[發(fā)明專利]一種蛋白質(zhì)芯片的快速制備方法

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201610396739.8
• 申請(qǐng)日: 2016-06-06
• 公開（公告）號(hào): CN107460202B
• 公開（公告）日: 2020-07-14
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 陶生策;祁環(huán);郭書娟;李陽(yáng)
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 上海交通大學(xué)
• 主分類號(hào): C12N15/70
• 分類號(hào): C12N15/70;C12N15/40;C40B50/14
• 代理公司: 上海漢聲知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31236
• 代理人: 郭國(guó)中

1.一種蛋白質(zhì)芯片的快速制備方法，其特征在于，所述制備方法是基于重組蛋白質(zhì)構(gòu)建的；

其中，所述重組蛋白質(zhì)是不同微生物之間存在的高度可變氨基酸序列的共有氨基酸序列，或者是不同微生物之間存在的某一個(gè)或者幾個(gè)自然存在的既定氨基酸序列；

所述重組蛋白質(zhì)是通過轉(zhuǎn)化子構(gòu)建，蛋白質(zhì)異源表達(dá)，高通量獲得親和純化用標(biāo)簽融合的重組蛋白質(zhì)；

所述轉(zhuǎn)化子構(gòu)建中采用的遺傳材料是通過全基因合成的；

其中，所述遺傳材料的序列信息是通過如下方法獲取的：通過分析不同微生物的現(xiàn)有蛋白質(zhì)氨基酸序列，獲得高度可變氨基酸序列的共有氨基酸序列，或者某一個(gè)或者幾個(gè)自然存在的既定氨基酸序列；并按照標(biāo)準(zhǔn)密碼子表將所述氨基酸序列轉(zhuǎn)化成對(duì)應(yīng)的核苷酸序列，進(jìn)一步優(yōu)化，即得相應(yīng)遺傳材料的序列信息。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的蛋白質(zhì)芯片的快速制備方法，其特征在于，所述優(yōu)化的因素包括：蛋白質(zhì)異源表達(dá)宿主使用密碼子的偏好性、限制性酶切位點(diǎn)、GC含量、CpG含量、對(duì)應(yīng)mRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)、潛在剪接位點(diǎn)、mRNA的多聚腺苷酸位點(diǎn)、內(nèi)部χ位點(diǎn)、內(nèi)部核糖體結(jié)合位點(diǎn)、負(fù)調(diào)控的CpG島、RNA不穩(wěn)定基序、重復(fù)序列或干擾克隆操作的限制酶切位點(diǎn)。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的蛋白質(zhì)芯片的快速制備方法，其特征在于，所述分析具體是采用聚類分析。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的蛋白質(zhì)芯片的快速制備方法，其特征在于，所述聚類分析具體是在超級(jí)計(jì)算機(jī)上使用軟件muscle3.8.31進(jìn)行的。

5.根據(jù)權(quán)利要求3或4所述的蛋白質(zhì)芯片的快速制備方法，其特征在于，所述聚類分析后還需進(jìn)一步使用軟件Matlab R2014b中seqconsensus函數(shù)。

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的蛋白質(zhì)芯片的快速制備方法，其特征在于，所述微生物包括登革病毒的不同毒株。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的蛋白質(zhì)芯片的快速制備方法，其特征在于，所述毒株包括I型、II型、III型和IV型。