[發明專利]基于21個線粒體SNP位點的法醫學快速檢測試劑盒有效
| 申請號: | 201610076872.5 | 申請日: | 2016-02-03 |
| 公開(公告)號: | CN105543388B | 公開(公告)日: | 2018-07-31 |
| 發明(設計)人: | 嚴江偉;楊雅冉;楊猛;陳婧 | 申請(專利權)人: | 中國科學院北京基因組研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6869 | 分類號: | C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 100101 北京市朝陽區北辰*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 21 線粒體 snp 法醫學 快速 檢測 試劑盒 | ||
1.一種基于21個線粒體SNP位點的法醫學快速檢測試劑盒,其特征在于:所述的法醫學快速檢測試劑盒包括⑴富集引物的混合物,⑵21條單堿基延伸引物混合物,⑶擴增試劑:dNTPs和快速Taq聚合酶,⑷核酸純化柱,⑸SNaPshot反應混合液,⑹Hi-Di甲酰胺,⑺GeneScanTM Size Standards-120LIZ,⑻陽性對照:DNA 9947A,⑼陰性對照:ddH2O;
所述的富集引物的混合物包括用于擴增線粒體nt25~343、nt365~675、nt16132~16552、nt8158~8488、nt8504~8808和nt10285~10682六個區域的6對富集引物;所述的6對富集引物的序列及工作濃度為:
SEQ ID NO:1,0.31μM SEQ ID NO:2,0.32μM
SEQ ID NO:3,0.30μM SEQ ID NO:4,0.30μM
SEQ ID NO:5,0.36μM SEQ ID NO:6,0.34μM
SEQ ID NO:7,0.31μM SEQ ID NO:8,0.33μM
SEQ ID NO:9,0.32μM SEQ ID NO:10,0.30μM
SEQ ID NO:11,0.34μM SEQ ID NO:12,0.33μM;
所述的21條單堿基延伸引物的序列及工作濃度為:
SEQ ID NO:13,0.21μM SEQ ID NO:14,0.20μM
SEQ ID NO:15,0.22μM SEQ ID NO:16,0.20μM
SEQ ID NO:17,0.20μM SEQ ID NO:18,0.23μM
SEQ ID NO:19,0.25μM SEQ ID NO:20,0.23μM
SEQ ID NO:21,0.20μM SEQ ID NO:22,0.21μM
SEQ ID NO:23,0.22μM SEQ ID NO:24,0.25μM
SEQ ID NO:25,0.20μM SEQ ID NO:26,0.20μM
SEQ ID NO:27,0.21μM SEQ ID NO:28,0.23μM
SEQ ID NO:29,0.22μM SEQ ID NO:30,0.23μM
SEQ ID NO:31,0.23μM SEQ ID NO:32,0.21μM
SEQ ID NO:33,0.25μM。
2.如權利要求1項所述的法醫學快速檢測試劑盒在案件排查、個體識別以及尸源認定中的應用。
3.利用權利要求1所述的快速檢測試劑盒進行個體識別檢測的使用方法, 其特征在于:所述的使用方法包括以下步驟:
⑴.線粒體DNA提取:從待測生物檢材中提取線粒體DNA;
⑵.復合擴增反應:取步驟⑴所得的線粒體DNA作為復合擴增模版,加入富集引物的混合物和擴增試劑,進行單管內復合擴增反應,PCR擴增程序為:94℃預變性5min,94℃變性15s, 55℃退火5s,72℃延伸10s,共30個循環,最后72℃延伸2min,獲得復合擴增產物;
⑶.復合擴增產物純化:用核酸純化柱純化步驟⑵所得的復合擴增產物;
⑷.單堿基延伸反應:取步驟⑶所得的純化后的復合擴增產物,加入單堿基延伸引物混合物和SNaPshot反應混合液,進行單管內單堿基延伸反應,單堿基延伸反應程序為:96℃10s,50℃5s,60℃30s,共20個循環,獲得單堿基延伸產物;
⑸.電泳:取步驟⑷所得的單堿基延伸產物,加入Hi-Di甲酰胺、GeneScanTM SizeStandards-120LIZ,混合均勻后,于95℃變性3min,4℃迅速冷卻后進行熒光電泳檢測和基因型分析。
4.如權利要求3所述的使用方法,其特征在于:所述的使用方法步驟⑷中SNaPshot反應混合液的加入量為1~1.5μL;所述的單堿基延伸反應的總體積為5μL。
5.如權利要求3或4所述的使用方法,其特征在于:所述的使用方法步驟⑷中的純化后的復合擴增產物的加入量為1~5ng。
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