[發明專利]使用靶基因表達的數學建模評估NFkB細胞信號傳導途徑活性

有效

• 申請號: 201680056337.1
• 申請日: 2016-08-12
• 公開（公告）號: CN108138237B
• 公開（公告）日: 2022-04-05
• 發明（設計）人: H·J·范奧義任
• 申請（專利權）人: 皇家飛利浦有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G16B5/20;G16B40/00;G16B20/30
• 代理公司: 永新專利商標代理有限公司 72002
• 代理人: 王健;林曉紅

1.一種用于至少基于樣品中測得的NFκB細胞信號傳導途徑的六或更多個靶基因的表達水平來推斷NFκB細胞信號傳導途徑的活性的裝置，其中所述裝置包括：

確定或接受所述樣品中NFκB轉錄因子(TF)元件的水平的模塊，所述NFκB TF元件控制所述NFκB細胞信號傳導途徑的六或更多個靶基因的轉錄，所述確定至少部分基于評估將所述NFκB細胞信號傳導途徑的六或更多個靶基因的表達水平與所述NFκB TF元件的水平相關的數學模型，其中所述六或更多個靶基因選自如下一組：CCL5，CXCL2，ICAM1，IL6，IL8，NFKBIA和TNFAIP2；以及

基于所確定的樣品中的NFκB TF元件的水平推斷NFκB細胞信號傳導途徑的活性的模塊；

其中所述推斷由數字處理設備使用所述數學模型進行。

2.權利要求1的裝置，進一步包括：

基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性，確定NFκB細胞信號傳導途徑是否異常運行的模塊。

3.權利要求2的裝置，進一步包括：

建議處方一種糾正NFκB細胞信號傳導途徑異常運行的藥物的模塊，

其中只有在基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性確定NFκB細胞信號傳導途徑異常運行時才進行所述建議。

4.權利要求1-3任一項的裝置，其中所述裝置用于至少一種如下活動：

基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性進行診斷；

基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性進行預后；

基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性進行藥物處方；

基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性進行藥物功效預測；

基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性進行副作用預測；

監測藥物功效；

開發藥物；

開發測定法；

路徑研究；

癌癥分期；

基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性進行臨床試驗招募；

選擇要進行的后續測試；以及

選擇伴隨診斷測試。

5.權利要求1-4任一項的裝置，其中所述數學模型是概率模型，所述概率模型至少部分基于將所述NFκB TF元件和在樣品中所測得的NFκB細胞信號傳導途徑的六或更多個靶基因的表達水平相關的條件概率，或者其中所述數學模型至少部分基于在樣品中所測得的NFκB細胞信號傳導途徑的六或更多個靶基因的表達水平的一或多種線性組合。

6.權利要求5的裝置，其中所述數學模型是貝葉斯網絡模型。

7.一種包括數字處理器的裝置，所述數字處理器被配置為執行一種方法，所述方法包括：

至少基于樣品中測得的NFκB細胞信號傳導途徑的六或更多個靶基因的表達水平來推斷NFκB細胞信號傳導途徑的活性，其中所述推斷包括：

確定所述樣品中NFκB轉錄因子(TF)元件的水平，所述NFκB TF元件控制所述NFκB細胞信號傳導途徑的六或更多個靶基因的轉錄，所述確定至少部分基于評估將所述NFκB細胞信號傳導途徑的六或更多個靶基因的表達水平與所述NFκB TF元件的水平相關的數學模型，其中所述六或更多個靶基因選自如下一組：CCL5，CXCL2，ICAM1，IL6，IL8，NFKBIA和TNFAIP2；以及

基于所確定的樣品中的NFκB TF元件的水平推斷NFκB細胞信號傳導途徑的活性；

其中所述推斷由數字處理設備使用所述數學模型進行。

8.權利要求7的裝置，其中所述方法進一步包括：

基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性，確定NFκB細胞信號傳導途徑是否異常運行。

9.權利要求8的裝置，其中所述方法進一步包括：建議處方一種糾正NFκB細胞信號傳導途徑異常運行的藥物，其中只有在基于推斷的NFκB細胞信號傳導途徑的活性確定NFκB細胞信號傳導途徑異常運行時才進行所述建議。