[發(fā)明專利]針對化療靶標(biāo)的SRM測定

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201580045634.1
• 申請日: 2015-07-01
• 公開（公告）號: CN107110840A
• 公開（公告）日: 2017-08-29
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 大衛(wèi)·B·克里茨曼;托德·哈姆布拉夫;史諾·塞帕洛姆比爾;遼衛(wèi)禮;安恩京
• 申請（專利權(quán)）人: 愛科譜迅病理研究公司
• 主分類號: G01N33/48
• 分類號: G01N33/48;G01N33/50;G01N31/00;H01J49/00
• 代理公司: 北京潤平知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司11283
• 代理人: 劉依云,嚴(yán)政

1.一種測量生物樣品中ENT1、ERCC1、FOLR1、RRM1、TUBB3、TOPO1和/或TOPO2A蛋白質(zhì)水平的方法，包括使用質(zhì)譜檢測和/或定量來自所述生物樣品的蛋白質(zhì)消化物中一種或多種修飾的和/或未修飾的ENT1、ERCC1、FOLR1、RRM1、TUBB3、TOPO1和/或TOPO2A片段肽的含量；和計算所述樣品中修飾的或未修飾的ENT1、ERCC1、FOLR1、RRM1、TUBB3、TOPO1和/或TOPO2A蛋白質(zhì)的水平；且

其中所述含量是相對含量或絕對含量。

2.權(quán)利要求1所述的方法，其進(jìn)一步包括在檢測和/或定量一種或多種修飾的或未修飾的ENT1、ERCC1、FOLR1、RRM1、TUBB3、TOPO1和/或TOPO2A蛋白質(zhì)片段肽之前對所述蛋白質(zhì)消化物進(jìn)行分級的步驟。

3.權(quán)利要求1所述的方法，其中所述生物樣品的所述蛋白質(zhì)消化物通過Liquid Tissue^TM方案制備。

4.權(quán)利要求1所述的方法，其中所述蛋白質(zhì)消化物包括蛋白酶消化物。

5.權(quán)利要求1所述的方法，其中所述質(zhì)譜包括串聯(lián)質(zhì)譜、離子阱質(zhì)譜、三重四極質(zhì)譜、MALDI-TOF質(zhì)譜、MALDI質(zhì)譜和/或飛行時間質(zhì)譜。

6.權(quán)利要求1-5中任一項所述的方法，其中所述ENT1、ERCC1、FOLR1、RRM1、TUBB3、TOPO1和/或TOPO2A蛋白質(zhì)片段肽包含以下序列所示的氨基酸序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11、SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：21、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：23、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：27、SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29、SEQ ID NO：30、SEQ ID NO：31、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41、SEQ ID NO：42、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：47、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：49、SEQ ID NO：50、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：52、SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：54、SEQ ID NO：55、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：57、SEQ ID NO：58、SEQ ID NO：59、SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：62、SEQ ID NO：63、SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：65、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：68、SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：71、SEQ ID NO：72、SEQ ID NO：73、SEQ ID NO：74、SEQ ID NO：75、SEQ ID NO：76、SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：78、SEQ ID NO：79、SEQ ID NO：80、SEQ ID NO：81、SEQ ID NO：82、SEQ ID NO：83、SEQ ID NO：84、SEQ ID NO：85、SEQ ID NO：86、SEQ ID NO：87、SEQ ID NO：88、SEQ ID NO：89、SEQ ID NO：90、SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：92、SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：94、SEQ ID NO：95、SEQ ID NO：96、SEQ ID NO：97、SEQ ID NO：98、SEQ ID NO：99、SEQ ID NO：100、SEQ ID NO：101、SEQ ID NO：102和SEQ ID NO：103。