[發(fā)明專利]一種DBAT突變酶D166HR363H及其應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610028306.7 | 申請日: | 2016-01-15 |
| 公開(公告)號: | CN105524892B | 公開(公告)日: | 2019-01-08 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 林俊芳;黃佳俊;郭麗瓊;尤琳烽;葉志偉 | 申請(專利權(quán))人: | 華南農(nóng)業(yè)大學(xué) |
| 主分類號: | C12N9/10 | 分類號: | C12N9/10;C12N15/54;C12N15/70;C12N1/21;C12P17/02 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 dbat 突變 d166hr363h 及其 應(yīng)用 | ||
本發(fā)明公開一種DBAT突變酶D166HR363H及其應(yīng)用。該突變酶是氨基酸序列為SEQ ID NO:2的DBAT酶的第166位氨基酸由Asp變?yōu)镠is,第363位氨基酸由Arg變?yōu)镠is;其氨基酸序列為SEQ ID NO:8。該突變酶在利用乙酰輔酶A的催化效率上比野生型酶提高了39倍,大大提高了乙酰輔酶A的使用率和產(chǎn)物巴卡亭Ⅲ的產(chǎn)量。同時(shí),為降低生產(chǎn)成本,本發(fā)明尋找了7種廉價(jià)的?;w,突變酶均能高效利用這些酰基供體,其中對乙酸乙烯酯的利用率提高了143倍,能作為替代昂貴的乙酰輔酶A用于制備巴卡亭Ⅲ。迄今為止,在生物合成巴卡亭Ⅲ的研究中,并未發(fā)現(xiàn)有以非植物輔酶類為?;w并體現(xiàn)高利用率的研究。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于生物分子催化領(lǐng)域,特別涉及一種DBAT酶(10-去乙?;涂ㄍII-10β乙酰基轉(zhuǎn)移酶)突變酶D166HR363H及其應(yīng)用。
背景技術(shù)
定制酶一直是生物化學(xué)家奮斗的目標(biāo)。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的逐漸成熟,對蛋白序列進(jìn)行任意修改,可以解讀酶的催化機(jī)理并繼續(xù)理性設(shè)計(jì)酶。這種理性設(shè)計(jì)可以是增加已有酶的性質(zhì),甚至是重新設(shè)計(jì)一個(gè)蛋白質(zhì)。
高催化活性酶是在生物產(chǎn)業(yè)中發(fā)揮重要潛能的關(guān)鍵所在,也是現(xiàn)代蛋白質(zhì)工程研究的主攻方向。新型催化劑的理性設(shè)計(jì)往往會(huì)拓展我們對蛋白生化特性的認(rèn)識,尤其是那些錯(cuò)誤少、時(shí)間使用合理的蛋白質(zhì)理性改造過程。目前已利用理性設(shè)計(jì)突變位點(diǎn)技術(shù)對天然酶蛋白的催化活性、抗氧化性、底物特異性、熱穩(wěn)定性以及改進(jìn)酶的別構(gòu)效應(yīng)等進(jìn)行了成功的改造(Kries et al.,2013)。然而,理性設(shè)計(jì)方法僅適用于三維結(jié)構(gòu)清楚、結(jié)構(gòu)和功能的相互關(guān)系也較清楚的酶。
目前理性設(shè)計(jì)的思路仍然主要是由Hellinga和Richards于1991年提出的給蛋白增加新的結(jié)合位點(diǎn)的觀點(diǎn)。實(shí)際操作中,第一步在蛋白分子內(nèi)引入新的功能域,第二步再進(jìn)行優(yōu)化(Feldmeier et al.,2013;Koga et al.,2012)。
酶活性中心是酶催化的核心部位,其特定的構(gòu)象不僅有助于底物結(jié)合,還能促進(jìn)高效的催化作用。因此對酶活性位點(diǎn)改造相較整體蛋白質(zhì)的改造能更為直接,更為顯著的提升酶的催化活性(Kiss et al.,2013)。但是,酶的活性中心需要十分精確的構(gòu)象調(diào)節(jié),它既需要一定的柔性去識別底物,完成催化反應(yīng),又需要一定的剛性維持合理的構(gòu)象,來保持良好的生物學(xué)活性;酶的活性中心保持著柔性與剛性間的微妙平衡,隨意對活性中心的突變,會(huì)導(dǎo)致酶的迅速失穩(wěn)或者失活(Hilvert,2013)。
隨著學(xué)者們對酶結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系認(rèn)知的逐步完善,計(jì)算生物學(xué)的迅猛發(fā)展,利用計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)進(jìn)化酶學(xué)性質(zhì)的方法也日趨成熟。利用計(jì)算機(jī)模擬的方法,可以快速鑒定與催化直接相關(guān)的不可突變的氨基酸和有可能提升酶活性的靶標(biāo)位點(diǎn),為蛋白質(zhì)工程改造提供快速的指導(dǎo)。
本發(fā)明通過合成生物學(xué)的手段,研究10-去乙酰巴卡亭Ⅲ乙酰基轉(zhuǎn)移酶的底物拓展和理性設(shè)計(jì)新酶,建立合成巴卡亭Ⅲ的新方法。本發(fā)明能通過高效制備巴卡亭Ⅲ從而極大的改善紫杉醇供不應(yīng)求的現(xiàn)狀。
發(fā)明內(nèi)容
為了克服現(xiàn)有技術(shù)的缺點(diǎn)與不足,本發(fā)明的目的首要在于提供一種DBAT突變酶D166HR363H。該DBAT突變酶D166HR363H比野生型DBAT酶具有更高的催化效率。
本發(fā)明的另一目的在于提供上述DBAT突變酶D166HR363H的應(yīng)用。
本發(fā)明的目的通過下述技術(shù)方案實(shí)現(xiàn):
本發(fā)明提供一種DBAT突變酶D166HR363H,是氨基酸序列為SEQ ID NO:2的DBAT酶的第166位氨基酸由天冬氨酸(Asp)變?yōu)榻M氨酸(His),第363位氨基酸由精氨酸(Arg)變?yōu)榻M氨酸(His)。
上述DBAT突變酶D166HR363H的氨基酸序列為SEQ ID NO:8,其編碼基因的核苷酸序列為SEQ ID NO:7。
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