[發明專利]用于純染料儀器歸一化的方法和系統

有效

• 申請號: 201680009020.2
• 申請日: 2016-02-05
• 公開（公告）號: CN107466365B
• 公開（公告）日: 2020-06-19
• 發明（設計）人: J·馬克斯
• 申請（專利權）人: 生命技術公司
• 主分類號: G01N21/27
• 分類號: G01N21/27;G01N21/64
• 代理公司: 北京派特恩知識產權代理有限公司 11270
• 代理人: 康艷青;姚開麗

本教導內容涉及一種方法和系統，用于在多臺儀器上歸一化光譜。該方法(800)包括至少一臺參比儀器和一臺測試儀器。每臺儀器包括至少一個激發濾光器和至少一個成對布置的發射濾光器。每臺儀器進一步包括一塊包含多個孔的純染料板。每個孔含有多種染料，其中每種染料包含一種熒光組分。通過多種濾光器組合從每臺儀器采集每種染料的熒光光譜(805、820)，用以構成參比儀器的純染料矩陣Mref和測試儀器的純染料矩陣M。然后可以將純染料光譜乘以每個濾光器對的校正因子(840)，得出經過校正的純染料光譜，再進行歸一化(845)，即可提取多組分數據(850)。

背景技術

當前，基因組學分析，包括約30,000個人類基因的基因組學分析是基礎及應用生物化學和藥物研究的一個主要焦點。此類分析可能有助于開發多種疾病的診斷、藥物和療法。然而，人類基因組的復雜性和基因相互關聯的功能往往使得這項任務非常困難。研究人員通常面臨的一個難題是無法輕松比較在多臺儀器上運行所得的實驗結果。諸如光源、光學元件和熒光檢測器等部件的參數之物理變化例如可導致分析結果的變化，這種分析可能基于相同的生物樣本。因此，始終需要有助于最大程度減小所述部件之變化的方法和裝置。本教導內容描述了一種這樣的方法。

附圖

本領域技術人員將理解，本文描述的附圖僅供說明之用。所述附圖并不旨在以任何方式限制本教導內容的范圍。

圖1示出一個可在其上實現本教導內容實施例的計算機系統。

圖2示出一臺可在其上實現本教導內容實施例的實驗室儀器。

圖3示出根據本教導內容實施例的實際和估計歸一化因子。

圖4A示出本教導內容各種實施例中使用的染料混合物。

圖4B示出用于本教導內容的各種實施例的純染料和主通道濾光器組合。

圖5示出根據本教導內容的各種實施例歸一化前染料混合物的百分比偏差。

圖6示出根據本教導內容的各種實施例歸一化后染料混合物的百分比偏差。

圖7示出根據本教導內容的各種實施例歸一化后染料混合物的百分比偏差的近距離視圖。

圖8為示出根據本教導內容的各種實施例的歸一化處理的流程圖。

圖9示出根據本教導內容的各種實施例，歸一化前后測試儀器和參比儀器之間的相關性。

發明概述

本教導內容涉及用于在多臺儀器上歸一化光譜的方法和系統。在本發明的一個實施例中，該方法包括至少一臺參比儀器和一臺測試儀器。每臺儀器包括至少一個激發濾光器和至少一個成對布置的發射濾光器。每臺儀器進一步包括一塊包含多個孔的純染料板。每個孔含有多種染料，每種染料包含一種熒光組分。通過多種濾光器組合從每臺儀器采集每種染料的熒光光譜，用以構成參比儀器的純染料矩陣Mref和測試儀器的純染料矩陣M。然后可以將純染料光譜乘以每個濾光器對的校正因子，得出經過校正的純染料光譜，再進行歸一化，即可提取多組分數據。

在另一個實施例中，首先對來自參比儀器和測試儀器的熒光光譜進行歸一化，然后對多個孔進行平均，以構成純染料矩陣。

在另一個實施例中，將染料矩陣M乘以一組經過迭代修改的調整因子，以最大程度減小矩陣M和矩陣Mref之間的差異。

在另一個實施例中，調整因子在0到1之間改變。

在另一個實施例中，校正因子是發射濾光器因子和激發濾光器因子的乘積。

在另一個實施例中，校正后的純染料光譜歸一化為數值一。

在另一個實施例中，多組分數據源自熒光數據和染料矩陣M偽逆的乘積。