[發(fā)明專利]一種基于代謝組學(xué)鑒別霍山米斛與霍山鐵皮石斛品種的方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201610029560.9 | 申請(qǐng)日: | 2016-01-15 |
| 公開(公告)號(hào): | CN105548404B | 公開(公告)日: | 2017-09-26 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 金青;焦春燕;孫時(shí)偉;蔡永萍;林毅;宋程;李姝妹;王燕 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) |
| 主分類號(hào): | G01N30/02 | 分類號(hào): | G01N30/02;G01N30/06 |
| 代理公司: | 合肥市上嘉專利代理事務(wù)所(普通合伙)34125 | 代理人: | 王偉 |
| 地址: | 230036 安徽*** | 國省代碼: | 安徽;34 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 代謝 鑒別 霍山 鐵皮 石斛 品種 方法 | ||
1.一種基于代謝組學(xué)鑒別霍山米斛與霍山鐵皮石斛品種的方法,包括如下步驟:
(1)石斛樣品的采集;
(2)石斛代謝組學(xué)樣品的制備;
(3)石斛樣品代謝產(chǎn)物的檢測(cè);
(4)代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的處理與分析;
所述步驟(2)的過程包括石斛樣品代謝物的提取及衍生化;
所述石斛樣品代謝物的提取步驟為:采用液氮研磨的方法將石斛樣品磨至粉末狀,每種石斛樣品取六次重復(fù);然后稱取100~150mg粉末狀石斛樣品置于10mL離心管中,加入1.5mL預(yù)冷至-20℃的甲醇,渦旋震蕩1min后,加入60μL的核糖醇作為甲醇/水相的內(nèi)標(biāo),再渦旋震蕩30s,然后用石臘膜封住離心管口,于40~45℃條件下超聲處理30min,8000rpm/min離心15~20min,取1mL上層溶液置于1.5mL離心管中,得到石斛樣品代謝物的甲醇/水相提取溶液;
所述石斛樣品代謝物的衍生化,具體步驟為:用氮?dú)獯蹈墒鷺悠反x物的甲醇/水相提取溶液, 加入60μL濃度20mg/mL鹽酸羥胺吡啶溶液,渦旋震蕩30s后40℃溫浴120min;隨后加入60μL含體積分?jǐn)?shù)1%TMCS 的BSTFA,密封后置37℃下反應(yīng)120min,即得所述石斛代謝組學(xué)樣品;
所述步驟(3)的檢測(cè)條件為:色譜條件:DB-5石英毛細(xì)管柱,毛細(xì)管柱規(guī)格30m × 250μm× 0.25μm;進(jìn)樣體積為1μL;分流進(jìn)樣,分流比為20:1;進(jìn)樣口溫度280℃;載氣為氦氣,流速1mL/min;程序升溫:初始溫度為100℃,保持2min,以 4℃/min 升溫到 260℃,保持1min,再以20℃/min 升溫到 280℃,保持3min;
質(zhì)譜條件:接口溫度和離子源溫度均為250℃;電子轟擊離子源;全掃描方式,電子能量70eV,質(zhì)量檢測(cè)范圍m/z 40-600;
所述步驟(4)代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的處理與分析包括:將步驟(3)獲得的霍山米斛與霍山鐵皮石斛GC-MS原始數(shù)據(jù)用Agilent MSD工作站打開,并轉(zhuǎn)換成CDF格式文件,然后導(dǎo)入R2.7.2軟件加載XCMS程序包進(jìn)行數(shù)據(jù)的預(yù)處理,獲得物質(zhì)的保留時(shí)間和峰面積數(shù)據(jù)文件;用內(nèi)標(biāo)物質(zhì)進(jìn)行數(shù)據(jù)的歸一化處理,歸一化處理后數(shù)據(jù)導(dǎo)入simca-p11.5軟件進(jìn)行多元統(tǒng)計(jì)學(xué)分析;
所述多元統(tǒng)計(jì)學(xué)分析的具體內(nèi)容為:選取PCA和OPLS-DA模型進(jìn)行主成分分析以及差異性代謝物篩選;對(duì)所獲得的差異性代謝物利用NIST11數(shù)據(jù)庫進(jìn)行鑒定,即獲得用于鑒定霍山米斛和霍山鐵皮石斛的特征性代謝產(chǎn)物。
2.如權(quán)利要求1所述的一種基于代謝組學(xué)鑒別霍山米斛與霍山鐵皮石斛品種的方法,其特征在于,所述步驟(1)中,石斛樣品的采集包括霍山米斛和霍山鐵皮石斛樣品的采集,所述樣品液氮速凍后放-70℃超低溫下保存。
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