[發明專利]基于泊松分布模型的蛋白質二級質譜鑒定方法

有效

• 申請號: 201510799996.1
• 申請日: 2015-11-19
• 公開（公告）號: CN105823883B
• 公開（公告）日: 2017-07-18
• 發明（設計）人: 陳曉舟;肖傳樂;朱思敏;陳君華
• 申請（專利權）人: 云南民族大學
• 主分類號: G01N33/68
• 分類號: G01N33/68
• 代理公司: 廣州天河恒華智信專利代理事務所(普通合伙)44299
• 代理人: 張培祥

1.一種基于泊松分布模型的蛋白質二級質譜鑒定方法，其特征在于，包括如下步驟：

(1)虛擬酶解蛋白質數據庫序列，并根據肽段的質量數對酶解后的肽段建立肽段數據庫和肽段數據庫索引；

(2)根據待分析實驗圖譜中母離子的核質比在步驟(1)所述的肽段數據庫中找出符合要求的候選肽段，將選出符合要求的候選肽段作為理論圖譜；

(3)對待分析實驗圖譜進行去同位素峰和去噪處理；

(4)將步驟(3)中的待分析實驗圖譜和步驟(2)中每張候選肽段的理論圖譜進行匹配打分，選擇得分最高的候選肽段作為本次實驗圖譜的鑒定結果；

所述步驟(4)將待分析實驗圖譜和理論圖譜進行匹配打分包括：基于泊松分布的連續匹配打分，基于泊松分布的b、y離子的匹配打分，具體如下：

1)基于泊松分布的連續匹配打分：

$S_1=-\lg \left(\frac{{\left(0.1789k_1\right)}^{(K_1+\[0.1789k_1\]+1)}\·l^{-0.1789k_1}}{(K_1+\[0.1789k_1\]+1)!}\right)+\lg \left(\frac{{\left(0.1789k_1\right)}^{(\[0.1789k_1\]+1)}\·l^{-0.1789k_1}}{(\[0.1789k_1\]+1)!}\right)$

其中k₁是實驗圖譜匹配數，K₁是實驗圖譜連續匹配上的個數，S₁是連續匹配的得分，0.1789是隨機匹配的概率值，等于實際連續錯誤匹配數除以理論連續錯誤匹配數；

2)基于泊松分布的b、y離子的匹配打分：

$S_2=-\lg \left(\frac{{\left(0.2110k_1\right)}^{(K_2+\[0.2110k_1\]+1)}\·l^{-0.2110k_1}}{(K_2+\[0.2110k_1\]+1)!}\right)+\lg \left(\frac{{\left(0.2110k_1\right)}^{(\[0.2110k_1\]+1)}\·l^{-0.2110k_1}}{(\[0.2110k_1\]+1)!}\right)$

其中K₂是實驗圖譜和理論圖譜中b/y離子的匹配個數，S₂是b/y匹配的得分，0.2110是隨機匹配的概率，等于實際錯誤匹配數除以理論錯誤匹配數；

3)基于泊松分布模型的總的打分：

$S\_Pep=(S_1+S_2)*\frac{1+\underset{i=1}{\overset{K}{\Σ}}{\mathrm{Pr}}_i}{1+K\×0.155}$

(5)針對所有實驗的鑒定結果進行整體的假陽性控制。