[發明專利]檢測腫瘤相關的50個熱點突變基因的捕獲文庫和試劑盒有效
| 申請號: | 201610738252.3 | 申請日: | 2016-08-27 |
| 公開(公告)號: | CN106283199B | 公開(公告)日: | 2018-06-19 |
| 發明(設計)人: | 李宏志;李麗珍;劉琦;趙金銀;許立志;于闖;明鴻博 | 申請(專利權)人: | 大連晶泰生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C40B50/06 | 分類號: | C40B50/06;C40B40/08;C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 大連東方專利代理有限責任公司 21212 | 代理人: | 劉慧娟;李馨 |
| 地址: | 116000 遼寧省大連*** | 國省代碼: | 遼寧;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 捕獲 文庫 突變基因 突變區域 液相雜交 均一性 試劑盒 位點 腫瘤 生物信息學分析 腫瘤學 靶標基因組 高通量測序 測序數據 固相雜交 核酸序列 序列信息 抑癌基因 致癌基因 制備生物 種檢測 靶標 測序 構建 制備 樣本 雜交 基因 檢測 研究 | ||
本發明公開一種檢測腫瘤相關的50個熱點突變基因的試劑盒及方法,其針對腫瘤學研究相關的50個基因(包括致癌基因和抑癌基因)的207個熱點突變區域的捕獲方法,以及捕獲使用的液相雜交文庫的制備方法。具體為選取207個熱點突變區域的序列信息,設計PCR引物,利用PCR方法制備生物素標記的液相雜交捕獲文庫,利用其與構建好的靶標基因組DNA文庫雜交,對捕獲到的片段進行高通量測序和生物信息學分析,從而獲得樣本的核酸序列位點變異情況。本發明提供的方法,可獲得高質量的測序數據,具有更高捕獲效率和更好的靶標位點的均一性捕獲,解決了固相雜交的效率低、均一性差等缺點,大大的降低了測序成本。
技術領域
本發明屬于基因檢測技術領域,涉及一種用于檢測癌癥相關基因的試劑盒及檢測方法,具體涉及雜交的序列捕獲文庫的制備方法及技術。
背景技術
惡性腫瘤,俗稱癌癥,據統計癌癥已經成為我國城鄉居民的首要死因。近百年來,人們對于癌癥的研究一直沒有間斷,但具體病因仍然不能確定。隨著科學進步發展,科學家們發現癌基因與抑癌基因在癌癥發生上起到關鍵作用。癌基因(oncogene)一般可定義為某種基因,它的異常表達或表達產物的異常直接決定細胞惡性表型的產生。現已知道在腫瘤發生中,作為環境因素的病毒、化學致癌物和射線,它們作用于機體內的靶分子都是DNA,導致原癌基因的激活引發癌癥發生。癌基因可以促進細胞增殖與遷移,可以抑制細胞分化和凋亡,其在腫瘤細胞中大量表達。抑癌基因(tumor-suppressor gene)存在于正常細胞中,在被激活情況下它們具有抑制細胞增殖與遷移,調節細胞凋亡的作用,它們的丟失、突變或失去功能,使激活的癌基因發揮作用而致癌。近年來隨著基因組學的發展,不少基因檢測為主的研究項目已經取得標志性的階段成果,尤其對于癌癥的診斷預防具有不可替代的優勢。
20世紀初,人們認識到癌癥是一種遺傳病,并且在整個20世紀,科學家們開展了大量的細致、有突破性的研究來發掘癌癥的發生發展與基因之間的聯系。在研究的過程中,涌現了許多先進的技術和研究手段,使得科學家們更高效地找到了更多與癌癥相關的遺傳變異,其中細胞遺傳學技術逐漸嶄露頭角,例如熒光原位雜交(FISH)和比較基因組雜交(CGH)技術廣泛應用于鑒定染色體變異,揭示癌癥生物學的重要信息。隨后一代測序技術廣泛應用于目標區域測序,并且鑒定了許多熱點突變基因。到20世紀90年代,基因芯片技術的發展使得人們有機會更大規模地研究癌癥相關基因。
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