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[發明專利]用于診斷腎異體移植物纖維化和排異風險的方法有效

專利信息
申請號: 201580045235.5 申請日: 2015-06-26
公開(公告)號: CN106661634B 公開(公告)日: 2021-03-12
發明(設計)人: B·墨菲;張維嘉 申請(專利權)人: 西奈山伊坎醫學院
主分類號: C12Q1/6837 分類號: C12Q1/6837;C12Q1/6883;G06F17/18
代理公司: 北京林達劉知識產權代理事務所(普通合伙) 11277 代理人: 劉新宇;李茂家
地址: 美國*** 國省代碼: 暫無信息
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 用于 診斷 異體 移植 纖維化 排異 風險 方法
【權利要求書】:

1.一種用于診斷腎異體移植物受者發生異體移植物纖維化和異體移植物失功的風險的方法,所述方法包括:

(a)從受者獲得血液樣品;

(b)測定所述樣品中四種微小RNA的表達水平,其中所述微小RNA是hsa-miR-128、hsa-miR-29b-3p、hsa-miR-302b-3p和hsa-miR-192-5p;

(e)將四種微小RNA的表達水平與每種微小RNA的對照水平比較;并且

(f)如果所述微小RNA樣品的表達水平相對于每種微小RNA的對照水平改變,則將受者診斷為處于發生異體移植物纖維化和異體移植物失功的風險。

2.根據權利要求1所述的方法,其還包括:

(i)如果基于從訓練集確定的概率評分截止值,hsa-miR-128和hsa-miR-302b-3p的表達水平相對于每種微小RNA的對照水平增加并且hsa-miR-29b-3p和hsa-miR-192-5p的表達水平相對于每種微小RNA的對照水平減少,則將受者診斷為處于發生異體移植物纖維化和異體移植物失功的高風險;或

(ii)如果基于從訓練集確定的概率評分截止值,hsa-miR-128和hsa-miR-302b-3p的表達水平相對于每種微小RNA的對照水平減少并且hsa-miR-29b-3p和hsa-miR-192-5p的表達水平相對于每種微小RNA的對照水平增加,則將受者診斷為處于發生異體移植物纖維化和異體移植物失功的低風險。

3.根據權利要求1或2中任一項所述的方法,其中測定表達水平包括:

從血液樣本分離mRNA;

從mRNA合成cDNA;并且

測量來自樣品的微小RNA hsa-miR-128、hsa-miR-29b-3p、hsa-miR-302b-3p和hsa-miR-192-5p的表達水平。

4.根據權利要求1-3中任一項所述的方法,其中診斷受者的風險包括通過將受者的樣品中測定的表達水平應用于懲罰邏輯回歸擬合模型,計算受者的風險。

5.根據權利要求4所述的方法,其中從中將計算出風險的懲罰邏輯回歸擬合模型利用下式:

<mrow><mi>log</mi><mfrac><mrow><mi>p</mi><mrow><mo>(</mo><mi>x</mi><mo>)</mo></mrow></mrow><mrow><mn>1</mn><mo>-</mo><mi>p</mi><mrow><mo>(</mo><mi>x</mi><mo>)</mo></mrow></mrow></mfrac><mo>=</mo><msub><msup><mi>&beta;</mi><mo>*</mo></msup><mrow><mn>0</mn><mo>+</mo></mrow></msub><msub><msup><mi>&beta;</mi><mo>*</mo></msup><mn>1</mn></msub><msub><mi>g</mi><mn>1</mn></msub><mo>+</mo><msub><msup><mi>&beta;</mi><mo>*</mo></msup><mi>i</mi></msub><msub><mi>g</mi><mi>i</mi></msub><mo>+</mo><mn>....</mn><mo>+</mo><msub><msup><mi>&beta;</mi><mo>*</mo></msup><mn>4</mn></msub><msub><mi>g</mi><mn>4</mn></msub></mrow>

其中p(x)是發生纖維化的概率,β*i是懲罰系數并且gi是微小RNA i的表達值。

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