[發明專利]個性化的基于遞送載體的免疫療法及其用途

在審

• 申請號: 201680030603.3
• 申請日: 2016-05-26
• 公開（公告）號: CN107847611A
• 公開（公告）日: 2018-03-27
• 發明（設計）人: R·珀蒂;K·佩里;麥可·F·賓矽歐塔;D·J·奧康納
• 申請（專利權）人: 阿德瓦希斯公司
• 主分類號: A61K48/00
• 分類號: A61K48/00;A61K38/16;C07K14/195;C12N15/74
• 代理公司: 北京市君合律師事務所11517
• 代理人: 趙昊,孫倩

1.一種用于針對具有疾病或病癥的受試者形成個性化免疫療法的方法，所述方法包括以下步驟：

(a)將從來自所述受試者的患有疾病生物樣品中提取的核酸序列中的一個或多個開放閱讀框(ORF)與從健康生物樣品中提取的核酸序列中的一個或多個ORF相比較，其中所述比較鑒定編碼一種或多種肽的一個或多個核酸序列，所述一種或多種肽包含在來自所述患有疾病樣品的所述一個或多個ORF內編碼的一個或多個新表位；

(b)用包含編碼含有步驟(a)中鑒定的所述一個或多個新表位的所述一種或多種肽的核酸序列的載體轉化減毒李斯特菌菌株；以及

(c)另選地，(i)儲存所述減毒重組李斯特菌菌株以在預定時間段施用于所述受試者，或者(ii)向所述受試者施用包含所述減毒重組李斯特菌菌株的組合物，其中所述施用引起針對所述疾病或病癥的個性化T細胞免疫應答的生成。

2.根據權利要求1所述的方法，其還包括：

(d)從所述受試者獲得包含來自步驟(c)中的所述T細胞免疫應答的T細胞克隆或T浸潤細胞的第二生物樣品并且表征包含由所述T細胞上的MHC I類或MHC II類分子結合的一個或多個免疫原性新表位的特異性肽；

(e)篩選并選擇編碼包含步驟(d)中鑒定的所述一個或多個免疫原性新表位的所述一種或多種肽的核酸構建體；

(f)用包含編碼含有所述一個或多個免疫原性新表位的所述一種或多種肽的核酸序列的載體轉化第二減毒重組李斯特菌菌株；以及

(g)另外地，(i)儲存所述第二減毒重組李斯特菌以在預定時間段時施用于所述受試者，或者(ii)向所述受試者施用包含所述第二減毒重組李斯特菌菌株的第二組合物。

3.根據任一項前述權利要求所述的方法，其中包含所述一個或多個新表位的所述一種或多種肽各自的長度是約5-50個氨基酸。

4.根據權利要求3所述的方法，其中包含所述一個或多個新表位的所述一種或多種肽各自的長度是約8-27個氨基酸。

5.根據任一項前述權利要求所述的方法，其中所述一個或多個新表位包括5-100個新表位。

6.根據權利要求5所述的方法，其中所述一個或多個新表位包括15-35個新表位、8-11個新表位或11-16個新表位。

7.根據任一項前述權利要求所述的方法，其中所述一個或多個新表位包括多個新表位，其中步驟(b)還包括隨機化包含所述多個新表位的所述一種或多種肽在步驟(b)的所述核酸序列內的順序的一次或多次迭代。

8.根據任一項前述權利要求所述的方法，其中所述方法被重復以形成多種減毒重組李斯特菌菌株，每種菌株包含一個或多個新表位的不同集合。

9.根據權利要求8所述的方法，其中所述多種減毒重組李斯特菌菌株包括5-10、10-15、15-20、10-20、20-30、30-40或40-50種減毒重組李斯特菌菌株。

10.根據權利要求8或9所述的方法，其中所述多種減毒重組李斯特菌菌株的組合包含約5-10、10-15、15-20、10-20、20-30、30-40、40-50、50-60、60-70、70-80、80-90、90-100或100-200個新表位。

11.根據任一項前述權利要求所述的方法，其中步驟(a)中的所述比較包括使用篩選測定或篩選工具和相關數字軟件，以用于比較從所述患有疾病生物樣品中提取的所述核酸序列中的所述一個或多個ORF與從所述健康生物樣品中提取的所述核酸序列中的所述一個或多個ORF，

其中所述相關數字軟件包括訪問序列數據庫，所述序列數據庫允許篩選從所述患有疾病生物樣品中提取的所述核酸序列中的所述ORF內的突變以用于鑒定所述新表位的免疫原性潛力。

12.根據任一項前述權利要求所述的方法，其中所述在步驟(d)中從所述受試者獲得第二生物樣品的方法包括獲得包含在施用包含所述減毒重組李斯特菌菌株的所述第二組合物之后擴增的T細胞克隆或T浸潤細胞的生物樣品。

13.根據權利要求12所述的方法，其中所述患有疾病生物樣品是組織、細胞、血液或血清。