[發明專利]重組核酸片段RecCR010160及其檢測引物與應用

有效

• 申請號: 201610258716.0
• 申請日: 2016-04-22
• 公開（公告）號: CN107304450B
• 公開（公告）日: 2021-12-14
• 發明（設計）人: 喻輝輝;周發松;張學堂;邱樹青;何宗順;雷昉;姚玥;潘麗;李旭;李菁;韋懿;陳光;何予卿;陳國良;張啟發
• 申請（專利權）人: 中國種子集團有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04;A01H1/02
• 代理公司: 北京路浩知識產權代理有限公司 11002
• 代理人: 王文君

本發明涉及分子生物學，具體公開了一種水稻抗稻瘟病重組核酸片段RecCR010160及其檢測引物與應用。本發明還提供一種基于全基因組選擇育種技術選育含有抗稻瘟病基因組重組核酸片段的水稻植株的方法，將目標基因組片段導入受體材料，并同時實現背景的回復。本發明改良的受體材料為‘瀘香618B’，為具有中低直鏈淀粉含量的香型不育系‘瀘香618A’配套的保持系。利用上述方法，可以在保留‘瀘香618B’原有優點的情況下大幅度提高其稻瘟病抗性。進一步的，通過配組實現雜交種稻瘟病抗性的大幅度提高。本發明提供的基因組重組核酸片段與稻瘟病抗性緊密相關，可作為抗性資源應用于其他品種的培育。

技術領域

本發明涉及分子生物學，具體地說，涉及一種水稻抗稻瘟病重組核酸片段。

背景技術

長期以來，傳統育種的選擇方法主要依賴于田間表現型的評價，根據育種家個人經驗進行取舍，其最大的缺點在于耗時長，效率較低。要提高選擇的效率，最理想的方法應是能夠直接對基因型進行選擇。隨著分子生物技術的發展，分子標記為實現對基因型的直接選擇提供了可能。近年來，已開始應用分子標記輔助選擇方法來改良個別目標性狀，能夠顯著的縮短育種年限。

稻瘟病是水稻最嚴重的病害之一，全球每年由稻瘟病引起的水稻產量損失占11％～30％，因此稻瘟病及其抗性的研究顯得尤為重要。隨著對稻瘟病研究的逐步深入，許多水稻抗稻瘟病基因DNA片段相繼被定位和克隆。其中，Pi1及Pik簇等位基因定位于水稻第11染色體長臂近末端區域(Hua等，Theoretical and Applied Genetics.2012,125:1047-1055；Li等，Molecular Breeding.2007,20:179-188；Alok等，FunctionalIntegrativeGenomics.2012,12:215-228；Yuan等，Theoretical and Applied Genetics.2011,122:1017-1028)。

為了提高育種的穩定性、縮短育種過程和時間、有效利用水稻抗性資源，有必要對水稻在雜交育種中產生的稻瘟病抗性基因重組片段進行研究，為能夠高效穩定的實現水稻抗性育種提供有效手段。

發明內容

為了解決現有技術中存在的問題，本發明的目的是提供一種水稻抗稻瘟病重組核酸片段RecCR010160及其檢測引物與應用。

為了實現本發明目的，本發明的技術方案如下：

第一方面，本發明提供一種重組核酸片段，其特征在于，其核苷酸序列包含SEQ IDNO.1所示1208-1597bp的序列或其片段、或其變體、或其互補序列。

作為優選，其核苷酸序列包含SEQ ID NO.1所示的序列或其片段、或其變體、或其互補序列。SEQ ID NO.1所示的序列來自于‘瀘香618B’和‘華3418B’基因組區域交換產生的重組植株。

一般來講，特定核苷酸序列的變體將與該特定核苷酸序列具有至少約70％、75％、80％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％或更高的序列同一性，或以上的互補序列。這樣的變體序列包括一個或多個核酸殘基的添加、缺失或替換，從而可以導致相應的氨基酸殘基的添加、移除或替換。通過本領域內已知的序列比對程序包括雜交技術確定序列同一性。實施方案的核苷酸序列變體與本發明的序列的差異可以少至1-15個核苷酸、少至1-10個(例如6-10個)，少至5個，少至4、3、2或甚至1個核苷酸。

第二方面，本發明提供了用于擴增所述重組核酸片段的引物。

所述引物包括本領域技術人員針對該擴增目標可設計得到的所有引物。

當擴增目標為SEQ ID NO.1所示序列時，所述引物可選自：