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[發明專利]一種基于深度學習的骨髓液細胞分割方法有效

專利信息
申請號: 201611209048.9 申請日: 2016-12-23
公開(公告)號: CN106780522B 公開(公告)日: 2019-08-30
發明(設計)人: 毛嘉昀;居斌;李蘭娟;李譚偉 申請(專利權)人: 杭州華卓信息科技有限公司
主分類號: G06T7/12 分類號: G06T7/12;G06T7/13;G06M11/00;G06T7/11
代理公司: 北京市盛峰律師事務所 11337 代理人: 梁艷
地址: 310012 浙江省杭*** 國省代碼: 浙江;33
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 基于 深度 學習 骨髓 細胞 分割 方法
【權利要求書】:

1.一種基于深度學習的骨髓液細胞分割方法,其特征在于,包括如下步驟:

S1,獲取細胞圖像,并初步估計所述細胞圖像內所有細胞的輪廓;

S2,根據所述細胞的輪廓,對所述細胞圖像內所有細胞進行分割,確定每個細胞的矩形檢測窗口;

S3,采用卷積深度網絡對每個所述矩形檢測窗口進行質量評價,判斷每個所述矩形檢測窗口中包含的細胞個數,得到初步分割結果;

S4,若所述矩形檢測窗口包含多個細胞,則結合聚類算法和分水嶺算法對所述初步分割結果進行精細分割,得到精細分割的細胞的輪廓,并執行S2,否則,執行S5;

S5,采用區域生長法,根據每個所述矩形檢測窗口邊緣的顏色分布,逐步增大所述矩形檢測窗口,直到所述矩形檢測窗口包含整個細胞;

S6,基于分割質量評價方法和各個所述矩形檢測窗口的重疊度,判斷S5中利用區域生長法得到的細胞窗口是否需要合并,將需要合并的窗口進行合并;

S7,去除每個細胞窗口中包含的其他細胞部分,輸出單個細胞的分割結果。

2.根據權利要求1所述的基于深度學習的骨髓液細胞分割方法,其特征在于,S1中,所述初步估計所述細胞圖像內所有細胞的輪廓,包括如下步驟:

S101,重排所述細胞圖像中的所有n個像素,并將其表示為集合{x1,...,xn},其中xi是第i個像素點的表示向量;

S102,采用k-均值算法求解所述集合的最小值:

<mrow><munder><mi>min</mi><mrow><msub><mi>&mu;</mi><mn>1</mn></msub><mo>,</mo><mn>...</mn><mo>,</mo><msub><mi>&mu;</mi><mn>3</mn></msub><mo>,</mo><msub><mi>S</mi><mn>1</mn></msub><mn>...</mn><mo>,</mo><msub><mi>S</mi><mn>3</mn></msub></mrow></munder><munderover><mo>&Sigma;</mo><mrow><mi>l</mi><mo>=</mo><mn>1</mn></mrow><mn>3</mn></munderover><munder><mo>&Sigma;</mo><mrow><mi>i</mi><mo>&Element;</mo><msub><mi>S</mi><mi>l</mi></msub></mrow></munder><mo>|</mo><mo>|</mo><msub><mi>x</mi><mi>i</mi></msub><mo>-</mo><msub><mi>&mu;</mi><mi>l</mi></msub><mo>|</mo><msubsup><mo>|</mo><mn>2</mn><mn>2</mn></msubsup><mo>,</mo></mrow>

其中,μ1,...,μ3表示各個類的中心向量,S1...,S3是各類像素點的指標集合;

S103,通過以下公式估計各類像素點屬于細胞核的可能性,確定代表細胞核的類lcell

其中,衡量了μl與細胞核的異類性,越小則第l類越可能是細胞核的類lcell

S104,建立第lcell類像素點的遮掩圖;

S105,提取所述遮掩圖中第lcell類點構成區域的所有外部輪廓,并刪除周長較短,所圍面積較小,或與圖像邊界相交的輪廓。

3.根據權利要求1所述的基于深度學習的骨髓液細胞分割方法,其特征在于,S3包括如下步驟:

S301,人工將S2中得到的大量的檢測窗口分為不包含細胞,包含單個細胞和包含多個細胞的三類;

S302,用S301得到的三類數據訓練卷積神經網絡;

S303,訓練完成后,用卷積神經網絡評價檢測窗口中的細胞分割質量,判斷窗口內包含的細胞個數。

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