[發(fā)明專利]一種腦纖維稀疏重建的方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201510845712.8 | 申請日: | 2015-11-27 |
| 公開(公告)號: | CN105488757B | 公開(公告)日: | 2018-09-18 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 馮遠(yuǎn)靜;徐田田;張軍;吳燁;李斐;高成鋒 | 申請(專利權(quán))人: | 浙江工業(yè)大學(xué) |
| 主分類號: | G06T3/40 | 分類號: | G06T3/40 |
| 代理公司: | 杭州斯可睿專利事務(wù)所有限公司 33241 | 代理人: | 王利強(qiáng) |
| 地址: | 310014 浙江省杭州市*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 纖維 稀疏 重建 方法 | ||
1.一種腦纖維稀疏重建的方法,其特征在于:所述方法包括以下步驟:
(1)讀取腦部磁共振數(shù)據(jù),獲取施加梯度方向為g的磁共振擴(kuò)散信號S(g),未施加梯度方向的磁共振擴(kuò)散信號S0及梯度方向數(shù)據(jù),對采集的數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,選取所需的感興趣區(qū)域,并計算該區(qū)域的擴(kuò)散衰減信號S(g)/S0;
(2)利用Richardson-Lucy迭代算法將感興趣區(qū)域內(nèi)的每個體素的擴(kuò)散衰減信號S(g)/S0逐個建模為具有橢球形分布的模型,并增加l1范數(shù)正則化對腦纖維進(jìn)行稀疏重建,建模過程如下:
2.1)體素微結(jié)構(gòu)建模:將擴(kuò)散衰減信號S(g)/S0假設(shè)為沿重建向量v的信號響應(yīng)核函數(shù)H(v,g)與纖維方向分布函數(shù)F(v)在球面S2上的卷積:
其中,H(v,g)代表混合響應(yīng)核函數(shù),它利用腦白質(zhì)的單條纖維響應(yīng)核函數(shù)和腦灰質(zhì)中的各向同性響應(yīng)核函數(shù)組成,g={gi∈R1×3|i=1,...,n}為擴(kuò)散梯度方向向量,v={vj∈R1×3|j=1,...,m}為重建向量,n和m分別為擴(kuò)散梯度方向向量和重建向量的個數(shù),R是實數(shù)集,其數(shù)學(xué)模型為:
H(v,g)=faniHani+fisotHisot
其中,fani,fisot分別是腦白質(zhì)組織和腦灰質(zhì)組織的體積分?jǐn)?shù);分別表示體素中各向異性響應(yīng)核函數(shù)和各向同性響應(yīng)核函數(shù),各向異性響應(yīng)核函數(shù)Hani是由沿著m個重建方向v的響應(yīng)核組成,每個響應(yīng)核都是相同的圓餅狀,只是他們的分布方向不同;而各向同性響應(yīng)核函數(shù)也是由沿著m個重建方向v的響應(yīng)核組成,但其每個響應(yīng)核的形狀都是圓球狀;b為擴(kuò)散敏感系數(shù);表示擴(kuò)散沿一個主方向進(jìn)行,在各個方向其擴(kuò)散程度一致,其中α、β代表纖維擴(kuò)散程度;
2.2)基于Richardson-Lucy迭代算法的數(shù)學(xué)模型:
擴(kuò)散加權(quán)磁共振信號有n個擴(kuò)散梯度方向,并且沿著m個重建向量進(jìn)行重建,則其數(shù)學(xué)模型為:
其中,k為迭代次數(shù),F(xiàn)(v)(k)是在當(dāng)前體素的第k次迭代得到的長度為m×1的列向量,表示沿著m個重建方向均勻分布在球面上的纖維方向分布函數(shù),F(xiàn)(v)(k+1)是當(dāng)前體素的第k次迭代得到纖維方向分布函數(shù),H即為所述的混合響應(yīng)核函數(shù)H(v,g),S是在當(dāng)前體素的包含HARDI信號的長度為n×1的列向量,I0和I1分別是第一類零階和第一類一階修正貝塞爾函數(shù),σ2是信號S的方差;
2.3)腦纖維的稀疏重建
用一個完備字典基Φ來表示纖維方向分布函數(shù),即:F(v)=Φ×c;所得到的系數(shù)c恰好是稀疏的,在此基礎(chǔ)上,得到了新的Richardson-Lucy算法:
其中c(k)是在當(dāng)前體素的第k次迭代得到的長度為m×1的系數(shù)矩陣,c(k+1)是第k+1次迭代得到的系數(shù)矩陣;
2.4)基于Richardson-Lucy迭代算法的l1正則化稀疏重建模型如下:
增加了l1稀疏正則化項,其數(shù)學(xué)模型為:
其中,L1(k)是第k次迭代的l1正則化項,即是長度為m的列向量,其第i行的元素可以用下式計算得到:
其中,是系數(shù)矩陣c(k)的第i行向量在第k次迭代時的梯度方向,和分別表示系數(shù)矩陣c(k)的第i行向量對x,y和z方向的偏導(dǎo),‖▽[c(k)]i‖2是▽[c(k)]i的二范數(shù),λ是正則化參數(shù);
(3)通過迭代計算得到纖維方向分布函數(shù)的系數(shù)c,纖維方向分布函數(shù)的系數(shù)c計算方法包括以下步驟:
3.1)在單位球面上均勻采樣m個離散的點(diǎn),以球心為原點(diǎn)獲取這m個重建向量v,計算纖維響應(yīng)核函數(shù)H(v,g)的值,得到n×m的輪換矩陣;
3.2)利用模擬數(shù)據(jù)模擬仿真,設(shè)置迭代初值,令c(0)為各項同性的纖維方向分布函數(shù)系數(shù),其振幅設(shè)置為1,通過實驗選定λ值;
3.3)利用無正則項的Richardson-Lucy算法對感興趣區(qū)的體素進(jìn)行預(yù)處理,得到每個體素的纖維方向分布函數(shù),作為正則化Richardson-Lucy算法的初始纖維方向分布函數(shù)值;
3.4)設(shè)置迭代終止條件:一是迭代次數(shù);一是迭代誤差,令迭代誤差為:
所以,迭代次數(shù)大于最佳迭代次數(shù)或者迭代誤差NMSE<ε作為迭代終止條件;
3.5)通過迭代,得到最優(yōu)纖維方向分布函數(shù)系數(shù)cz,其是m列的列向量,再利用完備字典基Φ和最優(yōu)纖維方向分布函數(shù)系數(shù)cz重構(gòu)腦纖維方向分布函數(shù)F=Φ×cz;并利用MATLAB仿真擬合纖維方向分布函數(shù)F的分布;
3.6)在數(shù)學(xué)軟件MATLAB中對纖維方向分布函數(shù)F進(jìn)行三維成像,并通過搜索纖維方向分布函數(shù)值中的極值點(diǎn)來獲取纖維的主方向。
2.如權(quán)利要求1所述的一種腦纖維稀疏重建的方法,其特征在于:所述步驟(1)中,所述預(yù)處理包括高頻濾波、空間降噪和去除線性漂移。
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