[發明專利]一種與棉花海島棉纖維長度連鎖的分子標記

有效

• 申請號: 201610035568.6
• 申請日: 2016-01-19
• 公開（公告）號: CN105524999B
• 公開（公告）日: 2019-10-22
• 發明（設計）人: 石玉真;袁友祿;檀運娜;蘇威;馬留軍;孔令磊;劉愛英;李俊文;鞏萬奎;龔舉武;商海紅;陳婷婷;葛群
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院棉花研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04
• 代理公司: 北京知本村知識產權代理事務所 11039
• 代理人: 劉江良

本發明公開了一種與棉花纖維長度QTL/主效基因位點qFL?C13?1和qFL?C22?1連鎖的分子標記，qFL?C13?1和qFL?C22?1分別位于染色體C13和C22上。與qFL?C13?1緊密連鎖的分子標記為CGR5242₁₀₀，與qFL?C22?1連鎖的分子標記為NAU2977₁₅₀。利用本發明這些與棉花纖維長度QTL/主效基因位點連鎖的SSR標記進行輔助選擇可提高棉花纖維長度育種效率。

技術領域

本發明涉及棉花分子育種技術領域，具體涉及到一種與棉花海島棉纖維長度連鎖的分子標記及其應用。

背景技術

棉花是世界上重要的經濟作物，棉纖維是重要的紡織工業原料，棉花在我國國民經濟中占具重要地位。隨著紡織工業的快速發展和人民生活水平的不斷提高，對棉花纖維品質的要求也越來越高。纖維品質的育種已成為我國棉花育種的主要目標之一。纖維長度是纖維品質性狀的一項重要指標，培育纖維較長的品種是紡高檔紗和出高檔棉織品的要求之一，也是實現棉花機械化采收的一個重要要求。

海島棉纖維品質優良，但適應性差，產量低，而陸地棉產量高，適應性廣，但品質差(Percy et al.,2006)。因此挖掘海島棉的優異纖維品質基因，把海島棉優異纖維品質基因轉移到陸地棉背景中，對我國陸地棉纖維品質和產量同步改良具有重要的意義。

采用傳統的育種方法，每一世代的纖維品質選擇都需等到棉花吐絮后收取棉花軋花后進行纖維品質檢測后才能決定，而且纖維品質性狀受環境影響較大，使得表型選擇準確性差、周期長、效率低，導致品質育種進展緩慢。棉花的纖維品質性狀屬于多基因控制的數量性狀。主要纖維品質性狀與產量性狀之間存在顯著或不顯著負相關(潘家駒，等，1998)，給棉花纖維品質與產量的同步改良帶來了難度。

分子生物學以及數量性狀基因位點作圖方法的發展為棉纖維品質改良提供了有效手段。借助分子標記對目標性狀的基因型直接進行選擇，而不必考慮作物生長時期和發育條件，可在早期進行選擇，又能減少來自同一位點不同等位基因或不同位點的非等位基因間的相互干擾，有利于快速壘集目標基因，加速回交育種進程，克服不利性狀連鎖，極大地縮短了育種時間。在海島棉纖維品質性狀的基因挖掘方面，利用不同的陸海雜種群體進行連鎖圖譜的構建和重要纖維品質性狀的QTL檢測(如Jiang et al.1998；Paterson etal.2003；Mei et al.2004；Lin et al.2005；楊鑫雷等，2009,2015；He et al.2007；Lacapeet al.2005,2010；Yu et al.2013)，取得了很大研究進展，為纖維品質性狀的分子標記輔助選擇打下了良好的基礎，但QTLs或與之連鎖的分子標記已應用于分子標記輔助選擇育種中的不多。

前人研究中多數是利用分離群體(如F₂、BC₁)，遺傳背景復雜，或只在單個環境下檢測得到的結果，因此缺乏可靠性和穩定性，多環境穩定的QTL少，且有些研究最初的目的只是為了進行目標基因的定位，在實驗材料的選擇上沒有考慮和育種材料相結合，還很難應用到育種中。染色體片段代換系(又叫導入系，或漸滲系)，基因組中只含有少數供體親本的染色體片段，大部分遺傳背景與受體親本一致，減少了遺傳背景的干擾，是QTL檢測和研究的理想材料。本發明是利用染色體片段代換系篩選出多環境穩定的QTLs及其連鎖的標記，通過標記輔助選擇，得到纖維長度得到提高的單株系。

發明內容

本發明所要解決的技術問題是：為了克服傳統育種中表型選擇準確性差、效率低、周期長、成本高等許多缺點，解決纖維品質育種進展緩慢的問題，本發明提供一種來自纖維高優質材料海島棉海1與棉花纖維長度QTL/主效基因連鎖的分子標記，即：通過篩選來自纖維高優質材料海島棉海1中與纖維長度QTL/主效基因連鎖的SSR分子標記，進行DNA水平上的早期標記輔助選擇，提高育種效率。