[發明專利]sRNA分析系統及方法在審
| 申請號: | 201610124755.1 | 申請日: | 2016-03-04 |
| 公開(公告)號: | CN105740652A | 公開(公告)日: | 2016-07-06 |
| 發明(設計)人: | 鄭洪坤;孔關義;劉翔 | 申請(專利權)人: | 北京百邁客生物科技有限公司 |
| 主分類號: | G06F19/22 | 分類號: | G06F19/22;G06F19/24 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產權代理有限公司 11002 | 代理人: | 李相雨 |
| 地址: | 101300 北京市順*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | srna 分析 系統 方法 | ||
技術領域
本發明涉及生物信息分析技術領域,特別涉及一種sRNA分析系統及方法。
背景技術
隨著高通量測序技術在醫療、健康、醫藥、環境、能源等相關領域的廣泛應用,生物大數據時代已經到來。SmallRNA是一種小的非編碼RNA,長度為18-30個核苷酸,幾乎存在于所有的生物體中,包括:miRNA、siRNA和piRNA。SmallRNA通過多種多樣的作用途徑,包括mRNA降解、翻譯抑制、異染色質形成以及DNA去除,來調控生物體的生長發育和疾病發生,在人、動植物的轉錄和轉錄后調控過程中起著重要的作用。
sRNA測序得到的高通量原始數據是長度不等的序列,要通過生物信息學工具把這些序列比對到已有的基因組或者相近物種基因組序列上,并進一步分析得到有生物學意義的結果。在傳統的測序公司分析流程中,客戶的分析需求需要在客戶、測序公司的客服及生物信息分析人員之間進行溝通交流,以確定分析方案。最后客戶得到分析結果后又會產生進一步的分析需求,但大部分客戶限于專業知識及分析條件,沒有計算資源,無法獨立完成需要的分析,需要再次與測序公司溝通,進行更進一步的分析。
因此在現有的分析流程下,客戶的分析需求可能由于中間的溝通環節被誤解甚至丟失,并且數據分析的周期也被拉的很長,數據處理效率低,用戶無法靈活的處理自己的測序數據。
發明內容
為解決上述技術問題,本發明一方面提出了一種sRNA分析系統,所述系統包括:
用戶請求分析模塊,用于獲取用戶的sRNA分析請求以及指定分析數據,并根據所述sRNA分析請求以及指定分析數據進行分析,以獲取sRNA分析的流程定制分析結果;
數據挖掘展示模塊,用于根據所述流程定制分析結果進行sRNA分析,并以文字及圖表形式展示所述sRNA分析的結果。
優選地,還包括:
云端數據庫,用于存儲測序數據以及所述sRNA分析的結果數據;
所述sRNA分析請求用于從所述云端數據庫中選擇指定的數據作為sRNA分析使用數據。
優選地,所述用戶請求分析模塊包括:
任務生成模塊,用于接收所述sRNA分析請求中用戶設定的分析內容,根據該分析內容生成對所述sRNA分析使用數據進行分析的操作任務。
優選地,所述系統還包括:
分析軟件庫,用于存儲各種分析軟件;
相應地,所述數據挖掘展示模塊還包括:
任務調度模塊,用于接收所述操作任務,并調用所述分析軟件庫中的相應分析軟件執行所述操作任務。
優選地,所述指定分析數據包括原始sRNA高通量測序數據以及對所述原始sRNA高通量測序數據進行一種或多種處理或分析之后得到的結果數據。
另一方面,本發明還提供了一種sRNA分析方法,所述方法包括:
獲取用戶的sRNA分析請求以及指定分析數據,并根據所述sRNA分析請求以及指定分析數據進行分析,以獲取sRNA分析的流程定制分析結果;
根據所述流程定制分析結果進行sRNA分析,并以文字及圖表形式展示所述sRNA分析的結果。
優選地,所述獲取用戶的sRNA分析請求以及指定分析數據,并根據所述sRNA分析請求以及指定分析數據進行分析,以獲取sRNA分析的流程定制分析結果之前,所述方法還包括:
設置用于存儲測序數據以及所述sRNA分析的結果數據的云端數據庫;
所述sRNA分析請求用于從所述云端數據庫中選擇指定的數據作為sRNA分析使用數據。
優選地,所述獲取用戶的sRNA分析請求以及指定分析數據,并根據所述sRNA分析請求以及指定分析數據進行分析,以獲取sRNA分析的流程定制分析結果,包括:
接收所述sRNA分析請求中用戶設定的分析內容,根據該分析內容生成對所述sRNA分析使用數據進行分析的操作任務。
優選地,所述根據所述流程定制分析結果進行sRNA分析,并以文字及圖表形式展示所述sRNA分析的結果之前,所述方法還包括:
設置存儲各種分析軟件的分析軟件庫;
相應地,所述根據所述流程定制分析結果進行sRNA分析,并以文字及圖表形式展示所述sRNA分析的結果,還包括:
接收所述操作任務,并調用所述分析軟件庫中的相應分析軟件執行所述操作任務。
優選地,所述指定分析數據包括原始sRNA高通量測序數據以及對所述原始sRNA高通量測序數據進行一種或多種處理或分析之后得到的結果數據。
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