[發明專利]一種可視化標記基因組位點的方法

有效

• 申請號: 201710047040.5
• 申請日: 2017-01-22
• 公開（公告）號: CN106800602B
• 公開（公告）日: 2020-05-01
• 發明（設計）人: 劉光慧;曲靜;任若通;鄧麗萍
• 申請（專利權）人: 中國科學院生物物理研究所
• 主分類號: C07K19/00
• 分類號: C07K19/00;C12N15/62;C12N15/85;C12N15/65
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢;白艷

1.一種用于可視化標記基因組位點的試劑盒，為如下1）-8）中任一種：

1）包括融合蛋白，所述融合蛋白包括用于識別或結合基因組靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE和硫氧還蛋白TRX；

2）包括融合蛋白，所述融合蛋白包括用于識別或結合基因組靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE、熒光蛋白和硫氧還蛋白TRX；

3）包括蛋白組合物，所述蛋白組合物包括用于識別或結合基因組靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE和硫氧還蛋白TRX；

4）包括蛋白組合物，所述蛋白組合物包括用于識別或結合基因組靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE、熒光蛋白和硫氧還蛋白TRX；

5）編碼所述融合蛋白的DNA分子；

6）編碼所述蛋白組合物的DNA分子；

7）包括表達1）或2）所述融合蛋白的載體；

8）包括表達3）或4）所述蛋白組合物的載體。

2.根據權利要求1所述的試劑盒，其特征在于：

所述靶序列為端粒DNA、著絲粒DNA、核仁組織區核糖體RNA編碼基因或MUC4蛋白編碼基因；

或所述端粒DNA的靶序列為序列14；

或所述著絲粒DNA的靶序列為序列15；

或所述核仁組織區核糖體RNA編碼基因的靶序列為序列16；

或所述MUC4蛋白編碼基因的靶序列為序列17。

3.根據權利要求2所述的試劑盒，其特征在于：

用于識別或結合基因組中所述端粒DNA的靶序列的融合蛋白為a1）或a2）；

a1）由核定位序列、用于識別或結合基因組中端粒DNA的靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE和硫氧還蛋白TRX融合得到的蛋白質；

a2）由核定位序列、用于識別或結合基因組中端粒DNA的靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE、熒光蛋白和硫氧還蛋白TRX融合得到的蛋白質；

或用于識別或結合基因組中所述著絲粒DNA的靶序列的融合蛋白為a3）或a4）；

a3）由核定位序列、用于識別或結合基因組中著絲粒DNA的靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE和硫氧還蛋白TRX融合得到的蛋白質；

a4）由核定位序列、用于識別或結合基因組中著絲粒DNA的靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE、熒光蛋白和硫氧還蛋白TRX融合得到的蛋白質；

或用于識別或結合基因組中所述核仁組織區核糖體RNA編碼基因的靶序列的融合蛋白由核定位序列、用于識別或結合基因組中核仁組織區核糖體RNA編碼基因的靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE、熒光蛋白和硫氧還蛋白TRX融合得到的蛋白質；

或用于識別或結合基因組中MUC4蛋白編碼基因的靶序列的融合蛋白由核定位序列、用于識別或結合基因組中MUC4蛋白編碼基因的靶序列的轉錄激活樣效應元件蛋白TALE、熒光蛋白和硫氧還蛋白TRX融合得到的蛋白質。

4.根據權利要求1-3中任一所述的試劑盒，其特征在于：

所述熒光蛋白為EGFP蛋白或mCherry蛋白；

a1）中所述融合蛋白的氨基酸序列為序列4；

a2）中所述融合蛋白的氨基酸序列為序列7；

a3）中所述融合蛋白的氨基酸序列為序列5；

a4）中所述融合蛋白的氨基酸序列為序列8；

用于識別或結合基因組中所述核仁組織區核糖體RNA編碼基因的靶序列的融合蛋白的氨基酸序列為序列10；

用于識別或結合基因組中所述MUC4蛋白編碼基因的靶序列的融合蛋白的氨基酸序列為序列12。

5.權利要求1-4中任一所述的試劑盒或權利要求1-4中任一所述的試劑盒中的融合蛋白或權利要求1-4中任一所述的試劑盒中的蛋白組合物在基因組可視化中的應用；所述應用為非疾病診斷和治療的應用；

或權利要求1-4中任一所述的試劑盒或權利要求1-4中任一所述的試劑盒中的融合蛋白或權利要求1-4中任一所述的試劑盒中的蛋白組合物在制備基因組可視化的產品中的應用。