[發(fā)明專利]特異DNA分子及其作為啟動子或分子標(biāo)記的應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201611190833.4
• 申請日: 2016-12-21
• 公開（公告）號: CN108220465B
• 公開（公告）日: 2020-07-24
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 劉紅霞;張學(xué)勇;郝晨陽;李甜
• 申請（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11;C12N15/113
• 代理公司: 北京紀(jì)凱知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245
• 代理人: 關(guān)暢;何葉喧

本發(fā)明公開了特異DNA分子及其作為啟動子或分子標(biāo)記的應(yīng)用。本發(fā)明首先保護(hù)一種特異DNA分子，為如下(a1)或(a2)或(a3)或(a4)：(a1)序列3第217?2497位核苷酸所示的DNA分子；(a2)序列4自5’末端第217?2498位核苷酸所示的DNA分子；(a3)序列3所示的DNA分子；(a4)序列4所示的DNA分子。本發(fā)明還保護(hù)所述特異DNA分子作為啟動子的應(yīng)用。本發(fā)明還保護(hù)所述特異DNA分子作為小麥籽粒性狀的分子標(biāo)記的應(yīng)用。本發(fā)明提供了兩種啟動子，可用于啟動目的基因的表達(dá)。本發(fā)明開發(fā)了與小麥籽粒性狀相關(guān)的SNP位點。本發(fā)明對于選育具有不同籽粒性狀的小麥具有極好的應(yīng)用前景。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及特異DNA分子及其作為啟動子或分子標(biāo)記的應(yīng)用。

背景技術(shù)

啟動子是一段位于結(jié)構(gòu)基因5’端上游區(qū)的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之與模板DNA準(zhǔn)確地結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。轉(zhuǎn)錄的起始是基因表達(dá)的關(guān)鍵階段，而這一階段重要的問題是RNA聚合酶與啟動子的相互作用。研究發(fā)現(xiàn)，同一基因可能具有不同的啟動子類型，啟動子的結(jié)構(gòu)直接影響其與RNA聚合酶的親和力，從而影響目的基因的表達(dá)水平，進(jìn)而影響基因的功能。

小麥?zhǔn)俏覈匾募Z食作物之一，直接影響我國人民生活水平的高低和國家的糧食安全。提高小麥單產(chǎn)、使其高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)也一直是我國小麥育種家們長期追求的主要目標(biāo)。因此，克隆小麥產(chǎn)量相關(guān)基因并進(jìn)一步研究其調(diào)控序列(包括啟動子)類型和活性，對于闡明啟動子對產(chǎn)量基因的調(diào)控作用以及了解產(chǎn)量基因發(fā)揮功能的機制均具有重要的科學(xué)意義和實際應(yīng)用價值。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供特異DNA分子及其作為啟動子或分子標(biāo)記的應(yīng)用。

本發(fā)明首先保護(hù)一種特異DNA分子，為如下(a1)或(a2)或(a3)或(a4)或(a5)或(a6)：

(a1)序列表中序列3自5’末端第217-2497位核苷酸所示的DNA分子；

(a2)序列表中序列4自5’末端第217-2498位核苷酸所示的DNA分子；

(a3)序列表中序列3所示的DNA分子；

(a4)序列表中序列4所示的DNA分子；

(a5)在嚴(yán)格條件下與以上(a1)至(a4)中任一所述DNA分子雜交且具有相同功能的DNA分子；

(a6)與以上(a1)至(a5)中任一所述DNA分子具有90％以上同源性且具有相同功能的DNA分子。

上述嚴(yán)格條件可為用0.1×SSPE(或0.1×SSC)，0.1％SDS的溶液，在DNA或者RNA雜交實驗中65℃下雜交并洗膜。

本發(fā)明還保護(hù)所述特異DNA分子作為啟動子的應(yīng)用。

本發(fā)明還保護(hù)所述特異DNA分子在啟動目的基因表達(dá)中的應(yīng)用。

本發(fā)明還保護(hù)所述特異DNA分子作為分子標(biāo)記在選育具有不同籽粒性狀的小麥中的應(yīng)用。所述小麥籽粒性狀為小麥籽粒千粒重和/或小麥籽粒粒長。

本發(fā)明還保護(hù)一種鑒別或輔助鑒別小麥籽粒性狀的方法，包括如下步驟：檢測待測小麥的基因型為P1純合型、P1/P2雜合型還是P2純合型；P1純合型小麥的籽粒性狀優(yōu)于P2純合型；所述籽粒性狀優(yōu)體現(xiàn)為千粒重高和/或粒長長。

本發(fā)明還保護(hù)一種鑒定或輔助鑒定小麥籽粒千粒重的方法，包括如下步驟：檢測待測小麥的基因型為P1純合型、P1/P2雜合型還是P2純合型；如果為P1純合型、待測小麥候選為高千粒重小麥；如果為P2純合型、待測小麥候選為低千粒重小麥；所述高千粒重小麥為籽粒千粒重≥35g的小麥；所述低千粒重小麥為籽粒千粒重＜35g的小麥。