[發明專利]測序對照

在審

• 申請號: 201580068605.7
• 申請日: 2015-12-15
• 公開（公告）號: CN107250356A
• 公開（公告）日: 2017-10-13
• 發明（設計）人: T.默瑟
• 申請（專利權）人: 加文醫學研究所
• 主分類號: C12N15/00
• 分類號: C12N15/00;C12N15/11;C12Q1/68;C12N15/01
• 代理公司: 北京市柳沈律師事務所11105
• 代理人: 張文輝

1.包含人工多核苷酸序列的人工染色體，其中所述人工多核苷酸序列的任何片段與任何已知的天然存在的基因組序列是能區分的。

2.權利要求1的人工染色體，其中所述人工多核苷酸序列的任何1,000個連續的核苷酸與相同長度的任何已知天然存在的基因組序列具有小于100％的序列同一性。

3.權利要求1的人工染色體，其中所述人工多核苷酸序列的任何100個連續的核苷酸與相同長度的任何已知天然存在的基因組序列具有小于100％的序列同一性。

4.權利要求1的人工染色體，其中所述人工多核苷酸序列的任何21個連續的核苷酸與相同長度的任何已知天然存在的基因組序列具有小于100％的序列同一性。

5.前述權利要求中任一項的人工染色體，其中所述人工多核苷酸序列包含選自下組的天然存在的真核染色體的任何一個或多個特征：基因座、CpG島、移動元件(mobile elements)、重復多核苷酸特征(repetitive polynucleotide features)、小規模遺傳變異和大規模遺傳變異。

6.權利要求5的人工染色體，其中：

i)所述人工多核苷酸序列包含多個基因座(multiple gene loci)；

ii)所述重復多核苷酸特征包含下列任何一個或多個：末端重復、串聯重復、反向重復和散在重復(interspersed repeats)；

iii)所述基因座包含免疫受體基因座；

iv)所述小規模遺傳變異包含一個或多個SNP、一個或多個插入、一個或多個缺失、一個或多個微衛星和/或多個核苷酸多態性；和/或

v)所述大規模遺傳變異包含一個或多個缺失、一個或多個重復、一個或多個拷貝數變體、一個或多個插入、一個或多個倒位和/或一個或多個易位。

7.權利要求1至4中任一項的人工染色體，其包含天然存在的原核染色體的一個或多個特征。

8.前述權利要求中任一項的人工染色體的片段，其包含所述人工多核苷酸序列的20至10,000,000個連續的核苷酸。

9.權利要求8的片段，其是RNA片段或DNA片段。

10.人工多核苷酸序列，其包含連結的(conjoined)權利要求8的兩個或更多個片段以形成連續的多核苷酸序列。

11.權利要求10的人工多核苷酸序列，其是RNA或DNA多核苷酸序列。

12.載體，其包含權利要求1至7中任一項的人工染色體的DNA片段，所述片段包含所述人工多核苷酸序列的20至10,000,000個連續的核苷酸。

13.載體，其包含權利要求10的人工多核苷酸序列，所述人工多核苷酸序列是DNA多核苷酸序列。

14.制備權利要求8或權利要求9的片段的方法，所述方法包含通過內切核酸酶消化從權利要求12的載體切出所述片段，擴增或轉錄包含于權利要求12的載體內的所述DNA片段。

15.制備權利要求10或權利要求11的人工多核苷酸序列的方法，所述方法包含通過內切核酸酶消化從權利要求13的載體切出人工多核苷酸序列，擴增，或轉錄包含于權利要求13的載體內的所述人工多核苷酸序列。

16.權利要求1至7中任一項的人工染色體和/或權利要求8或權利要求9的片段和/或權利要求10或權利要求11的人工多核苷酸序列在校準多核苷酸測序過程中的用途。

17.校準多核苷酸測序過程的方法，其包括：

i)向樣品添加如權利要求8或權利要求9中定義的一個或多個片段和/或如權利要求10或權利要求11中定義的一個或多個人工多核苷酸序列，所述樣品包含要測定的目標多核苷酸序列；

ii)測定所述目標多核苷酸的序列；

iii)測定如權利要求8或權利要求9中定義的一個或多個片段的序列和/或測定如權利要求10或權利要求11中定義的一個或多個人工多核苷酸序列的序列；并且

iv)將iii)中測定的序列與所述片段和/或所述人工多核苷酸序列的原始序列比較，所述原始序列存在于如權利要求1至7中任一項定義的人工染色體中；

其中在iii)中的序列測定的準確性用于校準ii)中的序列測定。