[發明專利]水稻基因組重組核酸片段RecCR020429及其檢測方法

有效

• 申請號: 201610932301.7
• 申請日: 2016-10-25
• 公開（公告）號: CN107988212B
• 公開（公告）日: 2020-06-23
• 發明（設計）人: 喻輝輝;周發松;張學堂;邱樹青;何宗順;雷昉;姚玥;馮芳;李菁;韋懿;陳光;何予卿;楊毅
• 申請（專利權）人: 中國種子集團有限公司
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/6895;A01H1/02;A01H1/04
• 代理公司: 北京英賽嘉華知識產權代理有限責任公司 11204
• 代理人: 王達佐;洪欣

本申請提供了水稻基因組重組核酸片段及其檢測方法。本申請還提供了含有重組核酸片段的水稻植株的選育方法，利用分子標記對重組植株進行前景選擇和背景選擇，獲得了含有重組核酸片段的水稻植株。

技術領域

本申請涉及全基因組選擇育種技術。具體而言，本申請涉及利用全基因組選擇育種技術選育具有褐飛虱抗性功能的重組核酸片段的水稻植株，以及由此而獲得的重組核酸片段及其檢測方法。

背景技術

褐飛虱，學名Nilaparvata lugens屬同翅目，飛虱科。褐飛虱是單食性害蟲，僅取食水稻，具有喜溫、抗寒能力弱、生長周期短、遠距離遷飛、暴發性和猖獗性等特征。褐飛虱是典型的刺吸式害蟲，以取食韌皮部和木質部汁液為生，取食量大、繁殖快，一旦大爆發，可造成受害區域顆粒無收。此外，還可以傳播水稻病毒病(如：草狀叢矮病和齒葉矮縮病)，對水稻生產也造成嚴重危害。

自20世紀80年代以來，從野生稻和栽培稻中已經鑒定超過30個抗褐飛虱位點。由于褐飛虱表型鑒定的復雜性，導致近幾年才克隆Bph14、Bph26和Bph3等個別基因(Du等，PNAS.2009,106(52):22163-22168；Tamura等，Sci Rep.2014,4:5872；Liu等，NatureBiotechnology.2015,33:301-305)。另外，隨著抗褐飛虱品種在生產中的不斷利用，褐飛虱對品種的適應能力逐漸增強。一些在生產上廣泛利用的抗性品種正逐漸喪失對褐飛虱的抗性(Deen等，Rice Genet Newsl.2010,25:70-72)。

目前，褐飛虱防治仍依靠化學農藥，不僅增加生產成本，污染環境，而且促使褐飛虱抗藥性增強。由此可見，抗褐飛虱新品種的培育需求非常迫切。

發明內容

一方面，本申請提供了水稻基因組重組核酸片段，其包含以下重組核酸片段，或者由以下重組核酸片段組成：

-第一重組核酸片段，其選自：i)包含SEQ ID NO:1所示序列第134至162位和第358至379位的核苷酸的序列或其片段或其變體或其互補序列；ii)包含SEQ ID NO:1所示序列第144至368位核苷酸的序列或其片段或其變體或其互補序列；iii)包含SEQ ID NO:1所示序列第134至162位和第358至379位核苷酸的序列或其片段或其變體或其互補序列，以及SEQ ID NO:1所示序列第5至27位、第36至72位、第388至412位和第440至464位核苷酸中的至少一種序列或其片段或其變體或其互補序列；或iv)包含SEQ ID NO:1所示的序列或其片段或其變體或其互補序列；和/或

-第二重組核酸片段，其選自：v)包含SEQ ID NO:2所示序列第84至106位和第184至226位的核苷酸的序列或其片段或其變體或其互補序列；vi)包含SEQ ID NO:2所示序列第99至186位核苷酸的序列或其片段或其變體或其互補序列；vii)包含SEQ ID NO:2所示序列第84至106位和第184至226位的核苷酸的序列或其片段或其變體或其互補序列，以及SEQID NO:2所示序列第12至37位、第239至263位和第385至405位核苷酸中的至少一種序列或其片段或其變體或其互補序列；或viii)包含SEQ ID NO:2所示的序列或其片段或其變體或其互補序列。

在一實施方案中，本申請提供的水稻基因組重組核酸片段包含選自i)、ii)、iii)、iv)中任一序列的第一重組核酸片段，或者由選自i)、ii)、iii)、iv)中任一序列的第一重組核酸片段組成。

在另一實施方案中，本申請提供的水稻基因組重組核酸片段包含選自v)、vi)、vii)、viii)中任一序列的第二重組核酸片段，或者由選自v)、vi)、vii)、viii)中任一序列的第二重組核酸片段組成。