[發(fā)明專(zhuān)利]基因測(cè)序儀運(yùn)行模擬方法和系統(tǒng)

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201610847508.4
• 申請(qǐng)日: 2016-09-23
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN107871059A
• 公開(kāi)（公告）日: 2018-04-03
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 盛司潼;葉俊良
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 廣州康昕瑞基因健康科技有限公司
• 主分類(lèi)號(hào): G06F19/22
• 分類(lèi)號(hào): G06F19/22
• 代理公司: 暫無(wú)信息
• 代理人: 暫無(wú)信息

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及基因測(cè)序領(lǐng)域，更具體地說(shuō)，本發(fā)明涉及一種基因測(cè)序儀運(yùn)行模擬方法和系統(tǒng)。

背景技術(shù)

基因測(cè)序儀通常包括安裝于電腦或服務(wù)器的基因測(cè)序儀系統(tǒng)、連接到電腦或服務(wù)器并由基因測(cè)序儀系統(tǒng)驅(qū)動(dòng)的設(shè)備單元?，F(xiàn)有技術(shù)中，對(duì)基因測(cè)序儀系統(tǒng)進(jìn)行升級(jí)或調(diào)試需要連接并啟用設(shè)備單元正常進(jìn)行，增加了實(shí)際硬件設(shè)備單元的啟動(dòng)次數(shù)和工作時(shí)間，減少了整個(gè)基因測(cè)序儀的使用壽命，而且這些設(shè)備單元開(kāi)機(jī)時(shí)響應(yīng)速度和驅(qū)動(dòng)響應(yīng)緩慢也影響了基因測(cè)序儀系統(tǒng)初始化的效率。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提供一種基因測(cè)序儀運(yùn)行模擬方法，旨在解決現(xiàn)有技術(shù)基因測(cè)序系統(tǒng)初始化效率低的問(wèn)題。

一種基因測(cè)序儀模擬運(yùn)行方法，所述基因測(cè)序儀包括至少一個(gè)設(shè)備單元和控制基因測(cè)序儀工作的基因測(cè)序系統(tǒng)，所述方法包括：

提供至少一個(gè)虛擬串口；

提供至少一個(gè)虛擬設(shè)備，所述至少一個(gè)虛擬設(shè)備通過(guò)所述虛擬串口連接所述基因測(cè)序系統(tǒng)，所述基因測(cè)序系統(tǒng)通過(guò)所述虛擬串口向所述虛擬設(shè)備發(fā)送動(dòng)作指令，所述虛擬設(shè)備通過(guò)所述虛擬串口接受基因測(cè)序系統(tǒng)發(fā)出的動(dòng)作指令，并通過(guò)所述虛擬串口反饋?lái)憫?yīng)指令給基因測(cè)序系統(tǒng)，所述基因測(cè)序系統(tǒng)根據(jù)虛擬設(shè)備反饋的響應(yīng)指令完成基因測(cè)序系統(tǒng)的初始化。

進(jìn)一步地，所述虛擬串口包括存儲(chǔ)動(dòng)作指令的指令緩存區(qū)，所述虛擬設(shè)備包括監(jiān)聽(tīng)指令緩存區(qū)內(nèi)動(dòng)作指令的獨(dú)立線程。

進(jìn)一步地，所述虛擬設(shè)備內(nèi)預(yù)設(shè)多條對(duì)應(yīng)不同動(dòng)作指令的響應(yīng)指令，當(dāng)指令緩存區(qū)內(nèi)動(dòng)作指令被虛擬設(shè)備讀取時(shí)，虛擬設(shè)備判斷指令緩存區(qū)內(nèi)的動(dòng)作指令類(lèi)型后反饋對(duì)應(yīng)的響應(yīng)指令給基因測(cè)序系統(tǒng)。

進(jìn)一步地，所述虛擬設(shè)備讀取指令緩存區(qū)內(nèi)動(dòng)作指令，根據(jù)預(yù)設(shè)的通訊協(xié)議對(duì)接收的動(dòng)作指令進(jìn)行識(shí)別后生成對(duì)應(yīng)的響應(yīng)指令并反饋給基因測(cè)序系統(tǒng)。

進(jìn)一步地，所述預(yù)設(shè)的通訊協(xié)議至少包括包頭信息、數(shù)據(jù)信息和校驗(yàn)位。

進(jìn)一步地，虛擬設(shè)備包括虛擬機(jī)械臂，所述動(dòng)作指令的數(shù)據(jù)信息中包括的序列化的多位數(shù)據(jù)，所述虛擬機(jī)械臂對(duì)序列化的多位數(shù)據(jù)移位實(shí)現(xiàn)反序列化，得到虛擬機(jī)械臂移動(dòng)到指定位置的坐標(biāo)數(shù)據(jù)，并對(duì)應(yīng)生成響應(yīng)命令反饋基因測(cè)序系統(tǒng)。

