[發明專利]微衛星不穩定性位點-BAT26位點的檢測引物、擴增體系及檢測試劑盒有效
| 申請號: | 201610403299.4 | 申請日: | 2016-06-08 |
| 公開(公告)號: | CN107475253B | 公開(公告)日: | 2020-12-29 |
| 發明(設計)人: | 傅新暉;黃京林;陳志婷;林漢杰;王婧璇;王磊;汪建平 | 申請(專利權)人: | 中山大學附屬第六醫院 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 北京市萬慧達律師事務所 11111 | 代理人: | 謝敏楠 |
| 地址: | 510655 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 衛星 不穩定性 bat26 檢測 引物 擴增 體系 試劑盒 | ||
本發明屬于生物醫藥領域,涉及微衛星不穩定性位點?BAT26位點的檢測引物、擴增體系及檢測試劑盒。該引物序列如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2所示。采用本發明的引物進行高分辨率熔解曲線法?HRM檢測,具有很高的靈敏度和特異性。
技術領域
本發明屬于生物醫藥領域,涉及一種檢測腫瘤細胞中微衛星穩定性的擴增體系及檢測試劑盒。
背景技術
結直腸癌(colorectal cancer,CRC)在世界范圍內的惡性腫瘤疾病當中,發病率高居第4位,是一種常見惡性腫瘤,死亡率高居第2位,嚴重威脅著人類的健康與生活。結直腸癌的發病過程所表現出的許多特性與某些遺傳學改變相關,為了使更多結腸癌患者得到更科學合理的治療,探索相關遺傳指標來判斷患者的預后和化療療效、指導患者的個體化治療一直是受推崇的主題。近年來,微衛星不穩定性(MSI)的相關臨床和基礎方面研究取得了較好的進展,對MSI狀態與CRC的關系有了更深入的認識。例如高度微衛星不穩定(MSI-H)的結直腸癌患者較低度微衛星不穩定(MSI-L)和微衛星穩定(MSS)的患者具有更好的預后。
目前,檢測微衛星不穩定性狀態的方法包括MMR蛋白免疫組化法、片段分析法、HRM法等。上述后兩種均屬于基于PCR技術的方法,其引物的選擇均是對檢測靈敏度有極其重要影響的因素。片段分析法是目前公認的金標準方法,但該方法成本較高,檢測時間較長,并且必須在價格昂貴的測序儀上進行分析。HRM法則具有快速、成本低、靈敏度高等優點,同時只需在熒光定量PCR儀上即可進行分析。但HRM法對引物設計的要求很高:引物既要有很好的特異性,又要求其擴增出的片段足夠短,才能對其突變樣本獲得較好的分辨能力。
BAT26位點是微衛星不穩定性檢測的重要位點之一,但目前對其進行HRM法檢測的研究很少,僅有一篇報導(Ramunas Janavicius,2010)曾嘗試使用HRM方法檢測結直腸癌標本中BAT25、BAT26兩個位點的檢測,但檢測例數不多,缺少大樣本的臨床驗證。
發明內容
本發明的目的在于提供一種針對微衛星不穩定性位點-BAT26位點進行HRM法檢測的引物/擴增體系/檢測試劑盒。
發明通過以下技術方案實現:
首先,發明提供了一種引物,其序列選自SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2。
SEQ ID NO.1:TGCAGCAGTCAGAGCCCTTA
SEQ ID NO.2:GCTTCTTCAGTATATGTCAATGAAAACA
本發明提供了一種針對BAT26位點進行HRM法檢測的試劑盒,含有如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2所示引物。
在該試劑盒中,各組分的用量配比如下(總體積20-25μL的擴增體系):
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