[發(fā)明專利]一個與陸地棉早熟性狀相關的SNP位點及其應用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201510730586.1 | 申請日： | 2015-11-02 |
| 公開（公告）號： | CN105238866A | 公開（公告）日： | 2016-01-13 |
| 發(fā)明（設計）人： | 喻樹迅;宿俊吉;范術麗;龐朝友;魏恒玲;王彩香;宋美珍;李黎貝;趙樹琪 | 申請（專利權）人： | 中國農(nóng)業(yè)科學院棉花研究所 |
| 主分類號： | C12Q1/68 | 分類號： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京紀凱知識產(chǎn)權代理有限公司 11245 | 代理人： | 關暢;何葉喧 |
| 地址： | 455000 *** | 國省代碼： | 河南;41 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一個 陸地棉 早熟 性狀 相關 snp 及其 應用 | ||
1.一種鑒定或輔助鑒定陸地棉成熟性狀的方法，包括如下步驟：
檢測待測陸地棉的基因組DNA中基于G1001ASNP位點的基因型，如果為AA純合型或AG雜合型、待測陸地棉為候選的具有早熟性狀的陸地棉，如果為GG純合型、待測陸地棉為候選的具有晚熟性狀的陸地棉；
所述G1001ASNP位點為序列表的序列1自5’末端第1001位核苷酸。
2.如權利要求1所述的方法，其特征在于：
所述早熟性狀為如下(a1)至(a6)中的一種或幾種的組合：
(a1)全生育期小于120天；
(a2)苗蕾期小于65天；
(a3)花鈴期小于50天；
(a4)第一果枝位小于6個葉位數(shù)；
(a5)第一果枝位高度小于22厘米；
(a6)霜前花率為70％以上；
所述晚熟性狀為如下(b1)至(b6)中的一種或幾種的組合：
(b1)全生育期120天以上；
(b2)苗蕾期65天以上；
(b3)花鈴期50天以上；
(b4)第一果枝位6個葉位數(shù)以上；
(b5)第一果枝位高度為22厘米以上；
(b6)霜前花率為小于70％。
3.如權利要求1或2所述的方法，其特征在于：所述方法中，檢測待測陸地棉的基因組DNA中基于G1001ASNP位點的基因型的方法為：提取待測陸地棉的基因組DNA，PCR擴增含有所述G1001ASNP位點的靶區(qū)域，獲得基于G1001ASNP位點的基因型。
4.如權利要求3所述的方法，其特征在于：所述PCR擴增采用的引物對由引物F和引物R組成；所述引物F的核苷酸序列如序列表的序列2所示，所述引物R的核苷酸序列如序列表的序列3所示。
5.一種篩選具有早熟性狀的陸地棉的方法，包括如下步驟：按照權利要求1至4中任一所述的方法鑒定待測陸地棉的成熟性狀，篩選具有早熟性狀的陸地棉。
6.一種篩選具有晚熟性狀的陸地棉的方法，包括如下步驟：按照權利要求1至4中任一所述的方法鑒定待測陸地棉的成熟性狀，篩選具有晚熟性狀的陸地棉。
7.由引物F和引物R組成的引物對；所述引物F的核苷酸序列如序列表的序列2所示，所述引物R的核苷酸序列如序列表的序列3所示。
8.含有權利要求7所述引物對的試劑盒。
9.一個與陸地棉成熟性狀相關的SNP位點，為序列表的序列1自5’末端第1001位核苷酸，該第1001位核苷酸為A或G；
所述成熟性狀為全生育期性狀和/或苗蕾期性狀和/或花鈴期性狀和/或第一果枝位性狀和/或第一果枝位高度性狀和/或霜前花率性狀。
10.一種與陸地棉成熟性狀相關的含有權利要求1中所述SNP位點的DNA片段，其特征在于：該DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列1所示；
所述成熟性狀為全生育期性狀和/或苗蕾期性狀和/或花鈴期性狀和/或第一果枝位性狀和/或第一果枝位高度性狀和/或霜前花率性狀。
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