[發明專利]一個與桃樹流膠病抗性相關的SNP分子標記

有效

• 申請號: 201611086502.6
• 申請日: 2016-12-01
• 公開（公告）號: CN106636081B
• 公開（公告）日: 2019-06-11
• 發明（設計）人: 李雄偉;葉正文;周京一;高中山;賈惠娟;蘇明申;杜紀紅;周慧娟
• 申請（專利權）人: 上海市農業科學院
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/6895
• 代理公司: 上海開祺知識產權代理有限公司 31114
• 代理人: 費開逵

一個與桃樹流膠病抗性相關的SNP分子標記，通過對桃樹流膠病抗性基因位點進行定位，得到一個與桃樹流膠病抗性相關QTL緊密連鎖的SNP分子標記，其位于桃的第6號染色體上，位點為SNP_IGA_627726，該SNP位點與不同桃品系流膠病的發病率有顯著相關性，具有良好的多態性，為抗流膠病品種選擇過程中早期親本選擇及雜交后期后代選擇提供了一個新的鑒定方法，能提高流膠病抗性檢測的準確性，縮短育種周期，提高育種效率，加快實現高溫高濕地區桃樹抗流膠病新品種的選育。

技術領域

本發明屬于桃樹育種技術領域，具體涉及一個與桃樹流膠病抗性相關的SNP分子標記。

背景技術

桃是原產我國西部的薔薇科核果類果樹，也是世界栽培范圍最廣泛的果樹之一。桃流膠病是影響桃產業健康有序發展的重要因素之一，給我國桃生產造成了嚴重危害。

桃樹流膠病由真菌多主葡萄糖殼菌(Botryosphaeria dothidea)侵染所致，主要發生在樹體主干和側枝，發病嚴重時發展到結果枝及果實。發病初期皮孔流出淡黃色透明膠，膠凝結后漸變紅褐色，病部稍腫，皮層及木質部變褐腐朽，腐生其他雜菌，樹勢逐漸衰弱，葉小而黃，果實產量及品質下降，嚴重時枝干枯死，整株死亡，果實發病由果核內分泌黃色膠質，溢出果面，病部硬化，嚴重時不能正常生長發育(趙密珍等，1996；馬瑞娟等，2002；李智，2014)。

桃流膠病在我國南北方產區均有發生，但在長江流域及以南的高溫多雨地區尤為嚴重，美國、日本等也有相關研究報道。調查顯示，2003年我國重慶部分地區桃流膠病平均發病率66.8％，2005、2006年北京大興區桃流膠病平均發病率為93.73％和91.05％，2008年廣東省桃樹種植區連平縣桃流膠病發病率達100％。2009年湖北孝感、仙桃等地部分種植品種流膠病發病率達100％(陳彥等，2011；張平等，2013)。

桃流膠病的發生主要由生物和非生物因素造成，其發病程度與品種、栽培環境、栽培技術管理、樹齡等密切相關。國內外研究者對于桃流膠病的研究主要集中在以下幾個方面：(1)誘導桃流膠病的病原菌類型及侵染方式(Britton and Hendrix，1982；Weaver et等，1974；Wang等，2011)；(2)發病后生理生化變化(李智，2014；俞明亮等，2001)；(3)發病后的防治措施(楊文，2011；Li等，1995)；(4)植物生長物質對流膠病的影響(Li等，2014)，品種抗性方面也有相關報道。

楊文(2011)分析了6個桃品種對流膠病的敏感性，發現‘春雪’易感，‘慶豐’和‘倉方早生’中感，‘霞暉5號’、‘大紅袍’和‘鄂桃1號’敏感性最弱。趙密珍等(1996)調查了273個桃品種的流膠病，發現絕大部分品種不抗流膠病，極少數品種具有高抗能力；高抗品種有天津水蜜、白沙、皺葉黃露、大紅花，中抗品種有早甜桃、潤州水蜜、金山水蜜、上山大玉露、大久保、岡山100號、西野、岡山白。油桃、蜜桃、硬肉桃感病稍輕，其次為水蜜桃品種群、黃桃品種群、蟠桃品種群感病重。

目前，基于全基因組重測序的SNP標記開發及構建高密度SNP芯片目前已應用到桃果實香氣物質的合成及冷害的遺傳機理研究中，對不同桃品種自身流膠病抗性的分子機理研究仍為空白，有必要通過分子育種手段，挖掘定位抗病基因，選擇親本，為新型抗病品種選育提供依據。

發明內容

本發明的目的在于提供一個與桃樹流膠病抗性相關的SNP分子標記，該SNP分子標記位于桃的第6條連鎖群上第26.7區段，位點為SNP_IGA_627726，對應染色體物理位置為7604716，與桃的流膠病的發病率有顯著相關性，具有良好的多態性，利用該SNP分子標記對不同桃品種或品系進行抗流膠病檢測，準確率高，利于提高桃樹的育種效率，加快實現高溫高濕地區桃樹抗流膠病新品種的選育。

為了達到上述目的，本發明提供的技術方案如下：