[發明專利]一種胎兒染色體文庫構建的試劑盒、方法及其應用有效
| 申請號: | 201610094500.5 | 申請日: | 2016-02-19 |
| 公開(公告)號: | CN105624798B | 公開(公告)日: | 2019-09-10 |
| 發明(設計)人: | 陳勇;張夢玲;謝文龍;王玲 | 申請(專利權)人: | 北京愛普益醫學檢驗中心有限公司 |
| 主分類號: | C40B50/06 | 分類號: | C40B50/06;C12Q1/6869 |
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| 地址: | 100176 北京市大興*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 胎兒 染色體 文庫 構建 試劑盒 方法 及其 應用 | ||
1.一種胎兒染色體文庫構建的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括:用于DNA提取的 試劑和用于DNA文庫構建的試劑。
2.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述用于DNA提取的試劑包括:游離DNA 提取試劑、游離DNA沉淀試劑、游離DNA漂洗試劑;
優選地,所述用于DNA文庫構建的試劑包括:DNA末端修復試劑、連接修復DNA的接頭試 劑、PCR擴增引物和純化文庫的試劑;
優選地,所述試劑盒還包括用于收集提取DNA的離心柱、用于洗脫DNA與文庫的超純水 和磁珠懸浮液。
3.根據權利要求1或2所述的試劑盒,其特征在于,所述游離DNA提取試劑包括:0.02- 0.2MTris-HCl緩沖液、100-500μg/mL蛋白酶K、0.01-0.1MEDTA和0.05-0.3%Triton-100;
優選地,所述游離DNA沉淀試劑為有機溶劑,優選為甲醇、無水乙醇或異丙醇中的任意 一種或至少兩種的混合;
優選地,所述游離DNA漂洗試劑包括:0.02-0.2MTris-HCl緩沖液、2-10M異硫氰酸胍和 0.4-3MNaCl。
4.根據權利要求1-3中任一項所述的試劑盒,其特征在于,所述DNA末端修復試劑包括: 0.02-0.2MTris-HCl緩沖液、0.05-0.2U/μLTaqDNA聚合酶、10-100mMMgCl2和50-200mM KCl;
優選地,所述連接修復DNA的接頭試劑包括:10-100mMTris-HCl緩沖液、0.01-0.5mM T4DNA連接酶和0.1-1μM連接接頭;
優選地,所述PCR擴增引物為常規的通用引物和index引物;
優選地,所述通用物的核苷酸序列包含如SEQIDNO.1所示的片段;
優選地,所述index引物的核苷酸序列包含如SEQIDNO.1-12所示的片段;
優選地,所述PCR擴增引物的濃度為0.02-0.5mM;
優選地,所述純化文庫的試劑為磁珠懸浮液。
5.一種使用如權利要求1-4中任一項所述的試劑盒用于構建胎兒染色體高通量測序文 庫的方法,其特征在于,包括如下步驟:
1)提取待測樣本的DNA;
2)將步驟(1)得到的DNA進行PCR構建高通量測序文庫。
6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述待測樣本為母體外周血、尿液、腦脊 液、血清、唾液或是宮頸灌洗液中的任意一種或至少兩種的混合;
優選地,所述待測樣本的母體的孕周為12-24周。
7.根據權利要求5或6所述的方法,其特征在于,步驟(1)所述提取待測樣本的DNA包括 如下步驟:
(1)取300-500μL待測樣品,加入300-600μL,優選400-550μL游離DNA提取試劑,45-65 ℃,優選50-60℃水浴保溫5-20min,優選8-15min;
(2)加入300-600μL,優選400-550μL游離DNA沉淀試劑,室溫孵育1-10min,優選3-8min 后轉移至離心柱中;
(3)離心棄廢液,加入300-600μL,優選400-550μL游離DNA漂洗試劑,離心棄廢液,重復 該步驟一次;
(4)取出離心柱,轉移至干凈的收集管中,打開離心柱管蓋,室溫晾干1-10min,優選3- 8min;
(5)加入10-100μL,優選20-50μL超純水至離心柱中,離心收集游離DNA;
優選地,步驟(3)和步驟(5)所述離心的轉速為8000-15000r/min,優選為1000-13000r/ min,進一步優選為12000r/min;
優選地,步驟(3)和步驟(5)所述離心的時間為20-120s,優選為30-100s,進一步優選為 60s。
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