[發明專利]甲胎蛋白核酸適體AFP5及其制備方法在審
| 申請號: | 201610176171.9 | 申請日: | 2016-03-25 |
| 公開(公告)號: | CN105602958A | 公開(公告)日: | 2016-05-25 |
| 發明(設計)人: | 徐大鵬 | 申請(專利權)人: | 徐大鵬 |
| 主分類號: | C12N15/115 | 分類號: | C12N15/115;G01N33/68 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 蛋白 核酸 afp5 及其 制備 方法 | ||
技術領域
本發明屬于甲胎蛋白檢測技術領域,涉及一種核酸,特別是涉及高特異性和高親 和力的甲胎蛋白核酸適體及其制備方法。
背景技術
甲胎蛋白(AFP)是一種糖蛋白,正常情況下,這種蛋白主要來自胚胎的肝細胞,胎 兒出生后約兩周甲胎蛋白從血液中消失,因此正常人血清中甲胎蛋白的含量尚不到20微 克/升。甲胎蛋白在產婦羊水或母體血漿中AFP可用于胎兒產前監測。如在神經管缺損、脊柱 裂、無腦兒等時,AFP可由開放的神經管進入羊水而導致其在羊水中含量顯著升高。胎兒在 宮腔內死亡、畸胎瘤等先天缺陷亦可有羊水中AFP增高。AFP可經羊水部分進入母體血循環。 在85%脊柱裂及無腦兒的母體,血漿AFP在妊娠16-18周可見升高而有診斷價值,但必須與臨 床經驗結合,以免出現假陽性的錯誤。
檢測甲胎蛋白的方法有好幾種,放射免疫法測得的甲胎蛋白大于甲胎蛋白500 微克/升、且持續4周者,或甲胎蛋白在200~500微克/升、持續8周者,在排除其它引起甲胎 蛋白增高的因素如急、慢性肝炎、肝炎后肝硬化、胚胎瘤、消化道癌癥后,需再結合定位檢 查,如B超、CT、磁共振(MRI)和肝血管造影等即可作出診斷。不過,正常懷孕的婦女、少數肝 炎和肝硬化、生殖腺惡性腫瘤等情況下甲胎蛋白也會升高,但升高的幅度不如肝癌那樣高。 肝硬化病人血清甲胎蛋白濃度多在25~200微克/升之間,一般在2個月內隨病情的好轉而 下降,多數不會超過2個月;同時伴有轉氨酶升高,當轉氨酶下降后甲胎蛋白也隨之下降,血 清甲胎蛋白濃度常與轉氨酶呈平行關系。如果甲胎蛋白濃度在500微克/升以上,雖有轉 氨酶升高,但肝癌的可能性大,轉氨酶下降或穩定,而甲胎蛋白上升,也應高度懷疑肝癌。目 前甲胎蛋白的檢測方法有三大類:色譜法、免疫學法、循環酶法。色譜法靈敏度高、特異性 好,但樣品處理、分離條件、色譜柱制備諸多變異,使其難以標準化;而且HPLC設備價格昂 貴、技術條件要求高,需專門的維護人員,使其推廣困難。免疫學法需要還原游離AFP形式, 抗體熒光分析法和比濁法不能直接檢測游離型同型半胱胺酸,只能檢測血漿總同型半胱胺 酸,用還原劑在37℃半小時卵育對血樣進行還原處理。免疫學法需一小時以上才能出結果, 操作步驟繁瑣,因為需要進行還原處理可受一些不確定的因素影響。循環酶法過程繁瑣,且 檢測限低、產生誤差較大,價格昂貴,故得不到推廣。
核酸適配體是近年發展起來的一類新型識別分子,近年來受到科學家的廣泛關 注,大量針對重要生理活性分子的核酸適配體被篩選出來;各種基于核酸適配體的分析方 法和技術已被報道;核酸適配體藥物“Macugen”也已于2005年被FDA正式批準上市。SELEX技 術篩選得到的寡核苷酸序列被稱為適配子,國內其翻譯為核酸適體、核酸適配子、核酸識 體或核酸適配體等。SELEX技術是指應用化學法合成大容量的隨機寡核苷酸(由兩端的固 定序列和中間的隨機序列組成)文庫,通過施加選擇壓力(結合靶目標,淘選與靶目標高度 特異結合片段的過程),并結合體外擴增技術,經過多輪的循環選擇富集,獲得與靶物質 高度特異結合的寡核苷酸分子,可以是RNA也可以是DNA,長度一般為25~60個核苷酸。
由上可知,核酸適體與靶物質結合所呈現的高敏感性和高特異性,使其在疾病診 斷中具有良好的應用前景,盡管目前成熟的臨床應用報道較少,但應用適體檢測甲胎蛋 白的研究卻不斷增多,基于適體的檢測新技術也不斷出現。但是目前基于核酸適體的針對 于甲胎蛋白的高效特異性識別研究還很缺乏,且針對于甲胎蛋白的核酸適體及其篩選制備 方法尚未見有報道。
發明內容
本發明要解決的技術問題是克服現有的甲胎蛋白檢測技術的不足,填補還未見甲 胎蛋白的核酸適體及其篩選制備方法空白,提供一種甲胎蛋白核酸適體及其制備方法,本 發明所提供的核酸適體命名AFP5。
本發明的方案是通過這樣實現的:一種甲胎蛋白核酸適體,其特征在于,所述核酸 適體的核苷酸序列其序列為:gggctgcctaatcgtatatagcatcctactgacgttcacc tctgcggttgactggtcgt。
以上所述甲胎蛋白核酸適體的衍生物,所述衍生物包括以下四種中的任意一種:
(1)將權利要求1中所述核酸適體任意位置上的堿基A、T、C或G置換成稀有堿基甲基化 嘌呤、二氫尿嘧啶或次黃嘌呤后,得到的核酸適體衍生物;
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