[發(fā)明專利]應(yīng)用智能支持向量機對多環(huán)芳烴性質(zhì)/毒性的預(yù)測方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610176440.1 | 申請日: | 2016-03-25 |
| 公開(公告)號: | CN105868540B | 公開(公告)日: | 2018-04-13 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 周真;楊旭;牛訦琛;陳鑫 | 申請(專利權(quán))人: | 哈爾濱理工大學(xué) |
| 主分類號: | G06F19/00 | 分類號: | G06F19/00;G06K9/62 |
| 代理公司: | 哈爾濱市偉晨專利代理事務(wù)所(普通合伙)23209 | 代理人: | 張偉 |
| 地址: | 150080 黑龍江省哈*** | 國省代碼: | 黑龍江;23 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 應(yīng)用 智能 支持 向量 芳烴 性質(zhì) 毒性 預(yù)測 方法 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種分子定量結(jié)構(gòu)-性質(zhì)/活性相關(guān)研究方法,特別是一種智能優(yōu)化方法的應(yīng)用與比較,即一種應(yīng)用智能優(yōu)化支持向量機對多環(huán)芳烴性質(zhì)/毒性定量構(gòu)效的預(yù)測方法。
背景技術(shù)
隨著全球發(fā)展進程的加快,大氣受污染的程度進一步加劇,大氣懸浮顆粒物是影響大氣環(huán)境質(zhì)量和危害人體健康的重要大氣污染物之一。大氣顆粒物與臭氧層破壞、全球變暖、酸雨等環(huán)境問題都有很高的關(guān)聯(lián)性,而且與沙塵暴、光化學(xué)煙霧等嚴重大氣污染都有密切關(guān)系。流行病學(xué)的調(diào)查與研究表明,可吸入顆粒物隨著暴露水平的增加,由急性病、心血管疾病、呼吸系統(tǒng)疾病引發(fā)的死亡率隨之增加(參見Indoor and Outdoor Exposure to Ultrafine, Fine and Microbiologically Derived Particulate Matter Related to Cardiovascular and Respiratory Effects in a Panel of Elderly Urban Citizens,Dorina G K, Michal S, Marie F, et al.2015.)。并能引起哮喘、肺功能下降、呼吸系統(tǒng)炎癥,甚至累及心血管系統(tǒng)、神經(jīng)系統(tǒng)、免疫系統(tǒng),促使癌癥發(fā)生。大氣顆粒物對人體健康的危害主要跟其理化性質(zhì)有關(guān),包括顆粒物的粒徑、化學(xué)組分、數(shù)量、結(jié)構(gòu)等,其中有機化學(xué)組分是主要影響因素。有機物是大氣顆粒的重要化學(xué)組分,約占其干重的10~70%(參見Persistent Organic Pollutants (POPs) on Fine and Coarse Atmospheric Particles Measured at Two (Urban and Industrial) Sites,Mustafa O, Banu C, Abdurrahman B.2015.)。其中,在健康影響中最為關(guān)注的是多環(huán)芳烴(PAHs),及其衍生物等。近年來,研究表明城市顆粒物尤其是交通源顆粒物表面含有大量且多種多環(huán)芳烴及多環(huán)芳烴的衍生物。因此,研究多環(huán)芳烴及多環(huán)芳烴衍生物對人體的影響也成為無法忽略的方向,促使更多的學(xué)者認識到多環(huán)芳烴類化合物在大氣顆粒物生物毒性方面的重要作用,并在控制大氣污染物排放時,需重視PAHs的控制。
現(xiàn)有的多環(huán)芳烴的毒性測試多用于動物實驗,但動物實驗存在著高成本、人畜共患病、倫理問題等眾多弊端(參見Toxicity of sediment-associated unresolved complex mixture and its impact on bioavailability ofpolycyclic aromatic hydrocarbons,Juan D, W. T Mr, Michael J. L, et al.2012.)。為解決動物實驗的檢測瓶頸問題,定量構(gòu)效技術(shù)出現(xiàn)于世并逐漸發(fā)展起來。定量構(gòu)效關(guān)系(Quantitative Structure Property / Activity Relationship,QSP/AR),其核心思想是利用理論計算方法來描述化合物的結(jié)構(gòu)特征,以生物學(xué)來獲取化合物的毒性數(shù)據(jù)及任何化合物的致毒機理(參見Large-Scale Quantitative Structure?Property Relationship (QSPR) Analysis of Methane Storage in Metal?Organic Frameworks,Michael F, Tom K. W, Cr E. Wilmer, et al.2013)。通過模型的建立以分子結(jié)構(gòu)來表征化合物的性質(zhì)或毒性。通常定量構(gòu)效建模方法分為傳統(tǒng)統(tǒng)計預(yù)測、經(jīng)驗非線性預(yù)測和機器學(xué)習(xí)等幾類途徑。由此可以看到,用來進行定量構(gòu)效的建模方法經(jīng)歷了一個由簡單到復(fù)雜,從線性到非線性的變化過程,并且正向著高維度、貧信息等方向發(fā)展。然而,支持向量機方法的應(yīng)用中,僅僅是與其他方法進行對比研究,沒有很好地考慮到支持向量機參數(shù)的選擇好壞,這樣就造成了不準確的參數(shù)的引入導(dǎo)致泛化能力的下降。如何確立最佳的支持向量參數(shù),建立一種智能優(yōu)化的支持向量機方法,并將其應(yīng)用到多環(huán)芳烴的性質(zhì)/毒性的預(yù)測成為發(fā)展趨勢。
基于以上現(xiàn)狀,為了解決上述問題,本發(fā)明的目的是提供了一種應(yīng)用智能優(yōu)化支持向量機對多環(huán)芳烴性質(zhì)/毒性定量構(gòu)效的預(yù)測方法。該方法能夠?qū)χС窒蛄繖C的參數(shù)進行智能優(yōu)化,擇最佳參數(shù)建立模型,用于多環(huán)芳烴的定量結(jié)構(gòu)-性質(zhì)/毒性相關(guān)研究,可預(yù)測出多環(huán)芳烴性質(zhì)/毒性值。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明是通過以下技術(shù)方案來解決的:
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- 專利分類
G06F 電數(shù)字數(shù)據(jù)處理
G06F19-00 專門適用于特定應(yīng)用的數(shù)字計算或數(shù)據(jù)處理的設(shè)備或方法
G06F19-10 .生物信息學(xué),即計算分子生物學(xué)中的遺傳或蛋白質(zhì)相關(guān)的數(shù)據(jù)處理方法或系統(tǒng)
G06F19-12 ..用于系統(tǒng)生物學(xué)的建?;蚍抡妫纾焊怕誓P突騽討B(tài)模型,遺傳基因管理網(wǎng)絡(luò),蛋白質(zhì)交互作用網(wǎng)絡(luò)或新陳代謝作用網(wǎng)絡(luò)
G06F19-14 ..用于發(fā)展或進化的,例如:進化的保存區(qū)域決定或進化樹結(jié)構(gòu)
G06F19-16 ..用于分子結(jié)構(gòu)的,例如:結(jié)構(gòu)排序,結(jié)構(gòu)或功能關(guān)系,蛋白質(zhì)折疊,結(jié)構(gòu)域拓撲,用結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的藥靶,涉及二維或三維結(jié)構(gòu)的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)的,例如:基因型–表型關(guān)聯(lián),不均衡連接,種群遺傳學(xué),結(jié)合位置鑒定,變異發(fā)生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質(zhì)相互作用或蛋白質(zhì)核酸的相互作用
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