[發(fā)明專利]用于鑒定普通狗牙根和彎穗狗牙根的SRAP分子標記引物及其方法和應用

在審

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• 申請日: 2016-01-21
• 公開（公告）號: CN105420406A
• 公開（公告）日: 2016-03-23
• 發(fā)明（設計）人: 黃春瓊;劉國道;白昌軍
• 申請（專利權）人: 中國熱帶農業(yè)科學院熱帶作物品種資源研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 深圳市千納專利代理有限公司 44218
• 代理人: 馬慶文

技術領域

本發(fā)明涉及分子生物學DNA標記檢測技術領域，具體涉及一種用于鑒定普通狗牙根和彎穗狗牙根的SRAP分子標記引物及其方法和應用。

背景技術

狗牙根(CynodonRichard)又名百慕大草、鋪地草、咸沙草、鐵線草及絆根草，屬禾本科(Poaceae/Gramineae)畫眉草亞科(Chloridoideae)虎尾草族(Cynodonteae)狗牙根屬(CynodonRichard)C₄型多年生草本植物。它是世界暖季型草坪草中得到評用價值最好，在應用上也是最使用廣泛的草坪草之一，當然也是家畜的優(yōu)質飼料。狗牙根屬植物現當前全球共有9種和10變種，而在我國有2種和1變種，分別是普通狗牙根(Cynodondactylon)、彎穗狗牙根(Cynodonarcuatus)，變種是雙花狗牙根(Cynodondactylonvar.biflorusMerino)。在我國主要分布于黃河流域以南，近些年來北京等地區(qū)也有種植。狗牙根是比較優(yōu)秀草坪草，具有成坪快、耐修剪、耐踐踏、恢復力強、有很好色澤和密度等諸多優(yōu)點，可以用于高爾球場等運動草坪、城市綠植、公路護坡、公園觀賞等地方，具有很大的實用、經濟、生態(tài)價值。

隨著科學技術的蓬勃發(fā)展，生物技術也發(fā)生了翻天覆地的變化，這種變化為人們研究狗牙根遺傳多樣性、分子育種、種質資源鑒定等帶來了便捷，促使人們對于研究狗牙根遺傳基因的多態(tài)性到了一個新的領域。分子標記技術的應用和推廣為人們研究狗牙根遺傳多樣性提供了方法和科學依據，通過分子標記特異性基因可以直接篩選出不同品種狗牙根的優(yōu)良性狀，從而提高了狗牙根品種鑒別的真實性?？梢灶A測，DNA分子標記技術可以為狗牙根種質資源鑒定和選育優(yōu)良品種做出杰出貢獻。凌瑤等通過采用SRAP分子標記技術，對來自于我國的44份狗牙根和8份非洲狗牙根材料進行遺傳多樣性分析，表明選用的材料之間具有較大的遺傳差異。但是目前對于分布在我國的普通狗牙根和彎穗狗牙根尚無這方面的研究報道。

發(fā)明內容

本發(fā)明的目的在于解決現有技術中在狗牙根種質資源鑒定和選育優(yōu)良品種的不足，提供一種用于鑒定普通狗牙根和彎穗狗牙根的SRAP分子標記引物及其方法和應用。

本發(fā)明的第一個方面是提供一種SRAP分子標記引物，選自下述引物組合之一：E1M4、E1M5、E1M6、E1M7、E1M8、E2M3、E2M4、E2M5、E2M6、E2M7、E3M1、E3M3、E3M4、E3M6、E3M9、E4M1、E4M3、E4M4、E4M5、E4M6、E5M9、E6M1、E6M2、E6M3、E6M4、E6M7、E6M8、E6M9、E7M2、E7M3、E7M4、E7M5、E7M7、E10M9，其中，

E1為反向引物，序列如SEQIDNO：1所示；E2為反向引物，序列如SEQIDNO：2所示；E3為反向引物，序列如SEQIDNO：3所示；E4為反向引物，序列如SEQIDNO：4所示；E5為反向引物，序列如SEQIDNO：5所示；E6為反向引物，序列如SEQIDNO：6所示；E7為反向引物，序列如SEQIDNO：7所示；E10為反向引物，序列如SEQIDNO：10所示；M1為正向引物，序列如SEQIDNO：11所示；M2為正向引物，序列如SEQIDNO：12所示；M3為正向引物，序列如SEQIDNO：13所示；M4為正向引物，序列如SEQIDNO：14所示；M5為正向引物，序列如SEQIDNO：15所示；M6為正向引物，序列如SEQIDNO：16所示；M7為正向引物，序列如SEQIDNO：17所示；M8為正向引物，序列如SEQIDNO：18所示；M9為正向引物，序列如SEQIDNO：19所示。

優(yōu)選地，所述SRAP分子標記引物選自下述引物組合之一：E2M3、E2M4、E2M5、E2M7、E3M3、E3M6、E4M3、E4M4、E4M5、E4M6、E5M9、E6M1、E6M2、E6M4、E6M7、E6M8、E6M9、E7M3、E7M4、E7M5、E7M7、E10M9。

本發(fā)明的第二個方面是提供本發(fā)明第一個方面所述的任意一種SRAP分子標記引物在鑒定普通狗牙根和彎穗狗牙根中的應用。

本發(fā)明的第三個方面是提供一種利用SRAP分子標記引物組合鑒定普通狗牙根和彎穗狗牙根的方法：采用本發(fā)明第一個方面所述的任意一種SRAP分子標記引物，對普通狗牙根和彎穗狗牙根DNA進行擴增、檢測和分析。

其中，普通狗牙根和彎穗狗牙根DNA可采用本領域常規(guī)技術手段獲取。