[發明專利]RNA甲基化測序文庫的構建方法在審
| 申請號: | 201610065846.2 | 申請日: | 2016-01-29 |
| 公開(公告)號: | CN105603536A | 公開(公告)日: | 2016-05-25 |
| 發明(設計)人: | 鄧臘梅;朱海浩;李明洲;宋彬彬;齊鑫 | 申請(專利權)人: | 北京諾禾致源生物信息科技有限公司 |
| 主分類號: | C40B50/06 | 分類號: | C40B50/06 |
| 代理公司: | 北京康信知識產權代理有限責任公司 11240 | 代理人: | 趙囡囡;吳貴明 |
| 地址: | 102200 北京市昌平區*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | rna 甲基化 序文 構建 方法 | ||
1.一種RNA甲基化測序文庫的構建方法,其特征在于,所述構建方法包括:
步驟S1,對RNA樣品進行片段化,得到片段化RNA;
步驟S2,利用RNA甲基化特異性抗體對所述片段化RNA進行免疫共沉淀,得到沉淀物;
步驟S3,利用蛋白酶對所述沉淀物進行消化,得到消化物;
步驟S4,從所述消化物中提取RNA并對提取的RNA進行逆轉錄,得到cDNA;以及
步驟S5,利用所述cDNA進行測序文庫構建,得到所述RNA甲基化測序文庫。
2.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,所述蛋白酶選擇蛋白酶K、木瓜蛋白酶 或者胃蛋白酶。
3.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,所述步驟S1中,采用化學法對所述RNA 進行片段化,得到所述片段化RNA。
4.根據權利要求3所述的構建方法,其特征在于,所述片段化RNA的長度為50~200nt。
5.根據權利要求3或4中任一項所述的構建方法,其特征在于,采用含Zn2+的鹽溶液對所 述RNA進行片段化。
6.根據權利要求5所述的構建方法,其特征在于,所述含Zn2+的鹽溶液中Zn2+的摩爾濃度 為5~10mol/L。
7.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,所述RNA甲基化特異性抗體為特異識 別RNA中m7G、Nm、m5C、m6A以及m6Am中任一種甲基化的抗體。
8.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,在所述步驟S4中,從所述消化物中提 取RNA的步驟包括采用trizol和氯仿對所述消化物進行抽提,得到上清RNA的步驟。
9.根據權利要求8所述的構建方法,其特征在于,所述trizol和氯仿的體積比為4~6: 1。
10.根據權利要求8所述的構建方法,其特征在于,從所述消化物中提取RNA的步驟在得 到所述上清RNA的步驟后,還包括:用醋酸鈉和異丙醇對所述上清RNA進行沉淀過夜,得到所 述提取的RNA。
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