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[發明專利]一種快速檢測–α2.4缺失型α地貧等位基因的試劑盒在審

專利信息
申請號: 201610185637.1 申請日: 2016-03-29
公開(公告)號: CN105713975A 公開(公告)日: 2016-06-29
發明(設計)人: 龍駒;潘志堅;唐維駿;龐婉容;邱盛盈;孫雷;樊祖茜 申請(專利權)人: 欽州市婦幼保健院
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68
代理公司: 桂林市持衡專利商標事務所有限公司 45107 代理人: 唐智芳
地址: 535000 廣*** 國省代碼: 廣西;45
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 快速 檢測 sup 2.4 缺失 等位基因 試劑盒
【說明書】:

技術領域

發明涉及醫學檢測技術領域,具體涉及一種快速檢測-α2.4缺失型α地貧等位基因的試劑盒。

背景技術

申請人在日常工作中,發現-α2.4缺失型α地貧等位基因在廣西有一定的分布幾率(PangWR,SunL,LongJ,WengXJ,YeXH,WangJJ,LiaoY,TangWJ,FanZQ,WuSP,SongCL,WeiXY,ZhangCH.Identificationofthe-α2.4DeletioninOneFamilyandinOneHbHDiseasePatientinGuangxi,People'sRepublicofChina.[J].Hemoglobin.2016Mar17:1-4.),該基因型與東南亞缺失型雜合會導致HbH病,為降低該基因型的漏診,有必要需建立一種可以快速檢測-α2.4等位基因的檢測試劑盒。

Taqman-PCR(熒光水解探針PCR)技術是一種廣泛用于醫學檢測的技術,其優勢在于檢測精度高,通量大,且操作快速、簡單,且大部分醫院均已部署相關儀器設備。但目前尚未見有以熒光水解探針PCR技術開發快速快速檢測-α2.4缺失型α地貧等位基因的試劑盒的相關報道。

發明內容

本發明要解決的技術問題是提供一種基于水解探針技術的快速檢測-α2.4缺失型α地貧等位基因的試劑盒。該試劑盒對-α2.4等位基因檢測具有高度的靈敏性、穩定性、準確性以及較高的特異性。

本發明所述的快速檢測-α2.4缺失型α地貧等位基因的試劑盒,包括擴增引物和熒光探針,其特征在于:

所述的擴增引物為一對可以擴增α-珠蛋白基因簇中-α2.4等位基因的特征序列的引物2.4-F和2.4-R,其中:

2.4-F:5’-CAGTCACACAAACTGTGAGTCCA-3’;

2.4-R:5’-GACATCACAAACGCAGGCAG-3’;

所述的熒光探針為一條特異性檢測2.4-F和2.4-R擴增產物的熒光探針2.4-Prob,具體為:

2.4-Prob:5’-HEX-GGCCTGCCATAGGTGTTTACCAAGGG-BHQ-1-3’。

本發明所述的熒光探針中,HEX指六氯-6-甲基熒光素,BHQ-1指熒光淬滅基團。

本發明所述的快速檢測-α2.4缺失型α地貧等位基因的試劑盒還包括一些現有試劑盒中常規且必須的組分,如緩沖液、酶液、MgCl2和dNTP等,具體地,酶液即為DNA聚合酶,具體可采用康為世紀所生產的GoldStarTaqDNAPolymerase,緩沖液為與GoldStarTaqDNAPolymerase配套的緩沖液。

采用上述試劑盒快速檢測-α2.4缺失型α地貧等位基因的方法,包括以下步驟:

1)抽提樣本基因組DNA,制備DNA模板;

2)配制反應體系,具體為:

將引物2.4-F和2.4-R、熒光探針2.4-Prob以及PCR緩沖液、酶液、MgCl2、dNTP、水和DNA模板配制成反應體系;

3)樣本檢測:分別將配制的反應體系進行PCR擴增,記錄每個PCR反應管內的熒光信號到達設定的域值時所經歷的循環次數Cq(Cq值的大小可以反映所檢測模板數的多少);

4)數據分析及結果判定:根據實時熒光PCR儀自帶的分析軟件分析判讀結果,當HEX通道有Cq值讀數時,則表示該樣本攜帶-α2.4等位基因;當HEX通道沒有Cq值讀數時,則表示該樣本不攜帶-α2.4等位基因。

上述方法的步驟1)中,采用現有常規方法制備DNA模板。

上述方法的步驟2)中,反應體系中各組分的濃度優選為:待檢測DNA:1~3ng/μL;各引物:0.3~0.5μmol/L;探針濃度為0.3~0.5μmol/L;DNA模板:20~200ng;鎂離子:1.5~1.9mmol/L;反應體系的終體積優選為20μL。

上述方法的步驟3)中,PCR擴增條件為:95℃預變性8~12分鐘,然后95℃15~30秒,60℃退火50~70秒,39~49個循環,于60℃退火步驟末采集熒光信號。

與現有技術相比,本發明的特點在于:

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