[發(fā)明專利]一種扇貝足絲蛋白體外表達(dá)方法及應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610109787.4 | 申請日: | 2016-02-29 |
| 公開(公告)號: | CN105647937A | 公開(公告)日: | 2016-06-08 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 劉偉治;徐平平;苗艷;包振民;王師;張玲玲;甘旭華 | 申請(專利權(quán))人: | 中國海洋大學(xué);青島衛(wèi)遼醫(yī)用生物材料有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/12 | 分類號: | C12N15/12;C12N15/70;C07K14/435 |
| 代理公司: | 北京國智京通知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11501 | 代理人: | 孫文彬 |
| 地址: | 266003*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 扇貝 蛋白 體外 表達(dá) 方法 應(yīng)用 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及生物材料領(lǐng)域,特別是一種扇貝足絲蛋白體外表達(dá)方法及應(yīng) 用。
背景技術(shù)
浩瀚的海洋是一座巨型生物寶庫,包含著成千上萬的已知或未知的陸生 生物所不具有的獨(dú)特的生物資源。許多海洋生物在漫長的進(jìn)化過程中形成了 各種各樣的黏附作用以適應(yīng)和對抗動態(tài)的海洋環(huán)境,這在潮間帶的生物類群 中表現(xiàn)尤為突出。海洋無脊椎動物可暫時或永久性的吸附于各種生物或物體 表面,它們進(jìn)化出了獨(dú)特的黏附機(jī)制以促進(jìn)吸附作用。海洋多毛類 Phragmatopomacalifornica能夠用分泌出的蛋白黏附劑混合海底的貝殼及沙 粒制造保護(hù)性的管子。這種黏附劑可以廣泛黏附海洋中的多種材料。刺參 Holothuriaforskali在受到驚嚇時可以防御性地排出許多管狀物(Cuvierian tubules),生化鑒定表明這些管狀物所含蛋白質(zhì)與糖類的比例為3比2,并且 所含的不溶性蛋白比例很大。可溶性的蛋白包括十種富含酸性氨基酸的蛋白, 分子量從17到220kD。藤壺直接永久性地黏附于海洋水下基質(zhì)表面(船體, 采油平臺及管道等)。藤壺幼蟲的初始黏附是通過氧醌連接將二羥苯丙氨酸 (多巴,Dopa)組裝在一起,這也包括海洋貽貝Mytilusspp.的黏附蛋白, 而成體的黏合劑實(shí)質(zhì)上與幼體有很大差別,其中富含絲氨酸、蘇氨酸和甘氨 酸。這三組蛋白質(zhì)中疏水性和親水性的殘基交替排列,這些基序被認(rèn)為是在 海水中蛋白的裝配中起著重要的作用。海水及淡水貽貝科黏附蛋白與藤壺的 黏合蛋白有所不同,因?yàn)樗陌被峄蚺c藤壺不同(主要以含有大量 多酚蛋白成分為特征),貽貝黏附蛋白含有大量的修飾過的3,4-Dopa,以及 對特定氨基酸的化學(xué)修飾(羥基化)。目前從紫貽貝M.edulis中已鑒定出至 少十種與黏附作用相關(guān)的蛋白,這也反映出了對這種生物黏附結(jié)構(gòu)研究的得 心應(yīng)手,以及其作為仿生學(xué)研究目標(biāo)的趨勢。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于提供一種扇貝足絲蛋白體外表達(dá)方法及應(yīng)用,以提供 生物仿生研究思路,為生物材料拓展新的研究方向。
為實(shí)現(xiàn)上述技術(shù)目的,達(dá)到上述技術(shù)效果,本發(fā)明公開了一種扇貝足絲 蛋白體外表達(dá)方法,其特征在于,包括了蛋白的質(zhì)譜鑒定,具體操作步驟如 下:
扇貝足絲蛋白的采集:將市售的櫛孔扇貝培養(yǎng)在19℃恒溫循環(huán)海水的條 件下,每隔一天用干凈手術(shù)刀片對黏附在培養(yǎng)籠中的足絲纖維蛋白進(jìn)行刮取, 進(jìn)行足絲全蛋白的收集,收集到的足絲纖維置于-20℃冰箱內(nèi)保存;
扇貝足絲蛋白的粗提取:將收集到的扇貝足絲蛋白干粉在液氮中研磨成 粉末,分裝到1.5mLEP管中,加入30μL5%醋酸-鹽酸胍裂解液,37℃金屬浴 抽提足絲蛋白30分鐘,然后于20,000g4℃高速離心30分鐘,取上清,作為 扇貝足絲黏附蛋白粗提液;
蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定:將提取的蛋白質(zhì)透析濃縮后按照每100μg蛋白質(zhì)底物 加入3.3μg酶的比例加入1μg/uL的Trypsin,37℃水浴24小時,利用 Q-Exactive質(zhì)譜儀檢測消化后得到的肽段溶液中的肽段信號,以實(shí)驗(yàn)室自己 建立的櫛孔扇貝足轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫為模板,對質(zhì)譜檢測到的肽段序列進(jìn)行搜索;
體外表達(dá):基于足轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫對應(yīng)的ORF,進(jìn)行引物設(shè)計(jì),利用PCR技 術(shù)獲得目的片段,構(gòu)建其中針對第一段重復(fù)序列的體外重組表達(dá)系統(tǒng),DNA測 序驗(yàn)證體外重組表達(dá)系統(tǒng)構(gòu)建成功,之后轉(zhuǎn)化到大腸桿菌宿主菌中進(jìn)行體外 重組表達(dá)。
其中,足絲蛋白中富含PCGGXC(X為任意氨基酸殘基)及CVC片段的多 肽序列。
其中,重組表達(dá)后的蛋白提取方法如下:
將菌體超聲破碎,之后沉淀用PBS洗兩次后1M尿素洗兩次,將沉淀用20mM Tris-HCl/6M(pH8.0)尿素溶解,室溫結(jié)合NickelsBeads(Qiagen)3小 時,20mMTris-HCl/6M尿素(pH8.0)wash,5%HAc/6M尿素(pH3.6)洗 脫,將洗脫后的樣品透析到超純水中,冷凍干燥制備蛋白質(zhì)樣品。
本發(fā)明同時公開了上述扇貝足絲蛋白在醫(yī)用材料制備領(lǐng)域的應(yīng)用。
本發(fā)明亦同時公開了上述扇貝足絲蛋白在紡織材料制備領(lǐng)域的應(yīng)用。 本發(fā)明具有以下有益效果:
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