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[發(fā)明專利]一種提升測序平臺文庫拆分率的標簽序列混庫方法和裝置有效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201610962942.7 申請日: 2016-10-28
公開(公告)號: CN108018607B 公開(公告)日: 2021-04-27
發(fā)明(設計)人: 劉舒;伍梓靖 申請(專利權)人: 深圳華大基因股份有限公司
主分類號: C40B20/04 分類號: C40B20/04;C12Q1/6869
代理公司: 深圳鼎合誠知識產(chǎn)權代理有限公司 44281 代理人: 孫銀行;彭家恩
地址: 518083 廣東省深圳市鹽田*** 國省代碼: 廣東;44
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 提升 平臺 文庫 拆分 標簽 序列 方法 裝置
【權利要求書】:

1.一種提升測序平臺文庫拆分率的標簽序列混庫方法,其特征在于,所述方法包括:

將多個標簽序列中每個位置的A、C堿基替換為同一個符號,將G、T堿基替換為另一個符號,從而將每個標簽序列轉(zhuǎn)換成由兩種符號表示的序列;

選取標簽序列轉(zhuǎn)換后兩兩標簽序列在大于2個位置有差異的序列進行混庫。

2.根據(jù)權利要求1所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,將標簽序列中每個位置的A、C堿基替換為符號A,將G、T堿基替換為符號B。

3.根據(jù)權利要求1所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,所述標簽序列的長度是4-10個堿基。

4.根據(jù)權利要求3所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,所述標簽序列的長度是6-8個堿基。

5.根據(jù)權利要求1所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,選取二者轉(zhuǎn)換后在≥4個位置有差異的序列進行混庫。

6.根據(jù)權利要求1-5任一項所述的標簽序列混庫方法,其特征在于,所述測序平臺是Illumina Hiseq/Miseq測序平臺。

7.一種提升測序平臺文庫拆分率的標簽序列混庫裝置,其特征在于,所述裝置包括:

序列轉(zhuǎn)換單元,用于將多個標簽序列中每個位置的A、C堿基替換為同一個符號,將G、T堿基替換為另一個符號,從而將每個標簽序列轉(zhuǎn)換成由兩種符號表示的序列;

序列比對單元,用于選取標簽序列轉(zhuǎn)換后兩兩標簽序列在大于2個位置有差異的序列進行混庫。

8.根據(jù)權利要求7所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,將標簽序列中每個位置的A、C堿基替換為符號A,將G、T堿基替換為符號B。

9.根據(jù)權利要求7所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,所述標簽序列的長度是4-10個堿基。

10.根據(jù)權利要求9所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,所述標簽序列的長度是6-8個堿基。

11.根據(jù)權利要求7所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,選取二者轉(zhuǎn)換后在≥4個位置有差異的序列進行混庫。

12.根據(jù)權利要求7-11任一項所述的標簽序列混庫裝置,其特征在于,所述測序平臺是Illumina Hiseq/Miseq測序平臺。

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說明:

1、專利原文基于中國國家知識產(chǎn)權局專利說明書;

2、支持發(fā)明專利 、實用新型專利、外觀設計專利(升級中);

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