[發明專利]藥物組合預測系統和藥物組合預測方法在審
| 申請號: | 201611052822.X | 申請日: | 2016-11-25 |
| 公開(公告)號: | CN108073789A | 公開(公告)日: | 2018-05-25 |
| 發明(設計)人: | 劉韋驛;邱育賢;徐仁徽;謝嘉珊;蔡孟勳;盧子彬;賴亮全;莊曜宇;蕭暉議 | 申請(專利權)人: | 財團法人資訊工業策進會 |
| 主分類號: | G06F19/20 | 分類號: | G06F19/20;G06F19/28 |
| 代理公司: | 北京律誠同業知識產權代理有限公司 11006 | 代理人: | 徐金國 |
| 地址: | 中國臺灣臺北市*** | 國省代碼: | 中國臺灣;71 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基因組 基因 協同 儲存裝置 協同基因 預測系統 處理器 數據庫 儲存 協同藥物 運算量 預測 篩選 | ||
1.一種藥物組合預測系統,其特征在于,所述系統包含:
儲存裝置,所述儲存裝置用于儲存數據庫,所述數據庫用于儲存多個原始基因組、第一藥品所影響的至少第一基因和第二藥品所影響的至少第二基因;其中,所述多個原始基因組包含第一原始基因組,所述第一原始基因組包含所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分;以及
處理器,所述處理器耦接于所述儲存裝置,用于將所述第一原始基因組中的所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分指定為第一協同基因組,計算所述第一協同基因組中的基因數量,以取得第一協同基因數量,依據所述第一協同基因數量在所述第一原始基因組中所占的第一比例,計算所述第一藥物和所述第二藥物的組合所對應的協同值,并依據所述協同值篩選出至少一種協同藥物組合。
2.如權利要求1所述的藥物組合預測系統,還包含:
傳輸裝置,所述傳輸裝置用于接收來自DNA微陣列裝置所測量的基因表達量,所述處理器分析所述基因表達量以得知所述第一藥品所影響的所述至少第一基因和所述第二藥品所影響的所述至少第二基因。
3.如權利要求1所述的藥物組合預測系統,其中,所述多個原始基因組包含第二原始基因組;其中,當所述第二原始基因組包含所述至少第二基因的部分且不包含所述至少第一基因時,所述處理器判斷所述第一藥物和所述第二藥物的組合所對應的協同值為零。
4.如權利要求1所述的藥物組合預測系統,其中所述多個原始基因組包含第三原始基因組,所述第三原始基因組包含所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分,所述處理器還用于將所述第三原始基因組中的所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分指定為第二協同基因組,并依據所述第二協同基因組取得第二協同基因數量,計算所述第二協同基因數量在所述第三原始基因組中所占的第二比例,并依據所述第二比例和所述第一比例,計算所述第一藥物和所述第二藥物的組合所對應的協同值。
5.如權利要求4所述的藥物組合預測系統,其中所述處理器累加所述第二比例和所述第一比例以取得影響參數,并將所述影響參數除以所述多個原始基因組的組數,以取得所述第一藥物和所述第二藥物的組合所對應的協同值。
6.如權利要求5所述的藥物組合預測系統,其中所述處理器還用于判斷所述協同值是否為零,若所述協同值為零,則排除所述第一藥物和所述第二藥物的組合。
7.如權利要求5所述的藥物組合預測系統,其中所述處理器還用于計算所述第一藥物和第三藥物的組合所對應的另一個協同值,并計算所述協同值與所述另一個協同值的平均值,當所述協同值高于所述平均值時,則將所述第一藥物和所述第二藥物的組合指定為所述至少一種協同藥物組合的其中之一。
8.如權利要求1所述的藥物組合預測系統,其中所述處理器還用于依據所述至少一種協同藥物組合,預測藥物療效的排名。
9.一種藥物組合預測方法,其特征在于,所述方法包含:
儲存多個原始基因組、第一藥品所影響的至少第一基因和第二藥品所影響的至少第二基因;其中,所述多個原始基因組包含第一原始基因組,所述第一原始基因組包含所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分;
將所述第一原始基因組中的所述至少第一基因的部分和所述至少第二基因的部分指定為第一協同基因組;
計算所述第一協同基因組中的基因數量,以取得第一協同基因數量,并計算所述第一協同基因數量在所述第一原始基因組中所占的第一比例;
依據所述第一比例計算所述第一藥物和所述第二藥物的組合所對應的協同值;以及
依據所述協同值篩選出至少一種協同藥物組合。
10.如權利要求9所述的藥物組合預測方法,還包含:
接收來自DNA微陣列裝置所測量的基因表達量;以及
分析所述基因表達量以得知所述第一藥品所影響的所述至少第一基因和所述第二藥品所影響的所述至少第二基因。
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G06F19-14 ..用于發展或進化的,例如:進化的保存區域決定或進化樹結構
G06F19-16 ..用于分子結構的,例如:結構排序,結構或功能關系,蛋白質折疊,結構域拓撲,用結構數據的藥靶,涉及二維或三維結構的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學或蛋白質組學的,例如:基因型–表型關聯,不均衡連接,種群遺傳學,結合位置鑒定,變異發生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質相互作用或蛋白質核酸的相互作用





