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[發明專利]RNA甲基化測序文庫的構建方法在審

專利信息
申請號: 201610065846.2 申請日: 2016-01-29
公開(公告)號: CN105603536A 公開(公告)日: 2016-05-25
發明(設計)人: 鄧臘梅;朱海浩;李明洲;宋彬彬;齊鑫 申請(專利權)人: 北京諾禾致源生物信息科技有限公司
主分類號: C40B50/06 分類號: C40B50/06
代理公司: 北京康信知識產權代理有限責任公司 11240 代理人: 趙囡囡;吳貴明
地址: 102200 北京市昌平區*** 國省代碼: 北京;11
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: rna 甲基化 序文 構建 方法
【權利要求書】:

1.一種RNA甲基化測序文庫的構建方法,其特征在于,所述構建方法包括:

步驟S1,對RNA樣品進行片段化,得到片段化RNA;

步驟S2,利用RNA甲基化特異性抗體對所述片段化RNA進行免疫共沉淀,得到沉淀物;

步驟S3,利用蛋白酶對所述沉淀物進行消化,得到消化物;

步驟S4,從所述消化物中提取RNA并對提取的RNA進行逆轉錄,得到cDNA;以及

步驟S5,利用所述cDNA進行測序文庫構建,得到所述RNA甲基化測序文庫。

2.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,所述蛋白酶選擇蛋白酶K、木瓜蛋白酶 或者胃蛋白酶。

3.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,所述步驟S1中,采用化學法對所述RNA 進行片段化,得到所述片段化RNA。

4.根據權利要求3所述的構建方法,其特征在于,所述片段化RNA的長度為50~200nt。

5.根據權利要求3或4中任一項所述的構建方法,其特征在于,采用含Zn2+的鹽溶液對所 述RNA進行片段化。

6.根據權利要求5所述的構建方法,其特征在于,所述含Zn2+的鹽溶液中Zn2+的摩爾濃度 為5~10mol/L。

7.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,所述RNA甲基化特異性抗體為特異識 別RNA中m7G、Nm、m5C、m6A以及m6Am中任一種甲基化的抗體。

8.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,在所述步驟S4中,從所述消化物中提 取RNA的步驟包括采用trizol和氯仿對所述消化物進行抽提,得到上清RNA的步驟。

9.根據權利要求8所述的構建方法,其特征在于,所述trizol和氯仿的體積比為4~6: 1。

10.根據權利要求8所述的構建方法,其特征在于,從所述消化物中提取RNA的步驟在得 到所述上清RNA的步驟后,還包括:用醋酸鈉和異丙醇對所述上清RNA進行沉淀過夜,得到所 述提取的RNA。

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