[發(fā)明專利]一種提升測序平臺文庫拆分率的標簽序列混庫方法和裝置有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610962942.7 | 申請日: | 2016-10-28 |
| 公開(公告)號: | CN108018607B | 公開(公告)日: | 2021-04-27 |
| 發(fā)明(設計)人: | 劉舒;伍梓靖 | 申請(專利權)人: | 深圳華大基因股份有限公司 |
| 主分類號: | C40B20/04 | 分類號: | C40B20/04;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 深圳鼎合誠知識產(chǎn)權代理有限公司 44281 | 代理人: | 孫銀行;彭家恩 |
| 地址: | 518083 廣東省深圳市鹽田*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 提升 平臺 文庫 拆分 標簽 序列 方法 裝置 | ||
1.一種提升測序平臺文庫拆分率的標簽序列混庫方法,其特征在于,所述方法包括:
將多個標簽序列中每個位置的A、C堿基替換為同一個符號,將G、T堿基替換為另一個符號,從而將每個標簽序列轉(zhuǎn)換成由兩種符號表示的序列;
選取標簽序列轉(zhuǎn)換后兩兩標簽序列在大于2個位置有差異的序列進行混庫。
2.根據(jù)權利要求1所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,將標簽序列中每個位置的A、C堿基替換為符號A,將G、T堿基替換為符號B。
3.根據(jù)權利要求1所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,所述標簽序列的長度是4-10個堿基。
4.根據(jù)權利要求3所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,所述標簽序列的長度是6-8個堿基。
5.根據(jù)權利要求1所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,選取二者轉(zhuǎn)換后在≥4個位置有差異的序列進行混庫。
6.根據(jù)權利要求1-5任一項所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,所述測序平臺是Illumina Hiseq/Miseq測序平臺。
7.一種提升測序平臺文庫拆分率的標簽序列混庫裝置,其特征在于,所述裝置包括:
序列轉(zhuǎn)換單元,用于將多個標簽序列中每個位置的A、C堿基替換為同一個符號,將G、T堿基替換為另一個符號,從而將每個標簽序列轉(zhuǎn)換成由兩種符號表示的序列;
序列比對單元,用于選取標簽序列轉(zhuǎn)換后兩兩標簽序列在大于2個位置有差異的序列進行混庫。
8.根據(jù)權利要求7所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,將標簽序列中每個位置的A、C堿基替換為符號A,將G、T堿基替換為符號B。
9.根據(jù)權利要求7所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,所述標簽序列的長度是4-10個堿基。
10.根據(jù)權利要求9所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,所述標簽序列的長度是6-8個堿基。
11.根據(jù)權利要求7所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,選取二者轉(zhuǎn)換后在≥4個位置有差異的序列進行混庫。
12.根據(jù)權利要求7-11任一項所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,所述測序平臺是Illumina Hiseq/Miseq測序平臺。
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