[發明專利]人4-磷酸銜接蛋白2糖脂轉移蛋白樣域的晶體結構

有效

• 申請號: 201580049967.1
• 申請日: 2015-07-23
• 公開（公告）號: CN107074971B
• 公開（公告）日: 2021-11-02
• 發明（設計）人: M·梅亞潘;M·A·德馬泰斯
• 申請（專利權）人: 夏爾人類遺傳性治療公司;泰萊托恩基金會
• 主分類號: C07K19/00
• 分類號: C07K19/00;G16B15/00;G16B5/00
• 代理公司: 北京商專永信知識產權代理事務所(普通合伙) 11400
• 代理人: 鄔玥;葛強

1.一種識別結合磷脂酰肌醇4-磷酸銜接蛋白-2(FAPP2)的化合物的方法，其包括使用如說明書表2中所示的至少構成FAPP2底物結合口袋的氨基酸的原子坐標來計算識別結合FAPP2的化合物。

2.一種識別結合磷脂酰肌醇4-磷酸銜接蛋白-2(FAPP2)的化合物的方法，其包括

a)提供一套如說明書表3中所示的至少FAPP2的GLTP域的原子坐標，和

b)使用所述坐標計算識別結合FAPP2的化合物。

3.權利要求1或2所述的方法，其中所述化合物結合所述FAPP2的底物結合口袋或者結合所述FAPP2的底物結合口袋的毗鄰區。

4.權利要求1或2所述的方法，其中所述化合物是FAPP2的抑制劑。

5.權利要求4所述的方法，其中所述化合物是FAPP2的底物。

6.權利要求1、2和5任一項所述的方法，其中所述化合物對FAPP2具有特異性。

7.權利要求1、2和5任一項所述的方法，其中所述化合物對FAPP2的GLTP具有特異性。

8.權利要求1、2和5任一項所述的方法，其中所述化合物是小分子。

9.權利要求1、2和5任一項所述的方法，其中所述計算識別包括化合物庫識別所述化合物或者在數據庫中識別所述化合物。

10.權利要求1、2和5任一項所述的方法，進一步包括測試所述經識別化合物對FAPP2多肽的結合。

11.權利要求10所述的方法，其中所述結合化合物的測試包括測試所述結合化合物調節所述FAPP2多肽的活性的能力。

12.權利要求11所述的方法，其中對所述結合化合物進行測試是使用生物測定以確定所述結合化合物是否：

a)調節所述FAPP2多肽的轉移活性；

b)調節所述FAPP2多肽的穩定性；和/或

c)調節FAPP2多肽的胞內運輸。

13.權利要求12所述的方法，其中所述結合化合物降低FAPP2的所述轉移活性或穩定性，或者減少存在于高爾基體中的FAPP2量。

14.一種設計、選擇和/或優化結合FAPP2的化合物的方法，其包括：

a)提供一套如說明書表2中所示的至少構成FAPP2底物結合口袋的氨基酸的原子坐標，和

b)通過在所述化合物和由所述原子坐標生成的全部或部分三維結構信息之間進行擬合運算以計算設計、選擇和/或優化所述化合物。

15.一種設計、選擇和/或優化結合FAPP2的化合物的方法，其包括：

a)提供一套如說明書表3中所示的至少FAPP2的GLTP域的原子坐標，和

b)通過在所述化合物和由所述原子坐標生成的全部或部分三維結構信息之間進行擬合運算以計算設計、選擇和/或優化所述化合物。

16.權利要求14或15所述的方法，其中所述計算識別包括電腦模擬設計結合FAPP2的結合化合物。

17.權利要求16所述的方法，其中從已知化合物設計所述結合化合物。