[發明專利]基于AllGlo探針的rs3909184檢測分型試劑盒及其分型方法

在審

• 申請號: 201610083676.0
• 申請日: 2016-02-06
• 公開（公告）號: CN105483279A
• 公開（公告）日: 2016-04-13
• 發明（設計）人: 張忠英;方宜臻
• 申請（專利權）人: 廈門大學附屬中山醫院;張忠英
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 廈門南強之路專利事務所(普通合伙) 35200
• 代理人: 馬應森

技術領域

本發明涉及單核苷酸多態性(SNP)，尤其是涉及一種基于AllGlo探針的rs3909184檢測分 型試劑盒及其分型方法。

背景技術

單核苷酸多態性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)，主要是指在基因組水平上由單個 核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種。SNPs在 人類基因組中廣泛存在，平均每500～1000個堿基對中就有1個，估計其總數可達300萬個 甚至更多。作為第三代遺傳標志，SNP與人體許多表型差異、藥物易感性與疾病易感性密切 相關。SNP在基因組中的大量存在，使其成為一個強有力的工具，在疾病定位與克隆、藥物 的設計和測試以及生物學的基礎研究中起了非常重要的作用。

個體化診斷治療是未來醫學發展的大方向。將個體化的靶點定位于某個基因，甚至是單 個核苷酸，發現疾病的遺傳標志物，將有助于根據每個患者的不同遺傳背景來開展疾病預防、 診斷和治療。基因的SNP是形成個體間差異的重要遺傳學基礎,通過SNP與疾病和藥物治療 的關聯性分析，使得醫生不僅可以通過所檢測出的SNP預測、確定與疾病有關的基因，同時 也將能夠事先把握患者個體對于某種藥物的反應特點，并根據這一特點選擇治療效果最好， 不良反應等危險性最小的藥物對患者進行精準治療。

SNP在疾病的預防、診斷、治療及個體化醫學發展中扮演著重要的角色，因此準確快速 的進行SNP檢測分型具有重大的意義。目前，SNP分型的方法主要有直接測序技術法、限制 性片段長度多態性技術(RFLP)、Tagman熒光探針法、擴增阻滯突變系統(ARMS)、高 分辨熔解曲線分析法(HRM)等。其中，直接測序法是目前最直觀，準確性相對而言最高的 SNP分型方法，但其步驟多而分散，成本較高，工作量大，周期長，價格昂貴，不適合大樣 本多位點檢測；限制性片段長度多態性技術(RFLP)作為一種最早的DNA標記技術，對儀 器要求低，只需要一臺PCR儀以及電泳儀器即可進行實驗，但其實驗操作繁瑣，檢測周期長， 不適合大樣本檢測；Tagman熒光探針法準確度較好，但其設計合成程序復雜，并且不適合多 位點少量樣本的分型，尤其是頻率偏低的位點；擴增阻滯突變系統(ARMS法)快速、簡便， 但是不能閉管操作，對基因多態性分析難以實現高通量、自動化；高分辨熔解曲線分析法 (HRM)具有簡單、快速等優點，但該方法特異性不足，儀器選擇少。

AllGlo探針作為新一代的熒光探針，在具備TaqMan-MGB探針優點的基礎上，大大提高 信噪比，減少背景熒光信號。目前，AllGlo探針已經成功應用于檢測皰疹病毒、乙型肝炎病 毒基因突變(Feng,Z.L.Yu,X.Y.Lu,Z.M.Geng,D.Y.Zhang,L.Chen,S.J.Rapiddetectionofthe hepatitisBvirusYMDDmutantusingAllGlo^TMprobes[J].ClinChimActa,2011，412(11-12)： 1018-1021)、侵襲性曲霉菌病(Wu,D.S.Shen,J.Z.Zhou,X.Q.Shen,S.F.Wu,X.M.The establishmentandevaluationofdiagnosticaccuracyofAllGlo(TM)probe-basedtechniquesfor invasiveaspergillosis[J].ZhonghuaNeiKeZaZhi,2010,49(2):142-145)。