米SNP位點PZE-104141424為A時，所述待測糯玉米為淀粉高峰值黏度糯玉米，否則，所述待測糯玉米為淀粉低峰值黏度糯玉米。

3.如權利要求2所述的利用分子標記檢測糯玉米淀粉峰值黏度高低的方法，其特征在于，在所述步驟(2)中，采用根據權利要求1所述的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記對所述基因組DNA進行檢測的步驟具體包括：

(21)對所述基因組DNA采用所述第一引物對進行PCR擴增獲得第一擴增產物，采用EaeI酶切所述第一擴增產物；

(22)對所述基因組DNA采用所述第二引物對進行PCR擴增獲得第二擴增產物，采用HinfI酶切所述第二擴增產物，

在所述步驟(3)中，若所述第一擴增產物酶切得到196bp和65bp的產物則表明檢測到所述玉米SNP位點PZE-104141018為G，若所述第二擴增產物酶切得到132bp和40bp的產物則表明檢測到所述玉米SNP位點PZE-104141424為A。

4.一種利用分子標記輔助淀粉高峰值黏度糯玉米育種的方法，其特征在于，包括以下步驟：

(A)提取待測糯玉米的基因組DNA；

(B)采用根據權利要求1所述的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記對所述基因組DNA進行檢測；

(C)當檢測到所述玉米SNP位點PZE-104141018為G且檢測到所述玉米SNP位點PZE-104141424為A時，所述待測糯玉米為淀粉高峰值黏度糯玉米，將所述淀粉高峰值黏度糯玉米應用于糯玉米品質育種。

5.如權利要求4所述的利用分子標記輔助淀粉高峰值黏度糯玉米育種的方法，其特征在于，在所述步驟(B)中，采用根據權利要求1所述的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記對所述基因組DNA進行檢測的步驟具體包括：

(B1)對所述基因組DNA采用所述第一引物對進行PCR擴增獲得第一擴增產物，采用EaeI酶切所述第一擴增產物；

(B2)對所述基因組DNA采用所述第二引物對進行PCR擴增獲得第二擴增產物，采用HinfI酶切所述第二擴增產物，

在所述步驟(C)中，若所述第一擴增產物酶切得到196bp和65bp的產物則表明檢測到所述玉米SNP位點PZE-104141018為G，若所述第二擴增產物酶切得到132bp和40bp的產物則表明檢測到所述玉米SNP位點PZE-104141424為A。

6.根據權利要求1所述的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記在檢測糯玉米淀粉峰值黏度的高低中的應用。

7.根據權利要求1所述的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記在對糯玉米的淀粉峰值黏度的高低進行選擇中的應用。

8.根據權利要求1所述的糯玉米淀粉峰值黏度主效QTL位點的分子標記在淀粉高峰值黏度糯玉米的分子標記輔助育種中的應用。