[發明專利]三官能交聯試劑

有效

• 申請號: 201680071444.1
• 申請日: 2016-11-09
• 公開（公告）號: CN108368051B
• 公開（公告）日: 2021-05-25
• 發明（設計）人: 埃里克·莫蘭·卡雷拉;邁克爾·安德烈亞斯·沙夫羅特;娜丁·索博茨基;貝恩德·沃爾沙伊德
• 申請（專利權）人: ETH蘇黎世公司
• 主分類號: C07D213/81
• 分類號: C07D213/81;C07C243/18;C07C247/10;C07C247/12;C07D207/50;G01N33/58
• 代理公司: 成都超凡明遠知識產權代理有限公司 51258
• 代理人: 魏彥

1.一種式(Ic)的化合物：

2.根據權利要求1所述的式(Ic)的化合物用于表征和分析配體和靶標之間相互作用的用途，所述靶標選自糖蛋白受體的組。

3.根據權利要求2所述的用途，其中

·所述靶糖蛋白受體是細胞表面或分泌的糖蛋白受體；和/或

·配體是選自由蛋白質、肽、小分子和病毒組成的組的孤兒配體。

4.根據權利要求3所述的用途，其中所述小分子為藥物。

5.鑒定配體(II)與樣品中靶標(III)之間特異性相互作用的方法，其中

·所述靶標(III)是糖蛋白受體；以及

·所述配體(II)識別在所述靶標(III)上的配體特異性結構域；

其特征在于

形成靶標-配體-試劑復合物(VI)，所述復合物(VI)包括根據權利要求1所述的式(Ic)的化合物、配體(II)和靶標(III)，其中，配體(II)與所述式(Ic)的化合物的羥基琥珀酰亞胺酯基團共價結合，并且靶標(III)與所述式(Ic)的化合物中存在的腙基團共價結合。

6.根據權利要求5所述的方法，所述方法包括以下步驟：

i)提供包含所述靶標(III)的樣品，

ii)使所述靶標(III)經歷氧化處理以在至少一個碳水化合物殘基上產生醛官能，從而獲得氧化的靶標(IV)，

iii)提供根據權利要求1所述的式(Ic)的化合物，并且允許其羥基琥珀酰亞胺酯基團與所述配體(II)綴合以獲得配體-試劑復合物(V)，

iv)在(a)所述復合物(V)能夠結合所述氧化的靶標(IV)上的配體特異性結構域并且(b)所述復合物(V)的所述腙基團((CH₃)₂C＝N-NH-)被轉化為其游離形式并允許共價結合所述氧化的碳水化合物靶標(IV)的條件下，使步驟(ii)的所述樣品與步驟(iii)的復合物(V)接觸，以獲得包括共價結合配體和共價結合靶標的靶標-配體-試劑復合物(VI)，

v)裂解步驟(iv)的所述樣品使得膜嵌入的細胞表面蛋白以及所述復合物(VI)可用并且與基質(VII)反應，以獲得基質結合復合物(VIII)，

vi)通過使用親和性基質(VII)從所述樣品中富集所述復合物，以獲得基質結合復合物(VIII)，

vii)消化所述基質結合復合物(VIII)以獲得(a)釋放的肽(IX)和(b)結合在基質(X)上的糖肽，

viii)從所述基質(X)中釋放結合的糖肽以獲得釋放的糖肽(XI)，

ix)分析并定量所述釋放的肽(IX)、(XI)，以及

x)鑒定所述配體與所述靶糖蛋白受體之間的所述相互作用。

7.根據權利要求6所述的方法，其中，所述分析并定量所述釋放的肽(IX)、(XI)是通過高質量精度質譜實現的。

8.根據權利要求6所述的方法，其中，所述鑒定所述配體與所述靶糖蛋白受體之間的所述相互作用是通過與對照反應的定量比較實現的。

9.根據權利要求5-8中的任一項所述的方法，其中，所述靶標(III)是在溶液中或是在細胞的表面上。