[發明專利]一種分析處理農作物SSR標記圖譜的方法及其裝置

有效

• 申請號: 201611102076.0
• 申請日: 2016-12-05
• 公開（公告）號: CN106480215B
• 公開（公告）日: 2017-11-28
• 發明（設計）人: 張憲晨;朱麗;劉越;閆珍臣
• 申請（專利權）人: 北京華生恒業科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12M1/34
• 代理公司: 北京精金石專利代理事務所(普通合伙)11470
• 代理人: 劉曄

1.一種分析處理農作物SSR標記圖譜的裝置，所述裝置包括曲線處理、內標校準以及片段分析和基因分型3個模塊，其特征在于，片段分析和基因分型模塊包括連續多峰處理子模塊，所述連續多峰處理子模塊包括以下單元：

連續多峰識別單元，用于識別所處理圖譜是否存在連續多峰；

N+1峰組識別單元，用于識別連續多峰是否存在N+1峰組，即從連續多峰的第一個峰開始，如果后峰與本峰的間距不大于1.2bp則將后峰加入至N+1峰組；

N+1峰組分子組單元，用于將被識別出的N+1峰組進行分子組處理，即在N+1峰組中找到最高的峰，如果最高峰在N+1峰組前3個位置則將最高峰、最高峰的左側峰及最高峰的右側的兩個峰分為一子組而其他峰為另一子組，反之則將最高峰左側第一峰、最高峰及最高峰右側所有峰分為一子組，而其他峰為另一子組；

N+1峰組處理單元，用于將經分子組處理后的N+1峰組進行處理，即以每子組的最高峰為基礎進行間隔過濾，即將每子組中最高峰兩側的第2n-1峰排除，其中n為整數且大于0；

N+1峰組再識別單元，用于識別經N+1峰組處理單元處理后的圖譜是否還存在N+1峰組，若還存在N+1峰組即將圖譜傳送至N+1峰組分子組單元再次進行分子組處理，若處理后的連續多峰段只剩一峰則結束連續多峰處理，若與上述兩個情況不符則進入遞增多峰識別單元；

遞增多峰識別單元，用于識別圖譜是否存在遞增多峰，即從連續多峰的第一個峰開始作為本峰，若滿足Hf<Hb<xHf，或滿足yHf<Hb<Hf，將后峰加入遞增多峰組，直至本峰為該連續多峰中的最高峰，其中Hf為本峰峰高，Hb為后峰峰高，5≤x≤10，0.85≤y<1；

遞增多峰處理單元，用于處理被識別出的遞增多峰，即若遞增多峰組內峰數大于2，將組內其他峰排除只保留最后一峰，并將其他各峰的峰高疊加至最后一峰，處理后結束連續多峰處理，反之則不做處理并進入影子峰處理單元；

影子峰處理單元，用于識別并處理被識別出的圖譜中的影子峰，即若左峰小于右峰的左比例則將左峰排除，若右峰小于左峰的右比例則將右峰排除，結束連續多峰處理步驟，其中所述左比例和右比例的取值在0至1之間。

2.根據權利要求1所述的裝置，其特征在于，所述曲線處理模塊還包括釘子峰處理子模塊，所述釘子峰處理子模塊用于將由于電泳時電流不穩而導致的釘子狀尖峰去除。

3.根據權利要求1所述的裝置，其特征在于，所述曲線處理模塊還包括飽和峰處理子模塊，所述飽和峰處理子模塊用于將由于峰強度超過了測序儀的閾值而導致的平頭或凹頭型飽和峰以及在該飽和峰下對應出現的拔起峰相疊加從而形成一個完整的峰。

4.一種電子終端，其特征在于，所述電子終端包括權利要求1-3中任一項所述的分析處理農作物SSR標記圖譜的裝置。

5.根據權利要求4所述的電子終端，其特征在于，所述電子終端包括：

通信模塊，用于通過有線和/或無線的方式將所述分析處理農作物SSR標記圖譜的裝置處理后的圖譜或圖譜對應的數據傳輸到外部的其他設備。