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[發明專利]一種胎兒染色體文庫構建的試劑盒、方法及其應用有效

專利信息
申請號: 201610094500.5 申請日: 2016-02-19
公開(公告)號: CN105624798B 公開(公告)日: 2019-09-10
發明(設計)人: 陳勇;張夢玲;謝文龍;王玲 申請(專利權)人: 北京愛普益醫學檢驗中心有限公司
主分類號: C40B50/06 分類號: C40B50/06;C12Q1/6869
代理公司: 暫無信息 代理人: 暫無信息
地址: 100176 北京市大興*** 國省代碼: 北京;11
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 胎兒 染色體 文庫 構建 試劑盒 方法 及其 應用
【權利要求書】:

1.一種胎兒染色體文庫構建的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括:用于DNA提取的 試劑和用于DNA文庫構建的試劑。

2.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述用于DNA提取的試劑包括:游離DNA 提取試劑、游離DNA沉淀試劑、游離DNA漂洗試劑;

優選地,所述用于DNA文庫構建的試劑包括:DNA末端修復試劑、連接修復DNA的接頭試 劑、PCR擴增引物和純化文庫的試劑;

優選地,所述試劑盒還包括用于收集提取DNA的離心柱、用于洗脫DNA與文庫的超純水 和磁珠懸浮液。

3.根據權利要求1或2所述的試劑盒,其特征在于,所述游離DNA提取試劑包括:0.02- 0.2MTris-HCl緩沖液、100-500μg/mL蛋白酶K、0.01-0.1MEDTA和0.05-0.3%Triton-100;

優選地,所述游離DNA沉淀試劑為有機溶劑,優選為甲醇、無水乙醇或異丙醇中的任意 一種或至少兩種的混合;

優選地,所述游離DNA漂洗試劑包括:0.02-0.2MTris-HCl緩沖液、2-10M異硫氰酸胍和 0.4-3MNaCl。

4.根據權利要求1-3中任一項所述的試劑盒,其特征在于,所述DNA末端修復試劑包括: 0.02-0.2MTris-HCl緩沖液、0.05-0.2U/μLTaqDNA聚合酶、10-100mMMgCl2和50-200mM KCl;

優選地,所述連接修復DNA的接頭試劑包括:10-100mMTris-HCl緩沖液、0.01-0.5mM T4DNA連接酶和0.1-1μM連接接頭;

優選地,所述PCR擴增引物為常規的通用引物和index引物;

優選地,所述通用物的核苷酸序列包含如SEQIDNO.1所示的片段;

優選地,所述index引物的核苷酸序列包含如SEQIDNO.1-12所示的片段;

優選地,所述PCR擴增引物的濃度為0.02-0.5mM;

優選地,所述純化文庫的試劑為磁珠懸浮液。

5.一種使用如權利要求1-4中任一項所述的試劑盒用于構建胎兒染色體高通量測序文 庫的方法,其特征在于,包括如下步驟:

1)提取待測樣本的DNA;

2)將步驟(1)得到的DNA進行PCR構建高通量測序文庫。

6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述待測樣本為母體外周血、尿液、腦脊 液、血清、唾液或是宮頸灌洗液中的任意一種或至少兩種的混合;

優選地,所述待測樣本的母體的孕周為12-24周。

7.根據權利要求5或6所述的方法,其特征在于,步驟(1)所述提取待測樣本的DNA包括 如下步驟:

(1)取300-500μL待測樣品,加入300-600μL,優選400-550μL游離DNA提取試劑,45-65 ℃,優選50-60℃水浴保溫5-20min,優選8-15min;

(2)加入300-600μL,優選400-550μL游離DNA沉淀試劑,室溫孵育1-10min,優選3-8min 后轉移至離心柱中;

(3)離心棄廢液,加入300-600μL,優選400-550μL游離DNA漂洗試劑,離心棄廢液,重復 該步驟一次;

(4)取出離心柱,轉移至干凈的收集管中,打開離心柱管蓋,室溫晾干1-10min,優選3- 8min;

(5)加入10-100μL,優選20-50μL超純水至離心柱中,離心收集游離DNA;

優選地,步驟(3)和步驟(5)所述離心的轉速為8000-15000r/min,優選為1000-13000r/ min,進一步優選為12000r/min;

優選地,步驟(3)和步驟(5)所述離心的時間為20-120s,優選為30-100s,進一步優選為 60s。

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