[發明專利]一種凡納濱對蝦生長相關的分子標記及其應用

在審

• 申請號: 201611216512.7
• 申請日: 2016-12-26
• 公開（公告）號: CN106834439A
• 公開（公告）日: 2017-06-13
• 發明（設計）人: 李富花;王全超;于洋;相建海
• 申請（專利權）人: 中國科學院海洋研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 沈陽科苑專利商標代理有限公司21002
• 代理人: 馬馳

本發明屬于水產育種技術領域，具體涉及一種凡納濱對蝦生長相關的分子標記及其應用。該標記位于SEQM1286的109bp位置，為T/C型突變，在該標記中CC基因型個體的生長速度高于TT基因型，提示CC基因型為生長優勢基因型。本發明標記可以作為對蝦育種的分子標記輔助對蝦的遺傳選育。

技術領域

本發明屬于水產動物育種領域，具體涉及一種凡納濱對蝦生長相關的分子標記及其應用。

背景技術

凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)，又稱南美白對蝦(white Pacificshrimp)，是我國乃至世界養殖產量最高的對蝦品種，也是世界重要的經濟貿易品種。由于其生長速度快、抗病力強，且經過淡化后可以在內陸低鹽度甚至淡水區域養殖，因此該品種在我國的南北方和沿海內陸地區廣泛養殖，我國每年的產量達100多萬噸。

良種是凡納濱對蝦產業健康發展的基礎和推動力，人工選育是培育生長速度快、成活率高的凡納濱對蝦良種的重要方法，然而，人工選育的周期長，成本高，且選擇準確率易受到環境等外界因素的影響。分子標記輔助育種是指通過QTL定位或者關聯分析的方法，挖掘出與性狀直接相關的分子標記，實現對目標性狀的直接選擇，可以極大地提高選育效率和準確率。在對蝦中，研究人員通過QTL定位方法定位到了若干生長相關的QTL位點，如在在日本對蝦生長速度QTL定位中，研究人員定位到了一個與生長性狀相關的主效AFLP標記，之后通過圖位克隆的方法找到一個與生長相關的基因ELOVL(Elongation of very longchain fatty acids-like)(Lyons RE,Dierens LM,Tan SH,Preston NP,LiY.Characterization of AFLP markers associated with growth in the kurumaprawn,Marsupenaeus japonicus,and identification of a candidate gene.MarBiotechnol,2007,9：712-721)，在凡納濱對蝦QTL定位中，也發現了生長相關的QTL位點(Andriantahina F,Liu X,Huang H.Genetic map construction and quantitativetrait locus(QTL)detection of growth-related traits in Litopenaeus vannameifor selective breeding applications.PLoS One,2013,8:e75206)，但是并沒有定位到與生長直接相關的基因或標記。因此在本發明旨在提供一種與生長性狀顯著相關的標記，該標記可以用作凡納濱對蝦生長性狀的輔助選育。

發明內容

本發明的目的是提供一種與凡納濱對蝦生長相關的分子標記，并應用于對蝦生長快品種的輔助培育。

為實現上述目的，本發明采用技術方案為：

一種與凡納濱對蝦生長相關的分子標記，與對蝦生長性狀顯著相關的分子標記位于SEQ1286DNA序列的109bp位置，該標記為T/C型SNP標記。

進一步，一種用于檢測所述的與對蝦生長相關的分子標記的引物對，其特征在于：引物對為：

M1286F：GCGGGTCTTTTCCTCCTTCT

M1286R：GCCCATCTTCGCACTTCTTTC

進一步地，與對蝦生長相關的分子標記的應用，CC基因型個體的生長速度高于TT基因型，在對蝦育種過程中，通過SNP分型方法將該標記分型后，選擇CC基因型個體進行留種，能夠輔助實現生長性狀的選擇。

本發明所具有的優點：本方法提供的生長相關的分子標記能夠從分子水平上對生長快個體進行選擇，不受外界環境及個體大小的限制，能夠在早期對生長快個體進行選擇，提高選擇的效率和準確率。

附圖說明