[發(fā)明專利]一種樣本組合分析核酸序列的方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610060973.3 | 申請日: | 2016-01-29 |
| 公開(公告)號: | CN105678110B | 公開(公告)日: | 2019-03-29 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 肖鵬峰;孫嘯 | 申請(專利權(quán))人: | 東南大學(xué) |
| 主分類號: | G16B30/00 | 分類號: | G16B30/00 |
| 代理公司: | 南京經(jīng)緯專利商標(biāo)代理有限公司 32200 | 代理人: | 樓高潮 |
| 地址: | 210096*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 樣本 組合分析 核酸 序列 方法 | ||
1.一種基于樣本組合分析核酸序列的方法,其特征在于,將需要分析的N個樣本按照特定的樣本組合方式分成M組,其中N﹥3;然后每組按照一個分析樣本實施對特征核酸序列片段分析,含有特征核酸序列片段為陽性、不含有特征核酸序列片段為陰性,最后根據(jù)M組樣本的分析結(jié)果,組合判斷N個樣本中每個具體樣本的分析結(jié)果,包括如下步驟 :
a. N個樣本的分組,即:樣本分組的數(shù)目M通過分析的樣本數(shù)N、每個樣本被分析的次數(shù)y來確定的,其中y≥2,組數(shù)M與N、y的關(guān)系滿足:[M(M-1) (M-2)…(M-y)]/[y(y-1)(y-2)…×2×1]≦N,對每個樣本設(shè)唯一編號,對每組樣本設(shè)唯一的編號、由若干不同樣本等量混勻組成,在選定分析方法的檢測限內(nèi),每組樣本包含的樣本數(shù)最多為yN/M、最少為1,使得同一樣本必須分在不同的y組、且只能分在不同的y個組中,即所有樣本均需在不同的y組樣本中被分析y次;
b. 對每組混合樣本進行分析;
c.確定每個樣本的信息,每個樣本的信息是指根據(jù)M組樣品得到M個分析結(jié)果,每個樣本的信息按照如下方法進行確定:
c-1. M個分析結(jié)果無一組樣本為陽性結(jié)果:N個樣本均為陰性;
c-2. M個分析結(jié)果中有y組樣本為陽性結(jié)果:則N個樣本中只有1個陽性標(biāo)本,其具體樣本編號為樣本陽性信息的y組所共有的樣本編號;
c-3. M個分析結(jié)果中有P組樣本為陽性結(jié)果,其中y≤P≤M:N個樣本中有(P-1)個陽性樣本,其具體通過陽性信號兩組的共有樣本編號找出(P-1)+(P-2)+(P-3)+…+3+2+1個可能的樣本。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于樣本組合分析核酸序列的方法,其特征在于步驟b中每組混合樣本的核酸序列分析方法包括對單組樣本的分析和多組樣本的并行分析,分析技術(shù)包括桑格測序,焦測序,DNA芯片、熔點曲線、定量PCR、質(zhì)譜、色譜、電泳分析方法。
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