[發明專利]前列腺癌預后的方法

有效

• 申請號: 201680031601.6
• 申請日: 2016-05-26
• 公開（公告）號: CN107743524B
• 公開（公告）日: 2022-10-28
• 發明（設計）人: R·霍夫曼;E·德恩比耶贊-蒂默曼斯;D·A·M·W·范斯特里普;A·G·C·范布魯塞爾;M·阿爾維斯德因達;J·費羅貝爾
• 申請（專利權）人: 皇家飛利浦有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 永新專利商標代理有限公司 72002
• 代理人: 王英;劉炳勝

1.一種用于對對象進行分類的裝置，包括：

-用于基于針對所述對象的對象表達譜將所述對象分類為具有良好預后或不良預后的單元，其中，所述對象表達譜包括以下簽名基因的基因表達水平：AZGP1、FBLN1、ILK、KRT15、MEIS2、MYBPC1、PAGE4、SRD5A2、COL1A1、COL3A1、COL5A2、INHBA、THBS2、VCAN、BGN、BIRC5和DYRK2、以及任選地包括PDE4D5和/或PDE4D7的PDE4異構體，并且其中，良好預后預測在初始診斷之后的預定時段內生存的可能性增加和/或在初級處置之后疾病沒有進展，而不良預后預測在初始診斷之后的預定時段內的侵襲性疾病、生存的可能性降低、以及生化復發的可能性增加、臨床復發的可能性增加、和/或存在局部或遠處轉移的可能性增加；和/或

-用于基于針對所述對象的對象表達譜將所述對象分類為具有或不具有易遭受疾病進展影響的前列腺癌的傾向的單元，其中，所述對象表達譜包括以下簽名基因的基因表達水平：AZGP1、FBLN1、ILK、KRT15、MEIS2、MYBPC1、PAGE4、SRD5A2、COL1A1、COL3A1、COL5A2、INHBA、THBS2、VCAN、BGN、BIRC5和DYRK2、以及任選地包括PDE4D5和/或PDE4D7的PDE4異構體，其中，所述傾向預測在初始診斷之后的預定時段內的侵襲性疾病、生存的可能性降低、生化復發的可能性增加、臨床復發的可能性增加、和/或存在局部或遠處轉移的可能性增加，

其中，所述對象表達譜被轉換為前列腺癌進展指數，所述前列腺癌進展指數是根據以下等式來計算的：

PCPI＝(GEV_av_GOI_up)-(GEV_av_GOI_down)，其中GEV_av_GOI_up是上調基因的平均基因表達值并且GEV_av_GOI_down是下調基因的平均基因表達值，其中所述值是基于每個對象樣本的標準化基因表達數據來確定的，

其中，所述表達水平是基因轉錄物水平并且所述簽名基因的基因表達水平標準化為持家基因的表達，

其中，如果所述前列腺癌進展指數低于選定的閾值，則所述對象被分類為具有良好預后，或者如果所述前列腺癌進展指數高于所述選定的閾值，則所述對象被分類為具有不良預后；和/或

其中，如果所述前列腺癌進展指數高于選定的閾值，則所述對象被分類為具有易遭受疾病進展影響的前列腺癌的傾向，或者如果所述前列腺癌進展指數低于所述選定的閾值，則所述對象被分類為不具有易遭受疾病進展影響的前列腺癌的傾向。

2.根據權利要求1所述的裝置，還包括用于確定或接收針對以下簽名基因的基因表達水平：AZGP1、FBLN1、ILK、KRT15、MEIS2、MYBPC1、PAGE4、SRD5A2、COL1A1、COL3A1、COL5A2、INHBA、THBS2、VCAN、BGN、BIRC5和DYRK2、以及任選地包括PDE4D5和/或PDE4D7的PDE4異構體，以獲得針對所述對象的對象表達譜的單元。

3.根據權利要求1所述的裝置，其中，所述持家基因是TBP、HPRT1、ACTB、RPLP0、PUM1、POLR2A或B2M。

4.根據權利要求1或2所述的裝置，還包括：

用于根據所確定的預后或所確定的傾向，針對侵襲性疾病與非侵襲性疾病的風險對所述對象進行分級的單元；和/或

用于根據所確定的預后或所確定的傾向，向有需要的所述對象提供適合的癌癥處置的單元。

5.根據權利要求1或2所述的裝置，其中，所述不良預后或者易遭受疾病進展影響的前列腺癌的所述傾向指示要利用選自包括以下項的組的處置中的任何一種或多種處置來處置所述對象的適用性：前列腺手術、前列腺移除、化學療法、放射療法、近距離放射療法、有限或擴展的淋巴結清除、激素治療。