[發(fā)明專利]一種質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理中譜峰位置檢測方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610031234.1 | 申請日: | 2016-01-18 |
| 公開(公告)號: | CN105718723B | 公開(公告)日: | 2018-01-16 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 田地;鄭瀛;范潤龍;龍濤;邱春玲;張玉海 | 申請(專利權(quán))人: | 吉林大學(xué) |
| 主分類號: | G06F19/00 | 分類號: | G06F19/00 |
| 代理公司: | 長春吉大專利代理有限責(zé)任公司22201 | 代理人: | 王立文 |
| 地址: | 130012 吉*** | 國省代碼: | 吉林;22 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 種質(zhì) 數(shù)據(jù)處理 中譜峰 位置 檢測 方法 | ||
1.一種質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理中譜峰位置檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:
Ⅰ、選擇一定尺度范圍對原始質(zhì)譜圖進(jìn)行連續(xù)小波變換,形成二維小波系數(shù)矩陣C(a,b),其中a為尺度參數(shù),b為位移參數(shù);
Ⅱ、在小波系數(shù)矩陣C(a,b)中均勻設(shè)置N個粒子,使粒子按照固定規(guī)則移動,逐漸聚集在局部極值點的位置,粒子移動規(guī)則如下:
粒子進(jìn)行t次移動后,粒子位置X(t)=(k,j),下一次移動后的位置X(t+1)=(k’,j’)由以下規(guī)則確定:
A、對于小波系數(shù)矩陣C(a,b),以b為水平方向,a為垂直方向,b的范圍為1,2,…,B,a的范圍為1,2,…,A;
B、粒子首先進(jìn)行垂直方向移動,如果2≤k≤A-1,那么k’=k+1和k’=k-1各取1/2的概率;如果粒子到達(dá)下邊界,即k=1,那么粒子向上移動一格,即k’=2;如果粒子到達(dá)上邊界,即k=A,那么粒子向下移動一格,即k’=A-1;
C、垂直移動完成后進(jìn)行水平方向移動,仍先判斷粒子是否處于左右邊界,即j=1或j=B,若處于邊界則粒子向內(nèi)移動一格,即j’=2或j’=B-1,否則各按1/2的概率準(zhǔn)備向左或向右移動一格,是否移動根據(jù)小波系數(shù)大小進(jìn)行判斷;粒子移動判斷標(biāo)準(zhǔn)如下:
①、如果C(k’,j’)>C(k,j)則粒子發(fā)生該移動,X(t+1)=(k’,j’);
②、如果C(k’,j’)≤C(k,j)則計算差值ΔC=|C(k’,j’)-C(k,j)|,設(shè)置閾值Temp,若ΔC<Temp,則發(fā)生該移動,即X(t+1)=(k’,j’),否則不動,即X(t+1)=(k,j);
③、隨移動次數(shù)增加,逐漸減小Temp,使Temp逐漸接近零;該方法類似模擬退火算法思想,隨移動次數(shù)增加,溫度降低,粒子趨于穩(wěn)定;
Ⅲ、按照粒子占據(jù)情況對小波系數(shù)矩陣中所有位置進(jìn)行度量,形成度量值矩陣,并采用噪聲閾值和對應(yīng)位置譜峰強(qiáng)度對度量值矩陣進(jìn)行修正,矩陣位置度量方式如下:
設(shè)t次移動后矩陣位置(k,j)的粒子個數(shù)為n(k,j)(t),粒子移動總次數(shù)為T,則矩陣位置初始度量值為:
度量值矩陣修正方法如下:
設(shè)閾值i0為噪聲點所產(chǎn)生的度量值,從上述初始度量值中減去閾值,并與原始譜圖譜峰強(qiáng)度S(j)作乘積形成最終的度量值矩陣:
I(k,j)=S(j)·(i(k,j)-i0)(2)
度量值矩陣中所有度量值均為非負(fù)實數(shù),上述度量方式中,初始度量值減去噪聲閾值i0后,若度量值小于零則將該值歸零,若噪聲閾值選擇得當(dāng),此時度量值矩陣將成為稀疏矩陣,從而有效突出小波系數(shù)矩陣中的局部極值點,降低后續(xù)脊點搜索難度;
Ⅳ、在修正后的度量值矩陣中進(jìn)行局部極大值搜索,并設(shè)置強(qiáng)度閾值過濾局部極值得到脊點;
Ⅴ、連接脊點形成脊線,設(shè)置脊線長度閾值,去除過短脊線;
Ⅵ、根據(jù)脊線確定譜峰位置,完成譜峰位置檢測,譜峰位置為脊線中度量值最大的脊點位置。
2.按照權(quán)利要求1所述的一種質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理中譜峰位置檢測方法,其特征在于,步驟Ⅰ中所述的一定尺度范圍a=1~Na,尺度間隔為指數(shù)間隔,最大尺度Na的確定方法包括以下步驟:
a、在所處理的譜圖中截取一個獨立的譜峰,選擇一個大的尺度范圍對譜峰進(jìn)行小波變換,觀察譜峰位置處小波系數(shù)隨尺度參數(shù)的變化曲線;
b、隨尺度參數(shù)增加,小波系數(shù)應(yīng)表現(xiàn)為先增大后減小的趨勢,若未出現(xiàn)該趨勢,則繼續(xù)增大尺度范圍進(jìn)行小波變換;
c、出現(xiàn)先增大后減小的趨勢后,選擇小波系數(shù)達(dá)到最大后的2-3個尺度點作為最大尺度Na。
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