[發明專利]一種豬Oct4基因插入/缺失的檢測方法及其應用有效
| 申請號: | 201610171698.2 | 申請日: | 2016-03-23 |
| 公開(公告)號: | CN105779594B | 公開(公告)日: | 2020-04-28 |
| 發明(設計)人: | 潘傳英;任發;于帥;陳瑞;曾文先;呂曉燕;陶明亮 | 申請(專利權)人: | 西北農林科技大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888 |
| 代理公司: | 西安通大專利代理有限責任公司 61200 | 代理人: | 陸萬壽 |
| 地址: | 712100 陜*** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 種豬 oct4 基因 插入 缺失 檢測 方法 及其 應用 | ||
1.一種豬Oct4基因插入/缺失的檢測方法,其特征在于:包括以下步驟:以待測大白豬公豬全基因組DNA為模板,以引物對P1為引物,通過PCR擴增豬Oct4基因片段,該片段包含豬Oct4基因12-bp插入/缺失多態性位點,所述12-bp插入/缺失多態性位點為大白豬公豬睪丸繁殖性狀的DNA標記;對PCR擴增得到的片段進行瓊脂糖凝膠電泳;根據瓊脂糖凝膠電泳結果確定待測公豬在所述12-bp插入/缺失多態性位點的多態性;所述12-bp插入/缺失多態性位點的多態性為:插入/插入基因型表現為一條344bp帶紋,缺失/缺失基因型表現一條332bp帶紋,插入/缺失基因型表現為344bp和332bp兩條帶紋;
所述引物對P1為:
上游引物:5’-CTTCCACTTGGCTACTTCTTT-3’;
下游引物:5’-GCTGTGGCATAGGTTTGAT-3’。
2.根據權利要求1所述一種豬Oct4基因插入/缺失的檢測方法,其特征在于:所述PCR的擴增反應程序為:
1)95.0℃預變性3min,然后進入步驟2);
2)95.0℃變性30s,60℃復性60s,72.0℃延伸40s,共35個循環;
3)經過步驟2)后,72.0℃延伸10min。
3.根據權利要求1所述一種豬Oct4基因插入/缺失的檢測方法,其特征在于:所述瓊脂糖凝膠電泳采用的瓊脂糖凝膠的質量濃度為3.5%。
4.一種豬Oct4基因插入/缺失的檢測試劑盒,其特征在于:該試劑盒包括用于PCR擴增豬Oct4基因中12-bp插入/缺失多態性位點的引物對P1,所述12-bp插入/缺失多態性位點為大白豬公豬睪丸繁殖性狀的DNA標記,所述引物對P1為:
上游引物:5’-CTTCCACTTGGCTACTTCTTT-3’;
下游引物:5’-GCTGTGGCATAGGTTTGAT-3’;
所述12-bp插入/缺失多態性位點的多態性為:插入/插入基因型表現為一條344bp帶紋,缺失/缺失基因型表現一條332bp帶紋,插入/缺失基因型表現為344bp和332bp兩條帶紋。
5.一種如權利要求1所述豬Oct4基因插入/缺失的檢測方法在公豬分子標記輔助選擇育種中的應用。
6.根據權利要求5所述的應用,其特征在于:所述公豬睪丸繁殖性狀為睪丸重、睪丸長周長或睪丸短周長指數。
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