進(jìn)一步地，所述至少一個(gè)虛擬設(shè)備包括虛擬明場(chǎng)燈設(shè)備、虛擬九孔泵設(shè)備、虛擬溫控設(shè)備和虛擬顯示面板，所述虛擬明場(chǎng)燈設(shè)備、虛擬九孔泵設(shè)備、虛擬溫控設(shè)備和虛擬顯示面板分別通過(guò)不同的虛擬串口連接所述基因測(cè)序系統(tǒng)，每個(gè)虛擬串口包括存儲(chǔ)動(dòng)作指令的指令緩存區(qū)。

進(jìn)一步地，所述至少一個(gè)虛擬設(shè)備包括虛擬機(jī)械臂、虛擬XY平臺(tái)和虛擬升降平臺(tái)，所述虛擬機(jī)械臂、虛擬XY平臺(tái)和虛擬升降平臺(tái)通過(guò)共用虛擬串口連接所述基因測(cè)序系統(tǒng)。

進(jìn)一步地，所述共用虛擬串口包括存儲(chǔ)動(dòng)作指令的指令緩存區(qū)，所述虛擬機(jī)械臂、虛擬XY平臺(tái)和虛擬升降平臺(tái)分別包括一個(gè)命令緩存區(qū)，所述共用虛擬串口內(nèi)的動(dòng)作指令由所述虛擬機(jī)械臂、虛擬XY平臺(tái)和虛擬升降平臺(tái)中的任意一個(gè)讀取并判斷后存入對(duì)應(yīng)的命令緩存區(qū)，虛擬機(jī)械臂、虛擬XY平臺(tái)和虛擬升降平臺(tái)分別從對(duì)應(yīng)命令緩存區(qū)內(nèi)讀取對(duì)應(yīng)的動(dòng)作指令。

進(jìn)一步地，所述指令緩存區(qū)為命令緩存區(qū)中的一個(gè)。

進(jìn)一步地，所述的基因測(cè)序儀運(yùn)行模擬方法進(jìn)一步包括預(yù)先存儲(chǔ)進(jìn)行基因測(cè)序時(shí)設(shè)備單元產(chǎn)生的數(shù)據(jù)文件至對(duì)應(yīng)的目錄，所述虛擬設(shè)備根據(jù)動(dòng)作指令從對(duì)應(yīng)目錄讀取數(shù)據(jù)文件并反饋給基因測(cè)序系統(tǒng)，所述基因測(cè)序系統(tǒng)根據(jù)虛擬設(shè)備反饋的響應(yīng)指令和數(shù)據(jù)文件完成模擬基因測(cè)序。

一種基因測(cè)序儀模擬運(yùn)行系統(tǒng)，包括：

至少一個(gè)虛擬設(shè)備；

連接至少一個(gè)虛擬設(shè)備的虛擬串口；

控制基因測(cè)序儀工作的基因測(cè)序系統(tǒng)，所述至少一個(gè)虛擬設(shè)備通過(guò)所述虛擬串口連接所述基因測(cè)序系統(tǒng)，所述基因測(cè)序系統(tǒng)通過(guò)所述虛擬串口向所述虛擬設(shè)備發(fā)送動(dòng)作指令，所述虛擬設(shè)備通過(guò)所述虛擬串口接受基因測(cè)序系統(tǒng)發(fā)出的動(dòng)作指令，并通過(guò)所述虛擬串口反饋?lái)憫?yīng)指令給基因測(cè)序系統(tǒng)，所述基因測(cè)序系統(tǒng)根據(jù)虛擬設(shè)備反饋的響應(yīng)指令完成基因測(cè)序系統(tǒng)的初始化。

進(jìn)一步地，所述虛擬串口包括存儲(chǔ)動(dòng)作指令的指令緩存區(qū)，所述虛擬設(shè)備包括監(jiān)聽(tīng)指令緩存區(qū)內(nèi)動(dòng)作指令的獨(dú)立線程。

進(jìn)一步地，所述虛擬設(shè)備內(nèi)預(yù)設(shè)多條對(duì)應(yīng)不同動(dòng)作指令的響應(yīng)指令，當(dāng)指令緩存區(qū)內(nèi)動(dòng)作指令被虛擬設(shè)備讀取時(shí)，虛擬設(shè)備判斷指令緩存區(qū)內(nèi)的動(dòng)作指令類(lèi)型后反饋對(duì)應(yīng)的響應(yīng)指令給基因測(cè)序系統(tǒng)。

進(jìn)一步地，所述虛擬設(shè)備讀取指令緩存區(qū)內(nèi)動(dòng)作指令，根據(jù)預(yù)設(shè)的通訊協(xié)議對(duì)接收的動(dòng)作指令進(jìn)行識(shí)別后生成對(duì)應(yīng)的響應(yīng)指令并反饋給基因測(cè)序系統(tǒng)。