[發明專利]癌癥相關的腫瘤特異轉錄本LIN28B-TST及其用途

有效

• 申請號: 201710035081.2
• 申請日: 2017-01-17
• 公開（公告）號: CN108329387B
• 公開（公告）日: 2021-07-27
• 發明（設計）人: 黃勝林;何祥火;李焱;郭維杰;胡治祥;包怡超;鄭秋鵬;呂洞賓
• 申請（專利權）人: 復旦大學附屬腫瘤醫院
• 主分類號: C07K14/47
• 分類號: C07K14/47;C12N15/12;C12P21/02;C12Q1/6886;A61K45/00;A61P35/00;G01N33/68;G01N33/574
• 代理公司: 上海容慧專利代理事務所(普通合伙) 31287
• 代理人: 于曉菁

本發明提供了癌癥相關的腫瘤特異轉錄本LIN28B?TST及其用途，具體地，本發明提供的LIN28B?TST可在多種腫瘤組織中表達，在某些腫瘤組織中高表達，但在正常分化組織和胚胎組織中均不表達，并且可在體外、體內能夠明顯促進腫瘤細胞的生長和增殖、促進腫瘤的發生。

技術領域

本發明涉及腫瘤治療領域。具體地，涉及癌癥相關的腫瘤特異轉錄本LIN28B-TST及其用途。

背景技術

深度RNA測序已經從一個嶄新的視角展現了人類轉錄組的特性和剪切方式的多樣性和復雜性。癌癥是一種具有異質性的復雜疾病，包含了遺傳學和表觀遺傳學層面的改變，使得它形成了更復雜的轉錄組。因此，癌癥的轉錄組有很大的潛能產生腫瘤特異轉錄本(Tumor-Specific Transcripts,TST)。腫瘤特異轉錄本的鑒定具有非常重要的臨床作用，腫瘤特異轉錄本的分類，例如融合轉錄本(fusion transcripts)對理解腫瘤的發生過程也有很重大的意義(融合轉錄本是腫瘤特異轉錄本的一種，來源于DNA的易位)。失去正常調控的轉錄過程和表觀遺傳學改變可能導致大量的腫瘤特異轉錄本，包括特異的mRNA和基因間的全新轉錄本。然而，這些特異轉錄本的鑒定和功能還尚未被完全闡明。

LIN28的蛋白家族，包括LIN28A和LIN28B，是一種在胚胎發生中高表達，但成年人組織中不表達的RNA結合蛋白。LIN28蛋白可以阻止腫瘤抑制因子let-7家族RNA(一種微小RNA)的成熟，并調控哺乳動物干細胞的自我更新。然而，引起LIN28B基因激活的機制在此之前并未被闡明。

因此，本領域迫切需要研究LIN28B基因在癌癥中激活的全新機制，并開發與腫瘤生長和增殖相關的蛋白，以及治療腫瘤的靶點藥物。

發明內容

本發明的目的就是提供一種與腫瘤易感性和/或預后有關的新靶點LIN28B-TST及其診斷、治療等方面的應用。

本發明的第一方面提供了一種分離的LIN28B-TST多肽，所述多肽選自下組：

(a)具有SEQ ID NO:1氨基酸序列的多肽；

(b)將SEQ ID NO:1氨基酸序列經過一個或多個氨基酸殘基(較佳地，1-30個，更佳地，1-15個，更佳地，1-6個)的取代、缺失或添加而形成的，且具有SEQ ID NO:1中第1-22位所示的22個氨基酸的氨基酸序列、具有腫瘤細胞特異性表達，并且具有促進腫瘤細胞的生長和增殖、促進腫瘤發生的活性的由(a)衍生的多肽；

(c)與SEQ ID NO:1氨基酸序列有≥80％同源性(優選地，≥90％的同源性；優選地≥95％的同源性；最優選地，≥97％的同源性，如98％以上，99％以上)，且具有SEQ ID NO:1中第1-22位所示的22個氨基酸的氨基酸序列、具有腫瘤細胞特異性表達、并且具有促進腫瘤細胞的生長和增殖、促進腫瘤發生的活性的由(a)衍生的多肽。

在另一優選例中，所述多肽的氨基酸序列如SEQ ID NO.:1所示。

在另一優選例中，所述多肽來自于哺乳動物，較佳地，人、大鼠、小鼠，優選，人。

在另一優選例中，所述多肽將LIN28B-WT(SEQ ID NO.:3)N端的一個或多個(較佳地，3個)氨基酸替換為SEQ ID NO:1中第1-22位所示的22個氨基酸構成的氨基酸序列。

本發明第二方面提供了一種分離的多核苷酸，所述多核苷酸編碼本發明第一方面所述的多肽。

在另一優選例中，所述多核苷酸選自下組：DNA序列、RNA序列。

在另一優選例中，所述DNA序列選自下組：基因組序列、cDNA序列。

在另一優選例中，所述的多核苷酸為mRNA或cDNA。