[發明專利]用于快速檢測沙門氏菌血清變種D1的組合物和方法

在審

• 申請號: 201680053057.5
• 申請日: 2016-07-08
• 公開（公告）號: CN108137645A
• 公開（公告）日: 2018-06-08
• 發明（設計）人: V·杜塔;B·O·帕克;L·E·彼得斯;T·奎雷特
• 申請（專利權）人: 一龍公司
• 主分類號: C07K1/00
• 分類號: C07K1/00;C07K14/00;C07K14/005
• 代理公司: 上海專利商標事務所有限公司 31100
• 代理人: 陶家蓉;陶啟長

本發明特征在于用于檢測沙門氏菌(例如，在食品，環境樣品，生物樣品或其他材料中)的快速和準確的方法。

相關申請的交叉引用

本申請要求2015年7月20日提交的美國專利臨時申請62/194,640號的優先權。本申請的全部內容通過引用納入本文。

背景技術

沙門氏菌是全世界食物攜帶疾病最常見的病原體之一。它引起人類和動物的大量感染。事實上，每年沙門氏菌導致全世界約9380萬人感染和155,000人死亡。沙門氏菌感染與食用受動物或人糞便污染的食物，例如肉、蛋和新鮮農產品(produce)等有關。沙門氏菌病的主要原因是禽類和蛋。認識到防止沙門氏菌傳播的重要性，2014年美國FDA敦促美國科學家開發改進的沙門氏菌檢測方法。目前用于檢測食品中沙門氏菌的方法困難，昂貴和耗時。迫切需要快速準確的檢測方法，以防止受沙門氏菌污染的食品進入動物或人類食物鏈。

發明內容

如下所述，本發明特征在于用于檢測沙門氏菌(例如，在食品，環境樣品，生物樣品或其他材料中)的快速和準確的方法。

在一個方面，本發明的特征在于檢測樣品中的沙門氏菌的方法。該方法涉及使樣品在存在切口酶，dNTP，可檢測探針和聚合酶的情況下與正向和反向引物接觸，所述正向和反向引物在允許核酸分子等溫擴增的條件下與沙門氏菌核酸分子特異性結合，和檢測樣品中沙門氏菌的擴增子，其中所述方法檢測以下靶序列：

5’–TATTGCAGGTAAAGGGGCTTCGGTATCTGGTGGTGTAGCCACTGT-3’。

在另一個方面，本發明的特征在于用于檢測樣品中的沙門氏菌的方法。該方法涉及在存在Nt.BstNBI(NEB公司)切口酶，dNTP，Bst DNA聚合酶I和具有以下序列的可檢測探針的情況下：

5’CGCTCCACCAGATACCGAAGCG 3’，將樣品與分別具有以下序列的正向和反向引物接觸：

5’GACTCGATATCGAGTCTATCTATTGCAGGTAmAmAmGmGmG 3’

5’GACTCGATATCGAGTCCGGGACAGTGGCTmAmCmAmCmC 3’；和

檢測是否存在沙門氏菌擴增子，其中沙門氏菌擴增子的存在鑒定樣品中的沙門氏菌。

在另一方面，本發明的特征在于引物，其選自以下正向引物

5’-GACTCGATATCGAGTCATCTATTGCAGGTAAmAmGmGmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCATCTATTGCAGGTAmAmAmGmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCTATCTATTGCAGGTAmAmAmGmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCGTATCTATTGCAGGTmAmAmGmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCAGTATCTATTGCAGGTmAmAmAmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCGTATCTATTGCAGGTAmAmAmGmGmG-3’

和反向引物：

5’-GACTCGATATCGAGTCGGACAGTGGCTACAmCmCmAmCmC-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCGGGACAGTGGCTACAmCmCmAmCmC-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCCGGGACAGTGGCTACmAmCmCmAmC-3’