[發明專利]與黃瓜短果把緊密連鎖的兩個SNP標記及其應用

在審

• 申請號: 201510875160.5
• 申請日: 2015-12-03
• 公開（公告）號: CN105349538A
• 公開（公告）日: 2016-02-24
• 發明（設計）人: 許學文;瞿文琴;陳學好;齊曉花;徐強
• 申請（專利權）人: 揚州大學
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 南京知識律師事務所 32207
• 代理人: 盧亞麗

1.兩個與黃瓜短果把基因緊密連鎖的SNP標記，其特征在于，是Chr4SNP-fs01和Chr4SNP-fs02，其中Chr4SNP-fs01位于黃瓜基因組第4號染色體15,735,913處，Chr4SNP-fs01處堿基為A的黃瓜為短果把，為G的黃瓜為長果把；Chr4SNP-fs02位于黃瓜基因組第4號染色體16,650,897處；

Chr4SNP-fs02處堿基為G的黃瓜為短果把，為A的黃瓜為長果把。

2.Chr4SNP-fs01和Chr4SNP-fs02作為與黃瓜短果把基因緊密連鎖的SNP標記的應用，其中Chr4SNP-fs01位于黃瓜基因組第4號染色體15,735,913處，Chr4SNP-fs01處堿基為A的黃瓜為短果把，為G的黃瓜為長果把；Chr4SNP-fs02位于黃瓜基因組第4號染色體16,650,897處；Chr4SNP-fs02處堿基為G的黃瓜為短果把，為A的黃瓜為長果把。

3.一組用于用于檢測權利要求1所述與黃瓜短果把基因相關的SNP標記的引物對，其特征在于：包括Chr4SNP-fs01的引物對：

上游引物5′-GGGCATGTATCTCTCTACCATGATT-3′，

反向引物5′-TCCCAAAAGCAAGACAAG-3′；

Chr4SNP-fs02的引物對：

正向引物5′-ACAAGTCAGTCGATCAAA-3′，

反向引物5′-TTTGCAAGCAAACATTTTTCTCTTT-3′。

4.權利要求1所述的SNP及衍生的dCAPS引物在黃瓜短果把分子標記輔助育種中的應用。

5.如權利要求4所述的應用，其特征在于，包括以下步驟：

1)提取待檢測黃瓜基因組DNA；

2)以待檢測黃瓜基因組DNA為模板，利用權利要求3所述引物對，進行PCR擴增反應；

3)使用HindⅢ限制性內切酶酶切Chr4SNP-fs01引物對所擴增的PCR產物，使用MseI限制性內切酶酶切Chr4fs-pm02引物對所擴增的PCR產物酶切；

4)經上述酶酶切后電泳，若條帶沒有被HindⅢ和MseI酶切，則為長果把品系；若條帶被HindⅢ和MseI酶切則為短果把品系。