[發明專利]一種四重RT-PCR同時檢測多種辣椒病毒的方法及其應用在審
| 申請號: | 201610272621.4 | 申請日: | 2016-04-27 |
| 公開(公告)號: | CN105755177A | 公開(公告)日: | 2016-07-13 |
| 發明(設計)人: | 胡新喜;汪沛;熊興耀 | 申請(專利權)人: | 湖南農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京知本村知識產權代理事務所 11039 | 代理人: | 劉江良 |
| 地址: | 410128 *** | 國省代碼: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 rt pcr 同時 檢測 多種 辣椒 病毒 方法 及其 應用 | ||
1.一種四重RT-PCR同時檢測四種常見辣椒病毒的方法,其特征在于,包括如下步驟:
1)取待測辣椒幼嫩葉片,提取其RNA;
2)以步驟1)得到的RNA為模板,通過反轉錄得到cDNA;
3)以步驟2)得到的cDNA為模板,用四對引物對其進行四重PCR擴增;
4)PCR產物凝膠電泳,凝膠成像系統拍照,根據目的片段大小及陽性對照,判斷病毒感染情況;
其中所用的四對引物的序列如下:
1)檢測黃瓜花葉病毒的引物:
正向引物:CCCACTCTTAACCACCCAACC
反向引物:GACGCAGCATACTGATAAACCAA
2)檢測煙草花葉病毒的引物:
正向引物:TAGACCCGCTAGTCACAG
反向引物:CAGAGGTCCAAACCAAAC
3)檢測馬鈴薯Y病毒的引物:
正向引物:ACGTCCAAAATGAGAATGCC
反向引物:TGGTGTTCGTGATGTGACCT
4)檢測蠶豆萎蔫病毒-2的引物:
正向引物:GCCAGAACTTGGGAGTGATAC
反向引物:ACTTGTTAGCCATTCGGGTC。
2.按照權利要求1所述的方法,其特征在于:四重PCR擴增條件為:四重PCR反應體系(50μl):2×PCRmix25μl、模板(cDNA)4μl、四對引物的正向引物和反向引物各2μl、超純水補至所需體積。
3.按照權利要求2所述的方法,其特征在于,其中四重PCR擴增程序:94℃5min預變性后,40個循環參數為,94℃30s,53℃40s,72℃1min,最后72℃10min。
4.按照權利要求1所述的方法,其特征在于,第1步是取田間花葉癥狀的辣椒幼嫩葉片,冰上保存,采取Trizol方法提取RNA。
5.按照權利要求1所述的方法,其特征在于,第2步是以步驟1)得到的RNA為模板,以6堿基隨機引物RandomPrimers為反向引物,通過反轉錄,得到cDNA。
6.按照權利要求1所述的方法,其特征在于,第4步的判斷標準是:如果擴增獲得323bp的片段,則表明待測辣椒感染了黃瓜花葉病毒;如果擴增獲得237bp的片段,則表明待測辣椒感染了煙草花葉病毒;如果擴增獲得480bp的片段,則表明待測辣椒感染了馬鈴薯Y病毒;如果擴增獲得1057bp的片段,則表明待測辣椒感染了蠶豆萎蔫病毒-2。
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