[發明專利]一種利用Genomic-SSR和EST-SSR兩類標記鑒評蝴蝶蘭遺傳多樣性的方法有效
| 申請號: | 201611248966.2 | 申請日: | 2016-12-29 |
| 公開(公告)號: | CN107058487B | 公開(公告)日: | 2019-01-15 |
| 發明(設計)人: | 李佐;肖文芳;陳和明;呂復兵 | 申請(專利權)人: | 廣東省農業科學院環境園藝研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州粵高專利商標代理有限公司 44102 | 代理人: | 單香杰 |
| 地址: | 510640 廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 遺傳多樣性 蝴蝶蘭 引物組合 植物種質資源 標記檢測 單一分子 種質 檢測 | ||
1.一種鑒評蝴蝶蘭遺傳多樣性的引物組合物,其特征在于,所述引物組合物由2對Genomic-SSR引物和8對EST-SSR引物組成,2對Genomic-SSR引物分別為G-1和G-2,G-1的序列如SEQ ID NO:1~2所示,G-2的序列如SEQ ID NO:3~4所示;8對EST-SSR引物分別為E-1、E-2、E-3、E-4、E-5、E-6、E-7、E-8,E-1的序列如SEQ ID NO:5~6所示,E-2的序列如SEQ IDNO:7~8所示,E-3的序列如SEQ ID NO:9~10所示,E-4的序列如SEQ ID NO:11~12所示,E-5的序列如SEQ ID NO:13~14所示,E-6的序列如SEQ ID NO:15~16所示,E-7的序列如SEQID NO:17~18所示,E-8的序列如SEQ ID NO:19~20所示。
2.權利要求1所述的引物組合物在鑒評蝴蝶蘭遺傳多樣性中的應用。
3.一種鑒評蝴蝶蘭遺傳多樣性的方法,其特征在于,包括如下步驟:
(1)提取待分析蝴蝶蘭的總DNA;
(2)對權利要求1所述的引物組合物進行熒光標記后,以步驟(1)的DNA為模板分別進行PCR反應;
(3)記錄每對引物的擴增峰型,對獲得的數據進行分析處理,評價蝴蝶蘭種質的遺傳多樣性。
4.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,提取待分析蝴蝶蘭的總DNA時,以蝴蝶蘭的嫩根作為提取樣本。
5.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述PCR的擴增體系為DNA模板1μl、5μM的上下游引物1μl、5U/μl 的Taq酶0.1μl、緩沖液6μl、加水補充至15μl。
6.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述PCR的擴增程序為95℃,5min;94℃,30sec;58℃,35sec;35個循環;72℃,35sec,60℃,30min;15℃。
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